Dr.rer.nat. ID: 5309931
Stefan Bonn
Publikationen
- 2024
Fetal lung growth predicts the risk for early-life respiratory infections and childhood asthma
Zazara, D. E., Giannou, O., Schepanski, S., Pagenkemper, M., Giannou, A. D., Pincus, M., Belios, I., Bonn, S., Muntau, A. C., Hecher, K., Diemert, A. & Arck, P. C., 05.2024, in: WORLD J PEDIATR. 20, 5, S. 481-495 15 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
DISSECT: deep semi-supervised consistency regularization for accurate cell type fraction and gene expression estimation
Khatri, R., Machart, P. & Bonn, S., 30.04.2024, in: GENOME BIOL. 25, 1, S. 112 112.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Temporal change of DNA methylation subclasses between matched newly diagnosed and recurrent glioblastoma
Drexler, R., Khatri, R., Schüller, U., Eckhardt, A., Ryba, A., Sauvigny, T., Dührsen, L., Mohme, M., Ricklefs, T., Bode, H., Hausmann, F., Huber, T. B., Bonn, S., Voß, H., Neumann, J. E., Silverbush, D., Hovestadt, V., Suvà, M. L., Lamszus, K., Gempt, J., Westphal, M., Heiland, D. H., Hänzelmann, S. & Ricklefs, F. L., 20.01.2024, in: ACTA NEUROPATHOL. 147, 1, S. 21Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
- 2023
A multi-omics dataset for the analysis of frontotemporal dementia genetic subtypes
Menden, K., Francescatto, M., Nyima, T., Blauwendraat, C., Dhingra, A., Castillo-Lizardo, M., Fernandes, N., Kaurani, L., Kronenberg-Versteeg, D., Atasu, B., Sadikoglou, E., Borroni, B., Rodriguez-Nieto, S., Simon-Sanchez, J., Fischer, A., Craig, D. W., Neumann, M., Bonn, S., Rizzu, P. & Heutink, P., 01.12.2023, in: SCI DATA. 10, 1, S. 849Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Testosterone affects type I/type II interferon response of neutrophils during hepatic amebiasis
Er-Lukowiak, M., Hänzelmann, S., Rothe, M., Moamenpour, D. T., Hausmann, F., Khatri, R., Hansen, C., Boldt, J., Bärreiter, V. A., Honecker, B., Bea, A., Groneberg, M., Fehling, H., Marggraff, C., Cadar, D., Bonn, S., Sellau, J. & Lotter, H., 12.2023, in: FRONT IMMUNOL. 14, S. 1279245Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Reduction of IFN-I responses by plasmacytoid dendritic cells in a longitudinal trans men cohort
Grünhagel, B., Borggrewe, M., Hagen, S. H., Ziegler, S. M., Henseling, F., Glau, L., Thiele, R-J., Pujantell, M., Sivayoganathan, V., Padoan, B., Claussen, J. M., Düsedau, A., Hennesen, J., Bunders, M. J., Bonn, S., Tolosa, E., Krebs, C. F., Dorn, C. & Altfeld, M., 17.11.2023, in: ISCIENCE. 26, 11, S. 108209Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Epigenetic profiling reveals a strong association between lack of 5-ALA fluorescence and EGFR amplification in IDH-wildtype glioblastoma
Drexler, R., Sauvigny, T., Schüller, U., Eckhardt, A., Maire, C. L., Khatri, R., Hausmann, F., Hänzelmann, S., Huber, T. B., Bonn, S., Bode, H., Lamszus, K., Westphal, M., Dührsen, L. & Ricklefs, F. L., 10.2023, in: NEURO-ONCOL PRACT. 10, 5, S. 462-471 10 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
DISCERN: deep single-cell expression reconstruction for improved cell clustering and cell subtype and state detection
Hausmann, F., Ergen, C., Khatri, R., Marouf, M., Hänzelmann, S., Gagliani, N., Huber, S., Machart, P. & Bonn, S., 20.09.2023, in: GENOME BIOL. 24, 1, S. 212Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Proteomic analysis of the human hippocampus identifies neuronal pentraxin 1 (NPTX1) as synapto-axonal target in late-stage Parkinson's disease
