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Institut für Medizinische Mikrobiologie, Virologie und Hygiene

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Publikationen

  1. 2021

  2. Prospective postmortem evaluation of 735 consecutive SARS-CoV-2-associated death cases

    Fitzek, A., Schädler, J., Dietz, E., Ron, A., Gerling, M., Kammal, A. L., Lohner, L., Falck, C., Möbius, D., Goebels, H., Gerberding, A-L., Schröder, A. S., Sperhake, J-P., Klein, A., Fröb, D., Mushumba, H., Wilmes, S., Anders, S., Kniep, I., Heinrich, F., Langenwalder, F., Meißner, K., Lange, P., Zapf, A., Püschel, K., Heinemann, A., Glatzel, M., Matschke, J., Aepfelbacher, M., Lütgehetmann, M., Steurer, S., Thorns, C., Edler, C. & Ondruschka, B., 29.09.2021, in: SCI REP-UK. 11, 1, S. 19342

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  3. Complete genome sequencing and molecular characterization of SARS-COV-2 from COVID-19 cases in Alborz province in Iran

    Kaffashi, A., Huang, J., Bairami, A., Fallah Mehrabadi, M. H., Yaslianifard, S., Bashashati, M., Banihashemi, S. R., Soleimanifar, F., Lotfi, M., Taghizadeh, M., Soleimani, A., Khorasani, A., Moshiri, F. & Mozhgani, S-H., 17.09.2021, in: HELIYON. 7, 9, e08027.

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  4. KIR3DS1 directs NK cell-mediated protection against human adenovirus infections

    Jung, J. M., Ching, W., Baumdick, M. E., Hofmann-Sieber, H., Bosse, J. B., Koyro, T., Möller, K. J., Wegner, L., Niehrs, A., Russu, K., Ohms, M., Zhang, W., Ehrhardt, A., Duisters, K., Spierings, E., Hölzemer, A., Körner, C., Jansen, S. A., Peine, S., Königs, I., Lütgehetmann, M., Perez, D., Reinshagen, K., Lindemans, C. A., Altfeld, M., Belderbos, M., Dobner, T. & Bunders, M. J., 17.09.2021, in: SCI IMMUNOL. 6, 63, eabe2942.

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  5. Bacteriophage Rescue Therapy of a Vancomycin-Resistant Enterococcus faecium Infection in a One-Year-Old Child following a Third Liver Transplantation

    Paul, K., Merabishvili, M., Hazan, R., Christner, M., Herden, U., Gelman, D., Khalifa, L., Yerushalmy, O., Coppenhagen-Glazer, S., Harbauer, T., Schulz-Jürgensen, S., Rohde, H., Fischer, L., Aslam, S., Rohde, C., Nir-Paz, R., Pirnay, J-P., Singer, D. & Muntau, A. C., 07.09.2021, in: VIRUSES-BASEL. 13, 9, S. 1785

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  6. Broadly directed SARS-CoV-2-specific CD4+ T cell response includes frequently detected peptide specificities within the membrane and nucleoprotein in patients with acute and resolved COVID-19

    Heide, J., Schulte, S., Kohsar, M., Brehm, T. T., Herrmann, M., Karsten, H., Marget, M., Peine, S., Johansson, A. M., Sette, A., Lütgehetmann, M., Kwok, W. W., Sidney, J. & Schulze Zur Wiesch, J., 09.2021, in: PLOS PATHOG. 17, 9, e1009842.

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  7. Low SARS-CoV-2 infection rates and high vaccine-induced immunity among German healthcare workers at the end of the third wave of the COVID-19 pandemic

    Brehm, T. T., Thompson, M., Ullrich, F., Schwinge, D., Addo, M. M., Spier, A., Knobloch, J. K., Aepfelbacher, M., Lohse, A. W., Lütgehetmann, M. & Schulze Zur Wiesch, J., 09.2021, in: INT J HYG ENVIR HEAL. 238, 113851.

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  8. Milde COVID-19-Verläufe bei Mitarbeitenden einer Universitätsklinik: Die „erste Welle“ am Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf

    von Felden, J., Brehm, T. T., Schulze-Zur-Wiesch, J., Addo, M. M., Lohse, A. W., Knobloch, J. & Koch, T., 09.2021, in: BUNDESGESUNDHEITSBLA. 64, 9, S. 1165-1168 4 S.

