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Institut für Medizinische Mikrobiologie, Virologie und Hygiene

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Publikationen

  1. 2021

  2. Simulation of Folding Kinetics for Aligned RNAs

    Huang, J. & Voß, B., 26.02.2021, in: GENES-BASEL. 12, 3, 347.

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  3. Clonal expansion and activation of tissue-resident memory-like Th17 cells expressing GM-CSF in the lungs of severe COVID-19 patients

    Zhao, Y., Kilian, C., Turner, J. E., Bosurgi, L., Roedl, K., Bartsch, P., Gnirck, A. C., Cortesi, F., Schultheiß, C., Hellmig, M., Enk, L. U. B., Hausmann, F., Borchers, A., Wong, M. N., Paust, H. J., Siracusa, F., Scheibel, N., Herrmann, M., Rosati, E., Bacher, P., Kylies, D., Jarczak, D., Lütgehetmann, M., Pfefferle, S., Steurer, S., Zur Wiesch, J. S., Puelles, V. G., Sperhake, J. P., Addo, M. M., Lohse, A. W., Binder, M., Huber, S., Huber, T. B., Kluge, S., Bonn, S., Panzer, U., Gagliani, N. & Krebs, C. F., 23.02.2021, in: SCI IMMUNOL. 6, 56, eabf6692.

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  4. FIB/SEM-based analysis of Borrelia intracellular processing by human macrophages

    Klose, M., Scheungrab, M., Luckner, M., Wanner, G. & Linder, S., 11.02.2021, in: J CELL SCI. 134, 5, jcs252320.

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  5. Clinical evaluation of a fully automated, laboratory-developed multiplex RT-PCR assay integrating dual-target SARS-CoV-2 and influenza A/B detection on a high-throughput platform

    Nörz, D., Hoffmann, A., Aepfelbacher, M., Pfefferle, S. & Lütgehetmann, M., 02.2021, in: J MED MICROBIOL. 70, 2

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  6. Distinct clonal lineages and within-host diversification shape invasive Staphylococcus epidermidis populations

    Both, A., Huang, J., Qi, M., Lausmann, C., Weißelberg, S., Büttner, H., Lezius, S., Failla, A. V., Christner, M., Stegger, M., Gehrke, T., Baig, S., Citak, M., Alawi, M., Aepfelbacher, M. & Rohde, H., 02.2021, in: PLOS PATHOG. 17, 2, S. e1009304

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  7. Emergence of linezolid-resistance in vancomycin-resistant Enterococcus faecium ST117 associated with increased linezolid-consumption

    Olearo, F., Both, A., Belmar Campos, C., Hilgarth, H., Klupp, E-M., Hansen, J. L., Maurer, F. P., Christner, M., Aepfelbacher, M. & Rohde, H., 02.2021, in: INT J MED MICROBIOL. 311, 2, 151477.

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  8. Murine hepatocytes do not support persistence of Hepatitis D Virus mono-infection in vivo

    Giersch, K., Hermanussen, L., Volz, T., Kah, J., Allweiss, L., Casey, J., Sureau, C., Dandri, M. & Lütgehetmann, M., 02.2021, in: LIVER INT. 41, 2, S. 410-419 10 S.

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  9. Viral Dynamics of SARS-CoV-2 in Critically Ill Allogeneic Hematopoietic Stem Cell Transplant Recipients and Immunocompetent Patients with COVID-19

    Roedl, K., Heidenreich, S., Pfefferle, S., Jarczak, D., Urbanowicz, T. T., Nörz, D., Aepfelbacher, M., Kröger, N., Kluge, S., Lütgehetmann, M., Christopeit, M. & Wichmann, D., 15.01.2021, in: AM J RESP CRIT CARE. 203, 2, S. 242-245 4 S.