Warth Perez Arias, C. C., Silbern, I., Caldi Gomes, L., Wartmann, H., Dambeck, V., Fanz, J., Neuenroth, L., Bähr, M., Outeiro, T. F., Bonn, S., Stadelmann-Nessler, C., Rizzoli, S. O., Lenz, C., Urlaub, H. & Lingor, P., 09.2023, in: J NEUROCHEM. 166, 5, S. 862-874 13 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Epigenetic neural glioblastoma enhances synaptic integration and predicts therapeutic vulnerability
Drexler, R., Khatri, R., Sauvigny, T., Mohme, M., Maire, C. L., Ryba, A., Zghaibeh, Y., Dührsen, L., Salviano-Silva, A., Lamszus, K., Westphal, M., Gempt, J., Wefers, A. K., Neumann, J., Bode, H., Hausmann, F., Huber, T. B., Bonn, S., Jütten, K., Delev, D., Weber, K. J., Harter, P. N., Onken, J., Vajkoczy, P., Capper, D., Wiestler, B., Weller, M., Snijder, B., Buck, A., Weiss, T., Keough, M. B., Ni, L., Monje, M., Silverbush, D., Hovestadt, V., Suvà, M. L., Krishna, S., Hervey-Jumper, S. L., Schüller, U., Heiland, D. H., Hänzelmann, S. & Ricklefs, F. L., 07.08.2023, in: bioRxiv.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › Preprint › Forschung
Transcriptional and Clonal Characterization of Cytotoxic T Cells in Crescentic Glomerulonephritis
Mueller, A., Zhao, Y., Cicek, H., Paust, H-J., Sivayoganathan, A., Linke, A., Wegscheid, C., Wiech, T., Huber, T. B., Meyer-Schwesinger, C., Bonn, S., Prinz, I., Panzer, U., Tiegs, G., Krebs, C. F. & Neumann, K., 01.06.2023, in: J AM SOC NEPHROL. 34, 6, S. 1003-1018 16 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Loss of TDP-43 causes ectopic endothelial sprouting and migration defects through increased fibronectin, vcam 1 and integrin α4/β1
Hipke, K., Pitter, B., Hruscha, A., van Bebber, F., Modic, M., Bansal, V., Lewandowski, S. A., Orozco, D., Edbauer, D., Bonn, S., Haass, C., Pohl, U., Montanez, E. & Schmid, B., 06.2023, in: FRONT CELL DEV BIOL. 11, S. 1169962Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Targeted anticonvulsive treatment of IDH-wildtype glioblastoma based on DNA methylation subclasses
Drexler, R., Göttsche, J., Sauvigny, T., Schüller, U., Khatri, R., Hausmann, F., Hänzelmann, S., Huber, T. B., Bonn, S., Heiland, D. H., Delev, D., Venkataramani, V., Winkler, F., Weller, J., Zeyen, T., Herrlinger, U., Gempt, J., Ricklefs, F. L. & Dührsen, L., 04.05.2023, in: NEURO-ONCOLOGY. 25, 5, S. 1006-1008 3 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › Letter › Forschung › Begutachtung
DeePSC: A Deep Learning Model for Automated Diagnosis of Primary Sclerosing Cholangitis at Two-dimensional MR Cholangiopancreatography
Ragab, H., Westhaeusser, F., Ernst, A., Yamamura, J., Fuhlert, P., Zimmermann, M., Sauerbeck, J., Shenas, F., Özden, C., Weidmann, A., Adam, G., Bonn, S. & Schramm, C., 05.2023, in: RADIOL-ARTIF INTELL. 5, 3, S. e220160Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Performance comparison of TCR-pMHC prediction tools reveals a strong data dependency
Deng, L., Ly, C., Abdollahi, S., Zhao, Y., Prinz, I. & Bonn, S., 18.04.2023, in: FRONT IMMUNOL. 14, S. 1128326Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Expansion-enhanced super-resolution radial fluctuations enable nanoscale molecular profiling of pathology specimens
Kylies, D., Zimmermann, M., Haas, F., Schwerk, M., Kuehl, M., Brehler, M., Czogalla, J., Hernandez, L. C., Konczalla, L., Okabayashi, Y., Menzel, J., Edenhofer, I., Mezher, S., Aypek, H., Dumoulin, B., Wu, H., Hofmann, S., Kretz, O., Wanner, N., Tomas, N. M., Krasemann, S., Glatzel, M., Kuppe, C., Kramann, R., Banjanin, B., Schneider, R. K., Urbschat, C., Arck, P., Gagliani, N., van Zandvoort, M., Wiech, T., Grahammer, F., Sáez, P. J., Wong, M. N., Bonn, S., Huber, T. B. & Puelles, V. G., 04.2023, in: NAT NANOTECHNOL. 18, 4, S. 336-342 7 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › Letter › Forschung › Begutachtung