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  9. Prediction of anti-tuberculosis treatment duration based on a 22-gene transcriptomic model

    Heyckendorf, J., Marwitz, S., Reimann, M., Avsar, K., DiNardo, A., Günther, G., Hoelscher, M., Ibraim, E., Kalsdorf, B., Kaufmann, S. H. E., Kontsevaya, I., van Leth, F., Mandalakas, A. M., Maurer, F. P., Müller, M., Nitschkowski, D., Olaru, I. D., Popa, C., Rachow, A., Rolling, T., Rybniker, J., Salzer, H. J. F., Sanchez-Carballo, P., Schuhmann, M., Schaub, D., Spinu, V., Suárez, I., Terhalle, E., Unnewehr, M., Weiner, J., Goldmann, T. & Lange, C., 09.2021, in: EUR RESPIR J. 58, 3, S. 2003492

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  10. The Emerging Role of Iron Acquisition in Biofilm-Associated Infections

    Oliveira, F., Rohde, H., Vilanova, M. & Cerca, N., 09.2021, in: TRENDS MICROBIOL. 29, 9, S. 772-775 4 S.

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  11. The handling of SARS-CoV-2 associated deaths - infectivity of the body

    Schröder, A. S., Edler, C., Ondruschka, B., Püschel, K., Schädler, J., Heinemann, A., Heinrich, F., Lütgehetmann, M., Pfefferle, S., Aepfelbacher, M., Fitzek, A. & Sperhake, J-P., 09.2021, in: FORENSIC SCI MED PAT. 17, 3, S. 411-418 8 S.

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  12. Intestinal Colonization with Tropheryma whipplei—Clinical and Immunological Implications for HIV Positive Adults in Ghana

    Eberhardt, K. A., Sarfo, F. S., Klupp, E-M., Dompreh, A., Cristanziano, V. D., Kuffour, E. O., Boateng, R., Norman, B., Phillips, R. O., Aepfelbacher, M. & Feldt, T., 22.08.2021, in: MICROORGANISMS. 9, 8, S. 1781

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  13. Comparison of Two Real-Time PCR Assays Targeting Ribosomal Sequences for the Identification of Cystoisospora belli in Human Stool Samples

    Blohm, M., Hahn, A., Hagen, R. M., Eberhardt, K. A., Rohde, H., Leboulle, G., Feldt, T., Sarfo, F. S., Cristanziano, V. D., Frickmann, H. & Loderstädt, U., 19.08.2021, in: PATHOGENS. 10, 8

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  14. Vertically transferred maternal immune cells promote neonatal immunity against early life infections

    Stelzer, I., Urbschat, C., Schepanski, S., Thiele, K., Triviai, I., Wieczorek, A., Alawi, M., Ohnezeit, D., Kottlau, J., Huang, J., Fischer, N., Mittrücker, H-W., Solano, M. E., Fehse, B., Diemert, A., Stahl, F. & Arck, P., 04.08.2021, in: NAT COMMUN. 12, 1, S. 4706

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  15. Benchmark of thirteen bioinformatic pipelines for metagenomic virus diagnostics using datasets from clinical samples

    de Vries, J. J. C., Brown, J. R., Fischer, N., Sidorov, I. A., Morfopoulou, S., Huang, J., Munnink, B. B. O., Sayiner, A., Bulgurcu, A., Rodriguez, C., Gricourt, G., Keyaerts, E., Beller, L., Bachofen, C., Kubacki, J., Samuel, C., Florian, L., Dennis, S., Beer, M., Hoeper, D., Huber, M., Kufner, V., Zaheri, M., Lebrand, A., Papa, A., van Boheemen, S., Kroes, A. C. M., Breuer, J., Lopez-Labrador, F. X., Claas, E. C. J. & ESCV Network on Next-Generation Sequencing, 08.2021, in: J CLIN VIROL. 141, 104908.