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  10. Lower Levels of Transaminases but Higher Levels of Serum Creatinine in Patients with Acute Hepatitis E in Comparison to Patients with Hepatitis A

    Brehm, T. T., Mazaheri, O., Horvatits, T., Lütgehetmann, M., Schulze Zur Wiesch, J., Lohse, A. W., Polywka, S. & Pischke, S., 12.01.2021, in: PATHOGENS. 10, 1, S. 60

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  11. B cell analysis in SARS‐CoV‐2 versus malaria: Increased frequencies of plasmablasts and atypical memory B cells in COVID‐19

    Wildner, N. H., Ahmadi, P., Schulte, S., Brauneck, F., Kohsar, M., Lütgehetmann, M., Beisel, C., Addo, M. M., Haag, F. & Schulze zur Wiesch, J., 01.2021, in: J LEUKOCYTE BIOL. 109, 1, S. 77-90 14 S.

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  12. Control of SARS-CoV-2 infection in rituximab-treated neuroimmunological patients

    Woo, M. S., Steins, D., Häußler, V., Kohsar, M., Haag, F., Elias-Hamp, B., Heesen, C., Lütgehetmann, M., Schulze Zur Wiesch, J. & Friese, M. A., 01.2021, in: J NEUROL. 268, 1, S. 5-7 3 S.

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  13. Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (4th edition) 1

    Autophagy, 01.2021, in: AUTOPHAGY. 17, 1, S. 1-382 382 S.

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  14. Hepatitis delta virus propagation enabled by hepatitis C virus - scientifically intriguing; but is it relevant to clinical practice?

    Pflüger, L. S., Schulze Zur Wiesch, J., Polywka, S. & Lütgehetmann, M., 01.2021, in: J VIRAL HEPATITIS. 28, 1, S. 213-216 4 S.

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  15. Postmortem Stability of SARS-CoV-2 in Nasopharyngeal Mucosa

    Heinrich, F., Meißner, K., Langenwalder, F., Püschel, K., Hoffmann, A., Lütgehetmann, M., Aepfelbacher, M., Bibiza-Freiwald, E., Pfefferle, S. & Heinemann, A., 01.2021, in: EMERG INFECT DIS. 27, 1, S. 329-331 3 S.

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  16. Recommendations for the introduction of metagenomic high-throughput sequencing in clinical virology, part I:Wet lab procedure

    López-Labrador, F. X., Brown, J. R., Fischer, N., Harvala, H., Van Boheemen, S., Cinek, O., Sayiner, A., Madsen, T. V., Auvinen, E., Kufner, V., Huber, M., Rodriguez, C., Jonges, M., Hönemann, M., Susi, P., Sousa, H., Klapper, P. E., Pérez-Cataluňa, A., Hernandez, M., Molenkamp, R., der Hoek, L. V., Schuurman, R., Couto, N., Leuzinger, K., Simmonds, P., Beer, M., Höper, D., Kamminga, S., Feltkamp, M. C. W., Rodríguez-Díaz, J., Keyaerts, E., Nielsen, X. C., Puchhammer-Stöckl, E., Kroes, A. C. M., Buesa, J., Breuer, J., Claas, E. C. J., de Vries, J. J. C. & ESCV Network on Next-Generation Sequencing, 01.2021, in: J CLIN VIROL. 134, 104691.

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  17. SARS Coronavirus-2 variant tracing within the first Coronavirus Disease 19 clusters in northern Germany

    Pfefferle, S., Günther, T., Kobbe, R., Czech-Sioli, M., Nörz, D., Santer, R., Oh, J., Kluge, S., Oestereich, L., Peldschus, K., Indenbirken, D., Huang, J., Grundhoff, A., Aepfelbacher, M., Knobloch, J. K., Lütgehetmann, M. & Fischer, N., 01.2021, in: CLIN MICROBIOL INFEC. 27, 1, S. 130.e5-130.e8

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  18. Evaluation of the Effectiveness of Two Automated Room Decontamination Devices Under Real-Life Conditions

    Knobling, B., Franke, G., Klupp, E. M., Belmar Campos, C. & Knobloch, J. K., 2021, in: FRONT PUBLIC HEALTH. 9, 618263.

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  19. Fighting Staphylococcus epidermidis Biofilm-Associated Infections: Can Iron Be the Key to Success?