CD4+ T cells produce GM-CSF and drive immune-mediated glomerular disease by licensing monocyte-derived cells to produce MMP12
Paust, H-J., Song, N., De Feo, D., Asada, N., Tuzlak, S., Zhao, Y., Riedel, J-H., Hellmig, M., Sivayoganathan, A., Peters, A., Kaffke, A., Borchers, A., Wenzel, U. O., Steinmetz, O. M., Tiegs, G., Meister, E., Mack, M., Kurts, C., von Vietinghoff, S., Lindenmeyer, M. T., Hoxha, E., Stahl, R. A. K., Huber, T. B., Bonn, S., Meyer-Schwesinger, C., Wiech, T., Turner, J-E., Becher, B., Krebs, C. F. & Panzer, U., 15.03.2023, in: SCI TRANSL MED. 15, 687, eadd6137.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Pathogen detection in RNA-seq data with Pathonoia
Liebhoff, A-M., Menden, K., Laschtowitz, A., Franke, A., Schramm, C. & Bonn, S., 17.02.2023, in: BMC BIOINFORMATICS. 24, 1, 53.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Multicytokine-producing CD4+ T cells characterize the livers of patients with NASH
Woestemeier, A., Scognamiglio, P., Zhao, Y., Wagner, J., Muscate, F., Casar, C., Siracusa, F., Cortesi, F., Agalioti, T., Müller, S., Sagebiel, A., Konczalla, L., Wahib, R., Karstens, K-F., Giannou, A. D., Duprée, A., Wolter, S., Wong, M. N., Mühlig, A. K., Bielecka, A. A., Bansal, V., Zhang, T., Mann, O., Puelles, V. G., Huber, T. B., Lohse, A. W., Izbicki, J. R., Palm, N. W., Bonn, S., Huber, S. & Gagliani, N., 10.01.2023, in: JCI INSIGHT. 8, 1, e153831.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Single-cell transcriptomics reveals a mechanosensitive injury signaling pathway in early diabetic nephropathy
Liu, S., Zhao, Y., Lu, S., Zhang, T., Lindenmeyer, M. T., Nair, V., Gies, S. E., Wu, G., Nelson, R. G., Czogalla, J., Aypek, H., Zielinski, S., Liao, Z., Schaper, M., Fermin, D., Cohen, C. D., Delic, D., Krebs, C. F., Grahammer, F., Wiech, T., Kretzler, M., Meyer-Schwesinger, C., Bonn, S. & Huber, T. B., 10.01.2023, in: GENOME MED. 15, 1, S. 2Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
- 2022
ERR2 and ERR3 promote the development of gamma motor neuron functional properties required for proprioceptive movement control
Khan, M. N., Cherukuri, P., Negro, F., Rajput, A., Fabrowski, P., Bansal, V., Lancelin, C., Lee, T-I., Bian, Y., Mayer, W. P., Akay, T., Müller, D., Bonn, S., Farina, D. & Marquardt, T., 21.12.2022, in: PLOS BIOL. 20, 12, e3001923.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Correction: Tagger-A Swiss army knife for multiomics to dissect cell type-specific mechanisms of gene expression in mice
Kaczmarczyk, L., Bansal, V., Rajput, A., Rahman, R-U., Krzyżak, W., Degen, J., Poll, S., Fuhrmann, M., Bonn, S. & Jackson, W. S., 01.11.2022, in: PLOS BIOL. 20, 11, e3001882.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › Andere (Vorworte u.ä.) › Forschung
Pregnancy-induced maternal microchimerism shapes neurodevelopment and behavior in mice
Schepanski, S., Chini, M., Sternemann, V., Urbschat, C., Thiele, K., Sun, T., Zhao, Y., Poburski, M., Woestemeier, A., Thieme, M-T., Zazara, D. E., Alawi, M., Fischer, N., Heeren, J., Vladimirov, N., Woehler, A., Puelles, V. G., Bonn, S., Gagliani, N., Hanganu-Opatz, I. L. & Arck, P. C., 05.08.2022, in: NAT COMMUN. 13, 1, 4571.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Distinct translatome changes in specific neural populations precede electroencephalographic changes in prion-infected mice