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  16. Evaluation of a fully automated high-throughput SARS-CoV-2 multiplex qPCR assay with built-in screening functionality for del-HV69/70- and N501Y variants such as B.1.1.7

    Nörz, D., Grunwald, M., Olearo, F., Fischer, N., Aepfelbacher, M., Pfefferle, S. & Lütgehetmann, M., 08.2021, in: J CLIN VIROL. 141, 104894.

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  17. Innate immunity in hepatitis B and D virus infection: consequences for viral persistence, inflammation, and T cell recognition

    Dandri, M., Bertoletti, A. & Lütgehetmann, M., 08.2021, in: SEMIN IMMUNOPATHOL. 43, 4, S. 535-548 14 S.

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  18. Nicht-Cholera-Vibrionen – derzeit noch seltene, aber wachsende Infektionsgefahr in Nord- und Ostsee

    Brehm, T. T., Dupke, S., Hauk, G., Fickenscher, H., Rohde, H. & Berneking, L., 08.2021, in: INTERNIST. 62, 8, S. 876-886 11 S.

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  19. Telmisartan induces a specific gut microbiota signature which may mediate its antiobesity effect

    Beckmann, L., Künstner, A., Freschi, M. L., Huber, G., Stölting, I., Ibrahim, S. M., Hirose, M., Freitag, M., Langan, E. A., Matschl, U., Galuska, C. E., Fuchs, B., Knobloch, J. K., Busch, H. & Raasch, W., 08.2021, in: PHARMACOL RES. 170, 105724.

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  20. Post-Vaccination Anti-SARS-CoV-2-Antibody Response in Patients with Multiple Myeloma Correlates with Low CD19+ B-Lymphocyte Count and Anti-CD38 Treatment

    Ghandili, S., Schönlein, M., Lütgehetmann, M., Wiesch, J. S. Z., Becher, H., Bokemeyer, C., Sinn, M., Weisel, K. C. & Leypoldt, L. B., 28.07.2021, in: CANCERS. 13, 15, 3800.

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  21. Usefulness of Biofire FilmArray BCID2 for blood culture processing in clinical practice

    Berinson, B., Both, A., Berneking, L., Christner, M., Lütgehetmann, M., Aepfelbacher, M. & Rohde, H., 19.07.2021, in: Journal of Clinical Microbiology. 59, 8, S. e0054321 e0054321.

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  22. Development of the "Hamburg Best Practice Guidelines for ICV-Enzyme Replacement therapy (ERT) in CLN2 Disease" Based on 6 Years Treatment Experience in 48 Patients

    Schwering, C., Kammler, G., Wibbeler, E., Christner, M., Knobloch, J. K-M., Nickel, M., Denecke, J., Baehr, M. & Schulz, A., 07.2021, in: J CHILD NEUROL. 36, 8, S. 635-641 7 S.

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  23. Hepatitis E virus persists in the ejaculate of chronically infected men

    Horvatits, T., Wißmann, J-E., Johne, R., Groschup, M. H., Gadicherla, A. K., Wiesch, J. S. Z., Eiden, M., Todt, D., Reimer, R., Dähnert, L., Schöbel, A., Horvatits, K., Lübke, R., Wolschke, C., Ayuk, F., Rybczynski, M., Lohse, A. W., Addo, M. M., Herker, E., Lütgehetmann, M., Steinmann, E. & Pischke, S., 07.2021, in: J HEPATOL. 75, 1, S. 55-63 9 S.

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  24. Performance of a loop-mediated isothermal amplification assay (Isoplex CRE-ART) to detect common carbapenemase-encoding genes in Gram-negative bacteria

    Berneking, L., Asar, L., Both, A., Berinson, B., Aepfelbacher, M., Lütgehetmann, M. & Rohde, H., 07.2021, in: J MED MICROBIOL. 70, 7

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  25. Practical recommendations for routine cleaning and disinfection procedures in healthcare institutions: a narrative review

    Assadian, O., Harbarth, S., Vos, M., Knobloch, J. K., Asensio, A. & Widmer, A. F., 07.2021, in: J HOSP INFECT. 113, S. 104-114 11 S.