    Oliveira, F., Rohde, H., Vilanova, M. & Cerca, N., 2021, in: FRONT CELL INFECT MI. 11, 798563.

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  20. Guidelines for the use and interpretation of assays for monitoring autophagy (4th edition)

    D. J. KLIONSKY ET AL., 2021, in: AUTOPHAGY.

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  21. Inefficient Placental Virus Replication and Absence of Neonatal Cell-Specific Immunity Upon Sars-CoV-2 Infection During Pregnancy

    Tallarek, A-C., Urbschat, C., Fonseca Brito, L., Stanelle-Bertram, S., Krasemann, S., Frascaroli, G., Thiele, K., Wieczorek, A., Felber, N., Lütgehetmann, M., Markert, U. R., Hecher, K., Brune, W., Stahl, F., Gabriel, G., Diemert, A. & Arck, P. C., 2021, in: FRONT IMMUNOL. 12, S. 698578

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  22. Low incidence of COVID-19 in a prospective cohort of patients with liver cirrhosis and hepatocellular carcinoma treated at a tertiary medical center during the 2020 pandemic

    Fründt, T., Kuballa, L., Lütgehetman, M., Nörz, D., Arend, H., Brehm, T. T., Schulze Zur Wiesch, J., Horvatits, T., Horvatits, K., Huber, S., Wege, H. & Kluwe, J., 2021, in: PLOS ONE. 16, 12, S. e0258450

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  23. Siderophore-Mediated Iron Acquisition Plays a Critical Role in Biofilm Formation and Survival of Staphylococcus epidermidis Within the Host

    Oliveira, F., Lima, T., Correia, A., Silva, A. M., Soares, C., Morais, S., Weißelberg, S., Vilanova, M., Rohde, H. & Cerca, N., 2021, in: FRONT MED-LAUSANNE. 8, 799227.

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  24. Strong Replication Interference Between Hepatitis Delta Viruses in Human Liver Chimeric Mice

    Giersch, K., Hermanussen, L., Volz, T., Volmari, A., Allweiss, L., Sureau, C., Casey, J., Huang, J., Fischer, N., Lütgehetmann, M. & Dandri, M., 2021, in: FRONT MICROBIOL. 12, S. 671466

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  25. 2020

  26. Molecular Characterization of Staphylococcus aureus Isolated from Chronic Infected Wounds in Rural Ghana

    Wolters, M., Frickmann, H., Christner, M., Both, A., Rohde, H., Oppong, K., Akenten, C. W., May, J. & Dekker, D., 21.12.2020, in: MICROORGANISMS. 8, 12

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  27. Merkel Cell Polyomavirus Encodes Circular RNAs (circRNAs) Enabling a Dynamic circRNA/microRNA/mRNA Regulatory Network

    Abere, B., Zhou, H., Li, J., Cao, S., Toptan, T., Grundhoff, A., Fischer, N., Moore, P. S. & Chang, Y., 15.12.2020, in: MBIO. 11, 6, e03059-20.

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  28. Challenges in treatment of patients with acute leukemia and COVID-19: a series of 12 patients

    Ghandili, S., Pfefferle, S., Roedl, K., Sonnemann, P., Karagiannis, P., Boenisch, O., Kluge, S., Schmiedel, S., Ittrich, H., Rohde, H., Lütgehetmann, M., Weisel, K., Bokemeyer, C., Wichmann, D., Fiedler, W., Jarczak, D. & Modemann, F., 08.12.2020, in: Blood Adv. 4, 23, S. 5936-5941 6 S.

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  29. SARS-CoV-2 outbreak investigation in a German meat processing plant

    Günther, T., Czech-Sioli, M., Indenbirken, D., Robitaille, A., Tenhaken, P., Exner, M., Ottinger, M., Fischer, N., Grundhoff, A. & Brinkmann, M. M., 07.12.2020, in: EMBO MOL MED. 12, 12, S. e13296

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  30. Fatal renal mucormycosis with Apophysomyces elegans in an apparently healthy male

    Rashid, S., Ben Abid, F., Babu, S., Christner, M., Alobaidly, A., Al Ansari, A. A. A. & Akhtar, M., 12.2020, in: AGING MALE. 23, 5, S. 746-749 4 S.

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  31. Major central nervous system complications after allogeneic stem cell transplantation: a large retrospective study on 888 consecutive adult patients

    Mannina, D., Berneking, L., Both, A., Timm, W., Urbanowicz, T., Wolschke, C., Ayuk, F. A., Fischer, N., Fiehler, J., Grzyska, U., Rösner, S., Choe, C-U., Kröger, N. & Christopeit, M., 12.2020, in: EUR J HAEMATOL. 105, 6, S. 722-730 9 S.

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  32. Neuropathology of patients with COVID-19 in Germany: a post-mortem case series

    Matschke, J., Lütgehetmann, M., Hagel, C., Sperhake, J. P., Schröder, A. S., Edler, C., Mushumba, H., Fitzek, A., Allweiss, L., Dandri, M., Dottermusch, M., Heinemann, A., Pfefferle, S., Schwabenland, M., Sumner Magruder, D., Bonn, S., Prinz, M., Gerloff, C., Püschel, K., Krasemann, S., Aepfelbacher, M. & Glatzel, M., 11.2020, in: LANCET NEUROL. 19, 11, S. 919-929 11 S.

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  33. Pushing beyond specifications:Evaluation of linearity and clinical performance of the cobas 6800/8800 SARS-CoV-2 RT-PCR assay for reliable quantification in blood and other materials outside recommendations

    Nörz, D., Frontzek, A., Eigner, U., Oestereich, L., Wichmann, D., Kluge, S., Fischer, N., Aepfelbacher, M., Pfefferle, S. & Lütgehetmann, M., 11.2020, in: J CLIN VIROL. 132, S. 104650

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  34. Antibiotic sensitivity in correlation to the origin of secondary peritonitis: a single center analysis

    Grotelüschen, R., Heidelmann, L. M., Lütgehetmann, M., Melling, N., Reeh, M., Ghadban, T., Dupree, A., Izbicki, J. R. & Bachmann, K. A., 29.10.2020, in: SCI REP-UK. 10, 1, S. 18588

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  35. Sustained response after remdesivir and convalescent plasma therapy in a B-cell depleted patient with protracted COVID-19

    Malsy, J., Veletzky, L., Heide, J., Hennigs, A., Gil-Ibanez, I., Stein, A., Lütgehetmann, M., Rosien, U., Jasper, D., Peine, S., Hiller, J., Haag, F., Schmiedel, S., Huber, S., Jordan, S., Addo, M. M. & Schulze Zur Wiesch, J., 26.10.2020, in: CLIN INFECT DIS. 73, 11, S. e4020–e4024

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  36. A Giant Extracellular Matrix Binding Protein of Staphylococcus epidermidis Binds Surface-Immobilized Fibronectin via a Novel Mechanism

    Büttner, H., Perbandt, M., Kohler, T., Kikhney, A., Wolters, M., Christner, M., Heise, M., Wilde, J., Weißelberg, S., Both, A., Betzel, C., Hammerschmidt, S., Svergun, D., Aepfelbacher, M. & Rohde, H., 20.10.2020, in: MBIO. 11, 5

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  37. Epidemiology, clinical characteristics, and outcome of candidemia in critically ill patients in Germany: a single-center retrospective 10-year analysis

    Schroeder, M., Weber, T., Denker, T., Winterland, S., Wichmann, D., Rohde, H., Ozga, A-K., Fischer, M. & Kluge, S., 16.10.2020, in: ANN INTENSIVE CARE. 10, 1, S. 142

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  38. Antibiotic Resistance and Mobile Genetic Elements in Extensively Drug-Resistant Klebsiella pneumoniae Sequence Type 147 Recovered from Germany

    Xanthopoulou, K., Carattoli, A., Wille, J., Biehl, L. M., Rohde, H., Farowski, F., Krut, O., Villa, L., Feudi, C., Seifert, H. & Higgins, P. G., 05.10.2020, in: ANTIBIOTICS-BASEL. 9, 10

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  39. Temporal Changes in Patient-Matched Staphylococcus epidermidis Isolates from Infections:towards Defining a 'True' Persistent Infection

    Harris, L. G., Bodger, O., Post, V., Mack, D., Morgenstern, M., Rohde, H., Moriarty, T. F. & Wilkinson, T. S., 30.09.2020, in: MICROORGANISMS. 8, 10

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  40. Significance of Anti-Nuclear Antibodies and Cryoglobulins in Patients with Acute and Chronic HEV Infection

    Horvatits, T., Schulze Zur Wiesch, J., Polywka, S., Buescher, G., Lütgehetmann, M., Hussey, E., Horvatits, K., Peine, S., Haag, F., Addo, M. M., Lohse, A. W., Weiler-Normann, C. & Pischke, S., 16.09.2020, in: PATHOGENS. 9, 9

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  41. Germany's first COVID-19 deceased:a 59-year-old man presenting with diffuse alveolar damage due to SARS-CoV-2 infection

    Heinrich, F., Sperhake, J-P., Heinemann, A., Mushumba, H., Lennartz, M., Nörz, D., Glatzel, M., Lütgehetmann, M. & Püschel, K., 04.09.2020, in: VIRCHOWS ARCH. 477, 3, S. 335-339 5 S.

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  42. Autoantibodies to intracellular "rods and rings" structures in two patients with autoimmune hepatitis treated with azathioprine

    Galaski, J., Koop, A. C., Lütgehetmann, M., Lohse, A. W. & Weiler-Normann, C., 09.2020, in: AUTOIMMUNITY. 53, 6, S. 362-365 4 S.

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  43. Clinical evaluation of five different automated SARS-CoV-2 serology assays in a cohort of hospitalized COVID-19 patients

    Pflüger, L. S., Bannasch, J. H., Brehm, T. T., Pfefferle, S., Hoffmann, A., Nörz, D., van der Meirschen, M., Kluge, S., Haddad, M., Pischke, S., Hiller, J., Addo, M. M., Lohse, A. W., Wiesch, J. S. Z., Peine, S., Aepfelbacher, M. & Lütgehetmann, M., 09.2020, in: J CLIN VIROL. 130, S. 104549

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  44. Correction to:Dying with SARS-CoV-2 infection-an autopsy study of the first consecutive 80 cases in Hamburg, Germany

    Edler, C., Schröder, A. S., Aepfelbacher, M., Fitzek, A., Heinemann, A., Heinrich, F., Klein, A., Langenwalder, F., Lütgehetmann, M., Meißner, K., Püschel, K., Schädler, J., Steurer, S., Mushumba, H. & Sperhake, J-P., 09.2020, in: INT J LEGAL MED. 134, 5, S. 1977

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  45. SARS-CoV-2 renal tropism associates with acute kidney injury

    Braun, F., Lütgehetmann, M., Pfefferle, S., Wong, M. N., Carsten, A., Lindenmeyer, M. T., Nörz, D., Heinrich, F., Meißner, K., Wichmann, D., Kluge, S., Gross, O., Pueschel, K., Schröder, A. S., Edler, C., Aepfelbacher, M., Puelles, V. G. & Huber, T. B., 29.08.2020, in: LANCET. 396, 10251, S. 597-598 2 S.

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  46. Autopsy Findings and Venous Thromboembolism in Patients With COVID-19: A Prospective Cohort Study

    Wichmann, D., Sperhake, J-P., Lütgehetmann, M., Steurer, S., Edler, C., Heinemann, A., Heinrich, F., Mushumba, H., Kniep, I., Schröder, A. S., Burdelski, C., de Heer, G., Nierhaus, A., Frings, D., Pfefferle, S., Becker, H., Bredereke-Wiedling, H., de Weerth, A., Paschen, H-R., Sheikhzadeh-Eggers, S., Stang, A., Schmiedel, S., Bokemeyer, C., Addo, M. M., Aepfelbacher, M., Püschel, K. & Kluge, S., 18.08.2020, in: ANN INTERN MED. 173, 4, S. 268-277 10 S.