Kaczmarczyk, L., Schleif, M., Dittrich, L., Williams, R. H., Koderman, M., Bansal, V., Rajput, A., Schulte, T., Jonson, M., Krost, C., Testaquadra, F. J., Bonn, S. & Jackson, W. S., 08.2022, in: PLOS PATHOG. 18, 8, e1010747.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Th17 cell plasticity towards a T-bet-dependent Th1 phenotype is required for bacterial control in Staphylococcus aureus infection
Bartsch, P., Kilian, C., Hellmig, M., Paust, H-J., Borchers, A., Sivayoganathan, A., Enk, L., Zhao, Y., Shaikh, N., Büttner, H., Wong, M. N., Puelles, V. G., Wiech, T., Flavell, R., Huber, T. B., Turner, J-E., Bonn, S., Huber, S., Gagliani, N., Mittrücker, H-W., Rohde, H., Panzer, U. & Krebs, C. F., 04.2022, in: PLOS PATHOG. 18, 4, S. e1010430Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
- 2021
Towards Explainable End-to-End Prostate Cancer Relapse Prediction from H&E Images Combining Self-Attention Multiple Instance Learning with a Recurrent Neural Network
Dietrich, E., Fuhlert, P., Ernst, A., Sauter, G., Lennartz, E. M. H., Stiehl, S., Zimmermann, M. & Bonn, S., 26.11.2021, Machine Learning for Health (ML4H) 2021: Proceedings of Machine Learning Research LEAVE UNSET:1–16, 2021. Cornell University, Band 158. S. 38-53 16 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › Konferenzbeitrag - Poster › Forschung
Neuronal cholesterol synthesis is essential for repair of chronically demyelinated lesions in mice
Berghoff, S. A., Spieth, L., Sun, T., Hosang, L., Depp, C., Sasmita, A. O., Vasileva, M. H., Scholz, P., Zhao, Y., Krueger-Burg, D., Wichert, S., Brown, E. R., Michail, K., Nave, K-A., Bonn, S., Odoardi, F., Rossner, M., Ischebeck, T., Edgar, J. M. & Saher, G., 26.10.2021, in: CELL REP. 37, 4, 109889.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Bias-invariant RNA-sequencing metadata annotation
Wartmann, H., Heins, S., Kloiber, K. & Bonn, S., 22.09.2021, in: GIGASCIENCE. 10, 9, S. giab064Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Single-cell biology to decode the immune cellular composition of kidney inflammation.
Zhao, Y., Panzer, U., Bonn, S. & Krebs, C., 08.2021, in: CELL TISSUE RES. 385, 2, S. 435-443 9 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Review › Forschung
Deep Learning-Based Bias Transfer for Overcoming Laboratory Differences of Microscopic Images
Thebille, A-K., Dietrich, E., Klaus, M., Gernhold, L., Lennartz, E. M. H., Kuppe, C., Kramann, R., Huber, T., Sauter, G., Puelles, V., Zimmermann, M. & Bonn, S., 06.07.2021, Annual Conference on Medical Image Understanding and Analysis: 25th Annual Conference, MIUA 2021, Oxford, United Kingdom, July 12–14, 2021, Proceedings. Papież, B. W., Yaqub, M., Jiao, J., Namburete, A. I. L. & Noble, J. A. (Hrsg.). 1 Aufl. Oxford: Springer Nature Switzerland AG, S. 322-336 15 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › Konferenzbeitrag - Aufsatz in Konferenzband › Forschung › Begutachtung
Hippocampal neurons respond to brain activity with functional hypoxia
Butt, U. J., Steixner-Kumar, A. A., Depp, C., Sun, T., Hassouna, I., Wüstefeld, L., Arinrad, S., Zillmann, M. R., Schopf, N., Fernandez Garcia-Agudo, L., Mohrmann, L., Bode, U., Ronnenberg, A., Hindermann, M., Goebbels, S., Bonn, S., Katschinski, D. M., Miskowiak, K. W., Nave, K-A. & Ehrenreich, H., 06.2021, in: MOL PSYCHIATR. 26, 6, S. 1790-1807 18 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Interactive gene networks with KNIT
Magruder, D. S., Liebhoff, A. M., Bethune, J. & Bonn, S., 19.04.2021, in: BIOINFORMATICS. 37, 2, S. 276-278 3 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Deep learning-based molecular morphometrics for kidney biopsies