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  26. Fatal COVID-19 in a Child with Persistence of SARS-CoV-2 Despite Extensive Multidisciplinary Treatment: A Case Report

    Apostolidou, S., Harbauer, T., Lasch, P., Biermann, D., Hempel, M., Lütgehetmann, M., Pfefferle, S., Herrmann, J., Rüffer, A., Reinshagen, K., Kozlik-Feldmann, R., Gieras, A., Kniep, I., Oh, J., Singer, D., Ebenebe, C. U. & Kobbe, R., 30.06.2021, in: CHILDREN-BASEL. 8, 7, 564.

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  27. Molecular Mechanisms of Borrelia burgdorferi Phagocytosis and Intracellular Processing by Human Macrophages

    Woitzik, P. & Linder, S., 22.06.2021, in: BIOLOGY-BASEL. 10, 7, S. 567

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  28. An automated room disinfection system using ozone is highly active against surrogates for SARS-CoV-2

    Franke, G., Knobling, B., Brill, F. H., Becker, B., Klupp, E. M., Belmar Campos, C., Pfefferle, S., Lütgehetmann, M. & Knobloch, J. K., 06.2021, in: J HOSP INFECT. 112, S. 108-113 6 S.

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  29. Bacterial adhesion characteristics on implant materials for intervertebral cages: titanium or PEEK for spinal infections?

    Krätzig, T., Mende, K. C., Mohme, M., von Kroge, S., Stangenberg, M., Dreimann, M., Westphal, M., Weisselberg, S. & Eicker, S. O., 06.2021, in: EUR SPINE J. 30, 6, S. 1774-1782 9 S.

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  30. Modifying a Diagnostic SARS-CoV-2 Spike PCR to Turn a Del69/70 Dropout into a Discriminatory On-Target Assay

    Nörz, D., Pfefferle, S., Grunwald, M., Fischer, N., Aepfelbacher, M. & Lütgehetmann, M., 06.2021, in: J MOL DIAGN. 23, 6, S. 777-778 2 S.

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  31. Staphylococcus epidermidis clones express Staphylococcus aureus-type wall teichoic acid to shift from a commensal to pathogen lifestyle

    Du, X., Larsen, J., Li, M., Walter, A., Slavetinsky, C., Both, A., Sanchez Carballo, P. M., Stegger, M., Lehmann, E., Liu, Y., Liu, J., Slavetinsky, J., Duda, K. A., Krismer, B., Heilbronner, S., Weidenmaier, C., Mayer, C., Rohde, H., Winstel, V. & Peschel, A., 06.2021, in: NAT MICROBIOL. 6, 6, S. 757-768 12 S.

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  32. HEV-Associated Neuralgic Amyotrophy : A Multicentric Case Series

    Bannasch, J. H., Berger, B., Schwartkopp, C-P., Berning, M., Goetze, O., Panning, M., Fritz-Weltin, M., Trendelenburg, G., Gelderblom, M., Lütgehetmann, M., Stute, F., Horvatits, T., Dirks, M., Antoni, C., Behrendt, P. & Pischke, S., 30.05.2021, in: PATHOGENS. 10, 6, 672.

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  33. Cefiderocol in Critically Ill Patients with Multi-Drug Resistant Pathogens: Real-Life Data on Pharmacokinetics and Microbiological Surveillance

    König, C., Both, A., Rohde, H., Kluge, S., Frey, O. R., Röhr, A. C. & Wichmann, D., 28.05.2021, in: ANTIBIOTICS-BASEL. 10, 6, S. 649 649.

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  34. Patient Characteristics and Clinical Course of COVID-19 Patients Treated at a German Tertiary Center during the First and Second Waves in the Year 2020

    Brehm, T. T., Heyer, A., Roedl, K., Jarczak, D., Nierhaus, A., Nentwich, M. F., van der Meirschen, M., Schultze, A., Christner, M., Fiedler, W., Kröger, N., Huber, T. B., Klose, H., Sterneck, M., Jordan, S., Kreuels, B., Schmiedel, S., Addo, M. M., Huber, S., Lohse, A. W., Kluge, S. & Schulze Zur Wiesch, J., 24.05.2021, in: J CLIN MED. 10, 11, 2274.