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  47. Targeting Endothelial Dysfunction in Eight Extreme-Critically Ill Patients with COVID-19 Using the Anti-Adrenomedullin Antibody Adrecizumab (HAM8101)

    Karakas, M., Jarczak, D., Becker, M., Roedl, K., Addo, M. M., Hein, F., Bergmann, A., Zimmermann, J., Simon, T-P., Marx, G., Lütgehetmann, M., Nierhaus, A. & Kluge, S., 11.08.2020, in: BIOMOLECULES. 10, 8, 1171.

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  48. Pathogen-induced tissue-resident memory TH17 (TRM17) cells amplify autoimmune kidney disease

    Krebs, C. F., Reimers, D., Zhao, Y., Paust, H-J., Bartsch, P., Nuñez, S., Rosemblatt, M. V., Hellmig, M., Kilian, C., Borchers, A., Enk, L. U. B., Zinke, M., Becker, M., Schmid, J., Klinge, S., Wong, M. N., Puelles, V. G., Schmidt, C., Bertram, T., Stumpf, N., Hoxha, E., Meyer-Schwesinger, C., Lindenmeyer, M. T., Cohen, C. D., Rink, M., Kurts, C., Franzenburg, S., Koch-Nolte, F., Turner, J-E., Riedel, J-H., Huber, S., Gagliani, N., Huber, T. B., Wiech, T., Rohde, H., Bono, M. R., Bonn, S., Panzer, U. & Mittrücker, H-W., 07.08.2020, in: SCI IMMUNOL. 5, 50, eaba4163.

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  49. Multiorgan and Renal Tropism of SARS-CoV-2

    Puelles, V. G., Lütgehetmann, M., Lindenmeyer, M. T., Sperhake, J. P., Wong, M. N., Allweiss, L., Chilla, S., Heinemann, A., Wanner, N., Liu, S., Braun, F., Lu, S., Pfefferle, S., Schröder, A. S., Edler, C., Gross, O., Glatzel, M., Wichmann, D., Wiech, T., Kluge, S., Pueschel, K., Aepfelbacher, M. & Huber, T. B., 06.08.2020, in: NEW ENGL J MED. 383, 6, S. 590-592 3 S.

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  50. High effectiveness of multimodal infection control interventions in preventing SARS−CoV−2 infections in healthcare professionals: a prospective longitudinal seroconversion study

    Brehm, T. T., Schwinge, D., Lampalzer, S., Schlicker, V., Küchen, J., Thompson, M., Ullrich, F., Huber, S., Schmiedel, S., Addo, M. M., Lütgehetmann, M., Knobloch, J., Schulze zur Wiesch, J. & Lohse, A. W., 02.08.2020, in: medRxiv BMJ.

    Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › Andere (Vorworte u.ä.) › Forschung

  51. High-resolution analysis of Merkel Cell Polyomavirus in Merkel Cell Carcinoma reveals distinct integration patterns and suggests NHEJ and MMBIR as underlying mechanisms

    Czech-Sioli, M., Günther, T., Therre, M., Spohn, M., Indenbirken, D., Theiss, J., Riethdorf, S., Qi, M., Alawi, M., Wülbeck, C., Fernandez-Cuesta, I., Esmek, F., Becker, J. C., Grundhoff, A. & Fischer, N., 08.2020, in: PLOS PATHOG. 16, 8, e1008562.

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  52. Monocenter study on epidemiology, outcomes, and risk factors of infections in recipients of 166 allogeneic stem cell transplantations during 1 year

    Samek, M., Iversen, K., Belmar Campos, C., Berneking, L., Langebrake, C., Wolschke, C., Ayuk, F., Kröger, N. & Christopeit, M., 08.2020, in: EUR J HAEMATOL. 105, 2, S. 126-137 12 S.

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