Zimmermann, M., Klaus, M., Wong, M. N., Thebille, A-K., Gernhold, L., Kuppe, C., Halder, M., Kranz, J., Wanner, N., Braun, F., Wulf, S., Wiech, T., Panzer, U., Krebs, C. F., Hoxha, E., Kramann, R., Huber, T. B., Bonn, S. & Puelles, V. G., 08.04.2021, in: JCI INSIGHT. 6, 7, S. e144779Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Algorithmic advances in machine learning for single-cell expression analysis
Oller, S., Kloiber, K., Machart, P. & Bonn, S., 03.2021, in: CURR OPIN SYST BIOL. 2021, 25, S. 27-33 7 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Clonal expansion and activation of tissue-resident memory-like Th17 cells expressing GM-CSF in the lungs of severe COVID-19 patients
Zhao, Y., Kilian, C., Turner, J. E., Bosurgi, L., Roedl, K., Bartsch, P., Gnirck, A. C., Cortesi, F., Schultheiß, C., Hellmig, M., Enk, L. U. B., Hausmann, F., Borchers, A., Wong, M. N., Paust, H. J., Siracusa, F., Scheibel, N., Herrmann, M., Rosati, E., Bacher, P., Kylies, D., Jarczak, D., Lütgehetmann, M., Pfefferle, S., Steurer, S., Zur Wiesch, J. S., Puelles, V. G., Sperhake, J. P., Addo, M. M., Lohse, A. W., Binder, M., Huber, S., Huber, T. B., Kluge, S., Bonn, S., Panzer, U., Gagliani, N. & Krebs, C. F., 23.02.2021, in: SCI IMMUNOL. 6, 56, eabf6692.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Protein phosphorylation in depolarized synaptosomes: Dissecting primary effects of calcium from synaptic vesicle cycling
Silbern, I., Pan, K-T., Fiosins, M., Bonn, S., Rizzoli, S. O., Fornasiero, E. F., Urlaub, H. & Jahn, R., 12.02.2021, in: MOL CELL PROTEOMICS. 20, 100061.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
- 2020
Neuropathology of patients with COVID-19 in Germany: a post-mortem case series
Matschke, J., Lütgehetmann, M., Hagel, C., Sperhake, J. P., Schröder, A. S., Edler, C., Mushumba, H., Fitzek, A., Allweiss, L., Dandri, M., Dottermusch, M., Heinemann, A., Pfefferle, S., Schwabenland, M., Sumner Magruder, D., Bonn, S., Prinz, M., Gerloff, C., Püschel, K., Krasemann, S., Aepfelbacher, M. & Glatzel, M., 11.2020, in: LANCET NEUROL. 19, 11, S. 919-929 11 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
SUMOylation controls the neurodevelopmental function of the transcription factor Zbtb20
Ripamonti, S., Shomroni, O., Rhee, J. S., Chowdhury, K., Jahn, O., Hellmann, K. P., Bonn, S., Brose, N. & Tirard, M., 09.2020, in: J NEUROCHEM. 154, 6, S. 647-661 15 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Pathogen-induced tissue-resident memory TH17 (TRM17) cells amplify autoimmune kidney disease
Krebs, C. F., Reimers, D., Zhao, Y., Paust, H-J., Bartsch, P., Nuñez, S., Rosemblatt, M. V., Hellmig, M., Kilian, C., Borchers, A., Enk, L. U. B., Zinke, M., Becker, M., Schmid, J., Klinge, S., Wong, M. N., Puelles, V. G., Schmidt, C., Bertram, T., Stumpf, N., Hoxha, E., Meyer-Schwesinger, C., Lindenmeyer, M. T., Cohen, C. D., Rink, M., Kurts, C., Franzenburg, S., Koch-Nolte, F., Turner, J-E., Riedel, J-H., Huber, S., Gagliani, N., Huber, T. B., Wiech, T., Rohde, H., Bono, M. R., Bonn, S., Panzer, U. & Mittrücker, H-W., 07.08.2020, in: SCI IMMUNOL. 5, 50, eaba4163.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Deep learning-based cell composition analysis from tissue expression profiles
Menden, K., Marouf, M., Oller, S., Dalmia, A., Magruder, D. S., Kloiber, K., Heutink, P. & Bonn, S., 22.07.2020, in: SCI ADV. 6, 30, S. eaba2619Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Functional hypoxia drives neuroplasticity and neurogenesis via brain erythropoietin
Wakhloo, D., Scharkowski, F., Curto, Y., Javed Butt, U., Bansal, V., Steixner-Kumar, A. A., Wüstefeld, L., Rajput, A., Arinrad, S., Zillmann, M. R., Seelbach, A., Hassouna, I., Schneider, K., Qadir Ibrahim, A., Werner, H. B., Martens, H., Miskowiak, K., Wojcik, S. M., Bonn, S., Nacher, J., Nave, K-A. & Ehrenreich, H., 09.03.2020, in: NAT COMMUN. 11, 1, S. 1313Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