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  35. An inter‑laboratory study to investigate the impact of the bioinformatics component on microbiome analysis using mock communities

    O’Sullivan, D., Doyle, R., Temisak, S., Redshaw, N., Whale, A., Logan, G., Huang, J., Fischer, N., Amos, G., Preston, M., Marchesi, J., Wagner, J., Parkhill, J., Motro, Y., Denise, H., Finn, R., Kay, G., O'Grady, J., Ransom-Jones, E., Wu, H., Laing, E., Benavente, E., Phelan, J., Clark, T., Moran-Gilad, J. & Huggett, J., 19.05.2021, in: SCI REP-UK. 11, 1, S. 10590

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  36. Implementation of a multidisciplinary infections conference improves the treatment of spondylodiscitis

    Ntalos, D., Schoof, B., Thiesen, D. M., Viezens, L., Kleinertz, H., Rohde, H., Both, A., Luebke, A., Strahl, A., Dreimann, M. & Stangenberg, M., 04.05.2021, in: SCI REP-UK. 11, 1, S. 9515

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  37. Performance of the BD Phoenix CPO detect assay for detection and classification of carbapenemase-producing organisms

    Berneking, L., Both, A., Berinson, B., Hoffmann, A., Lütgehetmann, M., Aepfelbacher, M. & Rohde, H., 05.2021, in: EUR J CLIN MICROBIOL. 40, 5, S. 979-985 7 S.

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  38. Recommendations for the introduction of metagenomic next-generation sequencing in clinical virology, part II:bioinformatic analysis and reporting

    de Vries, J. J. C., Brown, J. R., Couto, N., Beer, M., Le Mercier, P., Sidorov, I., Papa, A., Fischer, N., Oude Munnink, B. B., Rodriquez, C., Zaheri, M., Sayiner, A., Hönemann, M., Cataluna, A. P., Carbo, E. C., Bachofen, C., Kubacki, J., Schmitz, D., Tsioka, K., Matamoros, S., Höper, D., Hernandez, M., Puchhammer-Stöckl, E., Lebrand, A., Huber, M., Simmonds, P., Claas, E. C. J., López-Labrador, F. X. & ESCV Network on Next-Generation Sequencing, 05.2021, in: J CLIN VIROL. 138, 104812.

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  39. Retrospective analysis of bacterial colonization of necrotic bone and antibiotic resistance in 98 patients with medication-related osteonecrosis of the jaw (MRONJ)

    Ewald, F., Wuesthoff, F., Koehnke, R., Friedrich, R. E., Gosau, M., Smeets, R., Rohde, H. & Assaf, A. T., 05.2021, in: CLIN ORAL INVEST. 25, 5, S. 2801-2809 9 S.

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  40. Upregulation of HLA-F expression by BK polyomavirus infection induces immune recognition by KIR3DS1-positive natural killer cells

    Koyro, T. F., Kraus, E., Lunemann, S., Hölzemer, A., Wulf, S., Jung, J., Fittje, P., Henseling, F., Körner, C., Huber, T. B., Grundhoff, A., Wiech, T., Panzer, U., Fischer, N. & Altfeld, M., 05.2021, in: KIDNEY INT. 99, 5, S. 1140-1148 9 S.

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  41. SARS-CoV-2-Zufallsentdeckungen bei Hamburger Todesfällen: ein epidemiologisches Monitoring während des dynamischen Infektionsgeschehens im Frühjahr 2020

    Klein, A., Langenwalder, F., Heinrich, F., Meißner, K., Schröder, A. S., Püschel, K., Ondruschka, B., Lütgehetmann, M. & Heinemann, A., 20.04.2021, in: RECHTSMEDIZIN. 31, S. 427-433 7 S.

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  42. Less than you'd think-a prospective study on MRSA-colonization in healthy travellers

    Tran, DT., Winter, D., Christner, M., Ramharter, M., Addo, M. M., Rolling, T., Vinnemeier, C. & Koch, T., 14.04.2021, in: J TRAVEL MED. 28, 3, taaa242.

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  43. EUCAST rapid antimicrobial susceptibility testing (RAST): analytical performance and impact on patient management

    Berinson, B., Olearo, F., Both, A., Brossmann, N., Christner, M., Aepfelbacher, M. & Rohde, H., 13.04.2021, in: J ANTIMICROB CHEMOTH. 76, 5, S. 1332-1338 7 S.

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  44. SARS-CoV-2 Reinfection in a Healthcare Worker Despite the Presence of Detectable Neutralizing Antibodies

    Brehm, T. T., Pfefferle, S., von Possel, R., Kobbe, R., Nörz, D., Schmiedel, S., Grundhoff, A., Olearo, F., Emmerich, P., Robitaille, A., Günther, T., Braun, P., Andersen, G., Knobloch, J. K., Addo, M. M., Lohse, A. W., Aepfelbacher, M., Fischer, N., Schulze Zur Wiesch, J. & Lütgehetmann, M., 12.04.2021, in: VIRUSES-BASEL. 13, 4, 661.

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  45. Presence of SARS-CoV-2 RNA in the Cornea of Viremic Patients With COVID-19

    Casagrande, M., Fitzek, A., Spitzer, M. S., Püschel, K., Glatzel, M., Krasemann, S., Nörz, D., Lütgehetmann, M., Pfefferle, S. & Schultheiss, M., 01.04.2021, in: JAMA OPHTHALMOL. 139, 4, S. 383-388 6 S.

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  46. Clinical evaluation of a laboratory-developed quantitative BK virus-PCR assay using the cobas® omni Utility Channel

    Fritzsche, A., Berneking, L., Nörz, D., Reucher, S., Fischer, N., Roggenkamp, H., Aepfelbacher, M., Rohde, H., Pfefferle, S. & Lütgehetmann, M., 04.2021, in: J VIROL METHODS. 290, S. 114093

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  47. Handling and accuracy of four rapid antigen tests for the diagnosis of SARS-CoV-2 compared to RT-qPCR

    Olearo, F., Nörz, D., Heinrich, F., Sutter, J. P., Roedl, K., Schultze, A., Wiesch, J. S. Z., Braun, P., Oestereich, L., Kreuels, B., Wichmann, D., Aepfelbacher, M., Pfefferle, S. & Lütgehetmann, M., 04.2021, in: J CLIN VIROL. 137, 104782.

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  48. Severe liver dysfunction complicating course of COVID-19 in the critically ill: multifactorial cause or direct viral effect?

    Roedl, K., Jarczak, D., Drolz, A., Wichmann, D., Boenisch, O., de Heer, G., Burdelski, C., Frings, D., Sensen, B., Nierhaus, A., Lütgehetmann, M., Kluge, S. & Fuhrmann, V., 15.03.2021, in: ANN INTENSIVE CARE. 11, 1, 44.

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  49. Comparison of clinical characteristics and disease outcome of COVID-19 and seasonal influenza

    Brehm, T. T., van der Meirschen, M., Hennigs, A., Roedl, K., Jarczak, D., Wichmann, D., Frings, D., Nierhaus, A., Oqueka, T., Fiedler, W., Christopeit, M., Kraef, C., Schultze, A., Lütgehetmann, M., Addo, M. M., Schmiedel, S., Kluge, S. & Schulze Zur Wiesch, J., 11.03.2021, in: SCI REP-UK. 11, 1, 5803.

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  50. Host factors abolish the need for polysaccharides and extracellular matrix-binding protein in Staphylococcus epidermidis biofilm formation

    Skovdal, S. M., Hansen, L. K., Ivarsen, D. M., Zeng, G., Büttner, H., Rohde, H., Jørgensen, N. P. & Meyer, R. L., 03.2021, in: J MED MICROBIOL. 70, 3

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  51. Seroprevalence of SARS-CoV-2 antibodies among hospital workers in a German tertiary care center: A sequential follow-up study

    Brehm, T. T., Schwinge, D., Lampalzer, S., Schlicker, V., Küchen, J., Thompson, M., Ullrich, F., Huber, S., Schmiedel, S., Addo, M. M., Lütgehetmann, M., Knobloch, J. K., Schulze Zur Wiesch, J. & Lohse, A. W., 03.2021, in: INT J HYG ENVIR HEAL. 232, 113671.

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