CRISPLD1: a novel conserved target in the transition to human heart failure
Khadjeh, S., Hindmarsh, V., Weber, F., Cyganek, L., Vidal, R. O., Torkieh, S., Streckfuss-Bömeke, K., Lbik, D., Tiburcy, M., Mohamed, B. A., Bonn, S., Toischer, K. & Hasenfuss, G., 07.03.2020, in: BASIC RES CARDIOL. 115, 3, S. 27Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Explainable Deep Learning for Augmentation of Small RNA Expression Profiles
Fiosina, J., Fiosins, M. & Bonn, S., 01.02.2020, in: J COMPUT BIOL.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Realistic in silico generation and augmentation of single-cell RNA-seq data using generative adversarial networks
Marouf, M., Machart, P., Bansal, V., Kilian, C., Magruder, D. S., Krebs, C. F. & Bonn, S., 09.01.2020, in: NAT COMMUN. 11, 1, S. 166Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
SEAweb: the small RNA Expression Atlas web application
Rahman, R-U., Liebhoff, A-M., Bansal, V., Fiosins, M., Rajput, A., Sattar, A., Magruder, D. S., Madan, S., Sun, T., Gautam, A., Heins, S., Liwinski, T., Bethune, J., Trenkwalder, C., Fluck, J., Mollenhauer, B. & Bonn, S., 08.01.2020, in: NUCLEIC ACIDS RES. 48, D1, S. D204-D219Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Organ-specific small non-coding RNA responses in domestic (Sudani) ducks experimentally infected with highly pathogenic avian influenza virus (H5N1)
Samir, M., Vidal, R. O., Abdallah, F., Capece, V., Seehusen, F., Geffers, R., Hussein, A., Ali, A. A. H., Bonn, S. & Pessler, F., 01.2020, in: RNA BIOL. 17, 1, S. 112-124 13 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
- 2019
The long noncoding RNA neuroLNC regulates presynaptic activity by interacting with the neurodegeneration-associated protein TDP-43
Keihani, S., Kluever, V., Mandad, S., Bansal, V., Rahman, R., Fritsch, E., Gomes, L. C., Gärtner, A., Kügler, S., Urlaub, H., Wren, J. D., Bonn, S., Rizzoli, S. O. & Fornasiero, E. F., 18.12.2019, in: SCI ADV. 5, 12, S. eaay2670Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Violent aggression predicted by multiple pre-adult environmental hits
Mitjans, M., Seidel, J., Begemann, M., Bockhop, F., Moya-Higueras, J., Bansal, V., Wesolowski, J., Seelbach, A., Ibáñez, M. I., Kovacevic, F., Duvar, O., Fañanás, L., Wolf, H-U., Ortet, G., Zwanzger, P., Klein, V., Lange, I., Tänzer, A., Dudeck, M., Penke, L., van Elst, L. T., Bittner, R. A., Schmidmeier, R., Freese, R., Müller-Isberner, R., Wiltfang, J., Bliesener, T., Bonn, S., Poustka, L., Müller, J. L., Arias, B. & Ehrenreich, H., 10.2019, in: MOL PSYCHIATR. 24, 10, S. 1549-1564 16 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Tagger-A Swiss army knife for multiomics to dissect cell type-specific mechanisms of gene expression in mice
Kaczmarczyk, L., Bansal, V., Rajput, A., Rahman, R-U., Krzyżak, W., Degen, J., Poll, S., Fuhrmann, M., Bonn, S. & Jackson, W. S., 08.2019, in: PLOS BIOL. 17, 8, S. e3000374Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
DNA Methyltransferase 1 Controls Nephron Progenitor Cell Renewal and Differentiation
Wanner, N., Vornweg, J., Combes, A., Wilson, S., Plappert, J., Rafflenbeul, G., Puelles, V. G., Rahman, R-U., Liwinski, T., Lindner, S., Grahammer, F., Kretz, O., Wlodek, M. E., Romano, T., Moritz, K. M., Boerries, M., Busch, H., Bonn, S., Little, M. H., Bechtel-Walz, W. & Huber, T. B., 01.2019, in: J AM SOC NEPHROL. 30, 1, S. 63-78 16 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung