Dr.rer.nat. ID: 41291
Rene Werner
Publikationen
- 2024
Deep learning-based conditional inpainting for restoration of artifact-affected 4D CT images
Madesta, F., Sentker, T., Gauer, T. & Werner, R., 05.2024, in: MED PHYS. 51, 5, S. 3437-3454 18 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Spatial normalization for voxel-based lesion symptom mapping: impact of registration approaches
Jühling, D., Rajashekar, D., Cheng, B., Hilgetag, C. C., Forkert, N. D. & Werner, R., 17.01.2024, in: FRONT NEUROSCI-SWITZ. 18, S. 1296357Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
DARTS: an open-source Python pipeline for Ca2+ microdomain analysis in live cell imaging data
Woelk, L-M., Kovacevic, D., Husseini, H., Förster, F., Gerlach, F., Möckl, F., Altfeld, M., Guse, A. H., Diercks, B-P. & Werner, R., 11.01.2024, in: FRONT IMMUNOL. 14, S. 1299435Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Deep Image Prior for Spatio-temporal Fluorescence Microscopy Images: DECO-DIP
Meyer, L., Woelk, L-M., Gee, C., Lohr, C., Arcot Kannabiran, S., Diercks, B-P. & Werner, R., 2024, Bildverarbeitung für die Medizin 2024: Proceedings, German Conference on Medical Image Computing, Erlangen, March 10–12, 2024. Maier, A., Deserno, TM., Handels, H., Maier-Hein, K., Palm, C. & Tolxdorff, TM. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer Vieweg, S. 322-327 6 S. (Informatik Aktuell).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Time-resolved role of P2X4 and P2X7 during CD8+ T cell activation
Brock, V. J., Lory, N. C., Möckl, F., Birus, M., Stähler, T., Woelk, L-M., Jaeckstein, M., Heeren, J., Koch-Nolte, F., Rissiek, B., Mittrücker, H-W., Guse, A. H., Werner, R. & Diercks, B-P., 2024, in: FRONT IMMUNOL. 15, S. 1258119Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
- 2023
Dose reduction in sequence scanning 4D CT imaging through respiratory signal-guided tube current modulation: A feasibility study
Schwarz, A., Werner, R., Wimmert, L., Vornehm, M., Gauer, T. & Hofmann, C., 12.2023, in: MED PHYS. 50, 12, S. 7539-7547 9 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Self-Supervision for Medical Image Classification: State-of-the-Art Performance with ~100 Labeled Training Samples per Class
Nielsen, M., Wenderoth, L., Sentker, T. & Werner, R., 28.07.2023, in: BIOENGINEERING-BASEL. 10, 8, 14 S., 895.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Clinical application of breathing-adapted 4D CT: image quality comparison to conventional 4D CT
Werner, R., Szkitsak, J., Madesta, F., Büttgen, L., Wimmert, L., Sentker, T., Fietkau, R., Haderlein, M., Bert, C., Gauer, T. & Hofmann, C., 07.2023, in: STRAHLENTHER ONKOL. 199, 7, S. 686-691 6 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › Kurzpublikation › Forschung › Begutachtung
Adhesion to laminin-1 and collagen IV induces the formation of Ca2+ microdomains that sensitize mouse T cells for activation
Weiß, M., Hernandez, L. C., Gil Montoya, D. C., Löhndorf, A., Krüger, A., Kopdag, M., Uebler, L., Landwehr, M., Nawrocki, M., Huber, S., Woelk, L-M., Werner, R., Failla, A. V., Flügel, A., Dupont, G., Guse, A. H. & Diercks, B-P., 20.06.2023, in: SCIENCE SIGNALING. 16, 790, S. eabn9405Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Extending Tempcyclegan for Virtual Augmentation of Gastrointestinal Endoscopy Training Simulators
Wallrodt, M., Schulz-Alsen, M., Ehlken, H., Rösch, T., Schmitz, R. & Werner, R., 02.06.2023, Bildverarbeitung für die Medizin 2023: Proceedings, German Workshop on Medical Image Computing, Braunschweig, July 2-4, 2023. Deserno, T. M., Handels, H., Maier, A., Maier-Hein, K., Palm, C. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer Vieweg, S. 3-8 6 S. (Informatik aktuell).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Label Efficient Classification in Liquid Biopsy Data by Self-supervision
Husseini, H., Nielsen, M., Pantel, K., Wikman, H., Riethdorf, S. & Werner, R., 02.06.2023, Bildverarbeitung für die Medizin 2023: Proceedings, German Workshop on Medical Image Computing, Braunschweig, July 2-4, 2023. Deserno, T. M., Handels, H., Maier, A., Maier-Hein, K., Palm, C. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer Vieweg, S. 261-266 6 S. (Informatik aktuell).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Discordant and Converting Receptor Expressions in Brain Metastases from Breast Cancer: MRI-Based Non-Invasive Receptor Status Tracking
Heitkamp, A., Madesta, F., Amberg, S., Wahaj, S., Schröder, T., Bechstein, M., Meyer, L., Broocks, G., Hanning, U., Gauer, T., Werner, R., Fiehler, J., Gellißen, S. & Kniep, H. C., 23.05.2023, in: CANCERS. 15, 11, 2880.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
- 2022
Dekonvolution von Mikroskopiedaten bei niedrigem Signal-Rausch-Verhältnis
Woelk, L-M., Diercks, B-P. & Werner, R., 11.2022, in: BIOspektrum. 2022, 28, S. 720-722Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Evaluation of magnetic resonance imaging-based radiomics characteristics for differentiation of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors in neurofibromatosis type 1
Ristow, I., Madesta, F., Well, L., Shenas, F. Y., Wright, F., Molwitz, I., Farschtschi, S., Bannas, P., Adam, G., Mautner, V. F., Werner, R. & Salamon, J., 03.10.2022, in: NEURO-ONCOLOGY. 24, 10, S. 1790-1798 9 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Reinforcement learning-basierte Patchpriorisierung zur beschleunigten Segmentierung von hochauflösenden Endoskopievideodaten
Schüttler, S., Madesta, F., Rösch, T., Werner, R. & Schmitz, R., 05.04.2022, Informatik aktuell: Bildverarbeitung für die Medizin. Klaus, M-H., Deserno, T. M., Handels, H., Maier, A., Palm, C. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Wiesbaden: Springer Vieweg, S. 339-344 6 S. (Bildverarbeitung für die Medizin 2022).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Artificial intelligence in GI endoscopy: stumbling blocks, gold standards and the role of endoscopy societies
Schmitz, R., Werner, R., Repici, A., Bisschops, R., Meining, A., Zornow, M., Messmann, H., Hassan, C., Sharma, P. & Rösch, T., 03.2022, in: GUT. 71, 3, S. 451-454 4 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › Andere (Vorworte u.ä.) › Forschung
P2X4 and P2X7 are essential players in basal T cell activity and Ca2+ signaling milliseconds after T cell activation
Brock, V. J., Wolf, I. M. A., Er-Lukowiak, M., Lory, N., Stähler, T., Woelk, L-M., Mittrücker, H-W., Müller, C. E., Koch-Nolte, F., Rissiek, B., Werner, R., Guse, A. H. & Diercks, B-P., 04.02.2022, in: SCI ADV. 8, 5, eabl9770.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
- 2021
Dual NADPH oxidases DUOX1 and DUOX2 synthesize NAADP and are necessary for Ca2+ signaling during T cell activation
Gu, F., Krüger, A., Roggenkamp, H. G., Alpers, R., Lodygin, D., Jaquet, V., Möckl, F., Hernandez C, L. C., Winterberg, K., Bauche, A., Rosche, A., Grasberger, H., Kao, J. Y., Schetelig, D., Werner, R., Schröder, K., Carty, M., Bowie, A. G., Huber, S., Meier, C., Mittrücker, H-W., Heeren, J., Krause, K-H., Flügel, A., Diercks, B-P. & Guse, A. H., 16.11.2021, in: SCIENCE SIGNALING. 14, 709, eabe3800.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Deep Learning-Based Automated Thrombolysis in Cerebral Infarction Scoring: A Timely Proof-of-Principle Study
Nielsen, M., Waldmann, M., Frölich, A. M., Flottmann, F., Hristova, E., Bendszus, M., Seker, F., Fiehler, J., Sentker, T. & Werner, R., 11.2021, in: STROKE. 52, 11, S. 3497-3504 8 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Time-Dependent Image Restoration of Low-SNR Live-Cell Ca2+ Fluorescence Microscopy Data
Woelk, L-M., Kannabiran, S. A., Brock, V. J., Gee, C. E., Lohr, C., Guse, A. H., Diercks, B-P. & Werner, R., 30.10.2021, in: INT J MOL SCI. 22, 17 S., 11792.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
First clinical evaluation of breathing controlled four-dimensional computed tomography imaging
Szkitsak, J., Werner, R., Fernolendt, S., Schwarz, A., Ott, O. J., Fietkau, R., Hofmann, C. & Bert, C., 10.2021, in: PHYS IMAG RADIAT ONC. 20, S. 56-61 6 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Multi-scale fully convolutional neural networks for histopathology image segmentation: From nuclear aberrations to the global tissue architecture
Schmitz, R., Madesta, F., Nielsen, M., Krause, J., Steurer, S., Werner, R. & Rösch, T., 05.2021, in: MED IMAGE ANAL. 70, S. 101996 14 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Spatio-temporal feature learning with reservoir computing for T-cell segmentation in live-cell Ca2+ fluorescence microscopy
Hadaeghi, F., Diercks, B-P., Schetelig, D., Damicelli, F., Wolf, I. M. A. & Werner, R., 15.04.2021, in: SCI REP-UK. 11, 1, 8233.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
HN1L/JPT2: A signaling protein that connects NAADP generation to Ca2+ microdomain formation
Roggenkamp, H. G., Khansahib, I., Hernandez C, L. C., Zhang, Y., Lodygin, D., Krüger, A., Gu, F., Möckl, F., Löhndorf, A., Wolters, V., Woike, D., Rosche, A., Bauche, A., Schetelig, D., Werner, R., Schlüter, H., Failla, A. V., Meier, C., Fliegert, R., Walseth, T. F., Flügel, A., Diercks, B-P. & Guse, A. H., 23.03.2021, in: SCI SIGNAL. 14, 675Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Comparison of intelligent 4D CT sequence scanning and conventional spiral 4D CT: a first comprehensive phantom study
Werner, R., Szkitsak, J., Sentker, T., Madesta, F., Schwarz, A., Fernolendt, S., Vornehm, M., Gauer, T., Bert, C. & Hofmann, C., 08.01.2021, in: PHYS MED BIOL. 66, 1, 10 S., 015004.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
PAIP 2019: Liver cancer segmentation challenge
Kim, Y. J., Jang, H., Lee, K., Park, S., Min, S-G., Hong, C., Park, J. H., Lee, K., Kim, J., Hong, W., Jung, H., Liu, Y., Rajkumar, H., Khened, M., Krishnamurthi, G., Yang, S., Wang, X., Han, C. H., Kwak, J. T., Ma, J., Tang, Z., Marami, B., Zeineh, J., Zhao, Z., Heng, P-A., Schmitz, R., Madesta, F., Rösch, T., Werner, R., Tian, J., Puybareau, E., Bovio, M., Zhang, X., Zhu, Y., Chun, S. Y., Jeong, W-K., Park, P. & Choi, J., 01.2021, in: MED IMAGE ANAL. 67, S. 101854 16 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Reduktion der Kalibrierungszeit für die Magnetpartikelbildgebung mittels Deep Learning
Baltruschat, I. M., Szwargulski, P., Griese, F., Grosser, M., Werner, R. & Knopp, T., 2021, Bildverarbeitung für die Medizin 2021 - Proceedings, German Workshop on Medical Image Computing, 2021. Palm, C., Handels, H., Maier-Hein, K., Deserno, T. M., Maier, A. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). Springer Science and Business Media Deutschland GmbH, S. 337 1 S. (Informatik aktuell).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › Konferenzbeitrag - Aufsatz in Konferenzband › Forschung › Begutachtung
Single Image-Based Vignetting Correction for Improving the Consistency of Neural Activity Analysis in 2-Photon Functional Microscopy
Li, D., Wang, G., Werner, R., Xie, H., Guan, J-S. & Hilgetag, C-C., 2021, in: FRONT NEUROINFORM. 15, S. 674439 674439.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
- 2020
Digital Health meets Hamburg integrated medical degree program iMED: Concept and introduction of the new interdisciplinary 2nd track Digital Health
Werner, R., Henningsen, M., Schmitz, R., Guse, A. H., Augustin, M. & Gauer, T., 16.11.2020, in: GMS Journal for Medical Education. 37, 6, S. Doc61 10 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Lehre › Begutachtung
Self-contained deep learning-based boosting of 4D cone-beam CT reconstruction
Madesta, F., Sentker, T., Gauer, T. & Werner, R., 11.2020, in: MED PHYS. 47, 11, S. 5619-5631 13 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Künstliche Intelligenz in der Medizin
Werner, R. & Schmitz, R., 21.10.2020, Digitale Medizin. Matusiewicz, D., Henningsen, M. & Ehlers, J. P. (Hrsg.). 1 Aufl. Medizinisch Wissenschaftliche Verlagsgesellschaft, S. 125-138 14 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
3d-SMRnet: Achieving a New Quality of MPI System Matrix Recovery by Deep Learning
Baltruschat, I. M., Szwargulski, P. K., Griese, F., Grosser, M., Werner, R. & Knopp, T., 10.2020, Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2020: 23rd International Conference, Lima, Peru, October 4–8, 2020, Proceedings, Part II. 1 Aufl. Springer Nature Switzerland, S. 74-82 9 S. (Lecture Notes in Computer Science (LNCS); Nr. 12262).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Time Matters: Handling Spatio-Temporal Perfusion Information for Automated TICI Scoring
Nielsen, M., Waldmann, M., Sentker, T., Frölich, A., Fiehler, J. & Werner, R., 10.2020, MICCAI 2020. 1 Aufl. Springer Nature Switzerland, Band 12266. S. 86-96 11 S. (Lecture Notes in Computer Science (LNCS)).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Widening the Focus: Biomedical Image Segmentation Challenges and the Underestimated Role of Patch Sampling and Inference Strategies
Madesta, F., Schmitz, R., Rösch, T. & Werner, R., 10.2020, MICCAI 2020. 1 Aufl. Springer Nature Switzerland, Band 12264. S. 289-298 10 S. (Lecture Notes in Computer Science (LNCS)).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
4D CT image artifacts affect local control in SBRT of lung and liver metastases
Sentker, T., Schmidt, V., Ozga, A-K., Petersen, C., Madesta, F., Hofmann, C., Werner, R. & Gauer, T., 07.2020, in: RADIOTHER ONCOL. 148, S. 229-234 6 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Intelligent 4D CT sequence scanning (i4DCT): First scanner prototype implementation and phantom measurements of automated breathing signal-guided 4D CT
Werner, R., Sentker, T., Madesta, F., Schwarz, A., Vornehm, M., Gauer, T. & Hofmann, C., 06.2020, in: MED PHYS. 47, 6, S. 2408-2412 5 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Technological quality requirements for stereotactic radiotherapy: Expert review group consensus from the DGMP Working Group for Physics and Technology in Stereotactic Radiotherapy
Schmitt, D., Blanck, O., Gauer, T., Fix, M. K., Brunner, T. B., Fleckenstein, J., Loutfi-Krauss, B., Manser, P., Werner, R., Wilhelm, M-L., Baus, W. W. & Moustakis, C., 05.2020, in: STRAHLENTHER ONKOL. 196, 5, S. 421-443 23 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Review › Forschung
Reservoir Computing for Jurkat T-cell Segmentation in High Resolution Live Cell Ca2+ Fluorescence Microscopy
Hadäghi, F., Diercks, B-P., Wolf, I. & Werner, R., 01.04.2020, in: Proc IEEE ISBI 2020. 1, S. 1587-1591 5 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Combining Direct 3D Volume Rendering and Magnetic Particle Imaging to Advance Radiation-Free Real-Time 3D Guidance of Vascular Interventions
Weller, D., Salamon, J. M., Frölich, A., Möddel, M., Knopp, T. & Werner, R., 02.2020, in: CARDIOVASC INTER RAD. 43, 2, S. 322-330 9 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Skin Lesion Classification Using CNNs with Patch-Based Attention and Diagnosis-Guided Loss Weighting
Gessert, N., Sentker, T., Madesta, F., Schmitz, R., Kniep, H., Baltruschat, I., Werner, R. & Schlaefer, A., 02.2020, in: IEEE T BIO-MED ENG. 67, 2, S. 495-503 9 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Künstliche Intelligenz in der Endoskopie: Neuronale Netze und maschinelles Sehen – Techniken und Perspektiven (reprint Z Gastroenterol 2019; 57(06): 767-780)
Schmitz, R., Werner, R. & Rösch, T., 2020, in: Endo-Praxis. 2020, 36, S. 30-43Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › Andere (Vorworte u.ä.) › Forschung
Skin lesion classification using ensembles of multi-resolution EfficientNets with meta data
Gessert, N., Nielsen, M., Shaikh, M., Werner, R. & Schlaefer, A., 2020, in: METHODSX. 7, 7, S. 100864 8 S., 100864.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
- 2019
Intelligent 4D CT sequence scanning (i4DCT): Concept and performance evaluation
Werner, R., Sentker, T., Madesta, F., Gauer, T. & Hofmann, C., 13.08.2019, in: MED PHYS. 46, 8, S. 3462-3474 13 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Künstliche Intelligenz in der Endoskopie: Neuronale Netze und maschinelles Sehen – Techniken und Perspektiven
Schmitz, R., Werner, R. & Rösch, T., 06.2019, in: Z GASTROENTEROL. 57, 6, S. 767-780 14 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Review › Forschung
Discrimination of the hierarchical structure of cortical layers in 2-photon microscopy data by combined unsupervised and supervised machine learning
Li, D., Zavaglia, M., Wang, G., Xie, H., Hu, Y., Werner, R., Guan, J-S. & Hilgetag, C. C., 15.05.2019, in: SCI REP-UK. 9, 1, S. 7424Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Self-consistent deep learning-based boosting of 4D cone-beam computed tomography reconstruction
Madesta, F., Gauer, T., Sentker, T. & Werner, R., 15.03.2019, Medical Imaging 2019: Image Processing. 1 Aufl. SPIE , Band 10949. S. 1094902 6 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Toward employing the full potential of magnetic particle imaging: exploring visualization techniques and clinical use cases for real-time 3D vascular imaging
Werner, R., Weller, D., Salamon, J. M., Möddel, M. & Knopp, T., 15.03.2019, Medical Imaging 2019: Biomedical Applications in Molecular, Structural, and Functional Imaging. 1 Aufl. SPIE , Band 10953. S. 109531V 6 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Patient-specific 4D Monte Carlo dose accumulation using correspondence-model-based motion prediction
Sentker, T., Madesta, F. & Werner, R., 08.03.2019, Medical Imaging 2019: Image-Guided Procedures, Robotic Interventions, and Modeling. Fei, B. & Linte, C. A. (Hrsg.). 1 Aufl. SPIE , Band 10951. S. 1095109 7 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Machbarkeitsstudie zur CNN-basierten Identifikation und TICI-Klassifizierung zerebraler ischämischer Infarkte in DSA-Daten
Nielsen, M., Waldmann, M., Frölich, A., Fiehler, J. & Werner, R., 07.02.2019, Bildverarbeitung für die Medizin 2019: Algorithmen – Systeme – Anwendungen. Proceedings des Workshops vom 17. bis 19. März 2019 in Lübeck. 1 Aufl. Springer Vieweg, S. 200-205 6 S. (Informatik aktuell).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Radiomics of Brain MRI: Utility in Prediction of Metastatic Tumor Type
Kniep, H. C., Madesta, F., Schneider, T., Hanning, U., Schönfeld, M. H., Schön, G., Fiehler, J., Gauer, T., Werner, R. & Gellissen, S., 02.2019, in: RADIOLOGY. 290, 2, S. 479-487 9 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Combining Good Old Random Forest and DeepLabv3+ for ISLES 2018 CT-Based Stroke Segmentation
Böhme, L., Madesta, F., Sentker, T. & Werner, R., 26.01.2019, Brainlesion: Glioma, Multiple Sclerosis, Stroke and Traumatic Brain Injuries. 1 Aufl. Springer, S. 335-342 8 S. (Lecture Notes in Computer Science; Band 11383).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › Konferenzbeitrag - Aufsatz in Konferenzband › Forschung › Begutachtung
High-Resolution Calcium Imaging Method for Local Calcium Signaling
Diercks, B-P., Werner, R., Schetelig, D., Wolf, I. & Guse, A., 2019, Calcium-Binding Proteins of the EF-Hand Superfamily. 1 Aufl. Humana Press, Band 1929. S. 27-39 13 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
MRI-based field of view selection for precise, real-time targeting in MPI
Griese, F., Prieske, M., Möddel, M., Werner, R. & Knopp, T., 2019, 9th International Workshop on Magnetic Particle Imaging (IWMPI 2019). S. 207-208Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Wrestling the Devil of Wasting Time: MPI System Matrix Recovery by Deep Learning
Baltruschat, I. M., Griese, F., Szwargulski, P. K., Werner, R. & Knopp, T., 2019, 9th International Workschop on Magnetic Particle Imaging (IWMPI 2018) . 1 Aufl. Infinite Science PublishingPublikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
- 2018
ORAI1, STIM1/2, and RYR1 shape subsecond Ca2+ microdomains upon T cell activation.
Diercks, B-P., Werner, R., Weidemüller, P., Czarniak, F., Hernandez, L. C., Lehmann, C., Rosche, A., Krüger, A., Kaufmann, U., Vaeth, M., Failla, A., Zobiak, B., Kandil, F-I., Schetelig, D., Ruthenbeck, A., Meier, C., Lodygin, D., Flügel, A., Ren, D., Wolf, I., Feske, S. & Guse, A., 18.12.2018, in: SCIENCE SIGNALING. 11, 561, S. eaat0358Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
A new cerebral vessel benchmark dataset (CAPUT) for validation of image-based aneurysm deformation estimation algorithms
Schetelig, D., Frölich, A., Knopp, T. & Werner, R., 30.10.2018, in: SCI REP-UK. 8, 1, S. 15999 8 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
GDL-FIRE4D: Deep Learning-based fast 4D CT image registration
Sentker, T., Madesta, F. & Werner, R., 09.2018, Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2018. Frangi, A. F., Schnabel, J. A., Davatzikos, C., Alberola-López, C. & Fichtinger, G. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer, Band 11070. S. 765 - 773 9 S. (Lecture Notes in Computer Science).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Analysis of the influence of imaging-related uncertainties on cerebral aneurysm deformation quantification using a no-deformation physical flow phantom
Schetelig, D., Sedlacik, J., Fiehler, J., Frölich, A., Knopp, T., Sothmann, T., Waschkewitz, J. & Werner, R., 20.07.2018, in: SCI REP-UK. 8, 1, S. 11004 9 S., 11004.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Influence of deformable image registration on 4D dose simulation for extracranial SBRT: A multi-registration framework study
Mogadas, N., Sothmann, T., Knopp, T., Gauer, T., Petersen, C. & Werner, R., 05.2018, in: RADIOTHER ONCOL. 127, 2, S. 225-232 8 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Influence of 4D CT motion artifacts on correspondence model-based 4D dose accumulation
Sothmann, T., Gauer, T. & Werner, R., 12.03.2018, Medical Imaging 2018: Image-Guided Procedures, Robotic Interventions, and Modeling. Fei, B. & Webster, R. J. (Hrsg.). 1 Aufl. SPIE , Band 10576. S. 105760F-1 - 105760F-7 7 S. 105760F. (Progress in Biomedical Optics and Imaging).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Under-reported dosimetry errors due to interplay effects during VMAT dose delivery in extreme hypofractionated stereotactic radiotherapy
Gauer, T., Sothmann, T., Blanck, O., Petersen, C. & Werner, R., 01.02.2018, in: STRAHLENTHER ONKOL. 194, 6, S. 570-579Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Einfluss nicht-rigider Bildregistrierung auf 4D-Dosissimulation bei extrakranieller SBRT
Mogadas, N., Sothmann, T. & Werner, R., 2018, Bildverarbeitung für die Medizin: Algorithmen - Systeme - Anwendungen. Proceedings des Workshops vom 11. bis 13. März 2018 in Erlangen. Maier, A., Deserno, T., Handels, H., Maier-Hein, K., Palm, C. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer Vieweg, S. 188-193 6 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Self-reference-based and during-registration detection of motion artifacts in spatio-temporal image data
Mücke, E., Handels, H. & Werner, R., 2018, Medical Imaging 2018: Image Processing. Angelini, E. D. & Landman, B. A. (Hrsg.). 1 Aufl. SPIE , Band 10574. S. 10574-1 - 10574-7 7 S. (Proceedings of SPIE).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Technical considerations for automated low-pitch spiral 4D CT scanning protocol selection
Werner, R., Sothmann, T., Madesta, F., Gauer, T. & Hofmann, C., 2018, Medical Imaging 2018: Physics of Medical Imaging. Lo, J. Y., Schmidt, T. G. & Chen, G-H. (Hrsg.). 1 Aufl. SPIE , Band 10573. S. 105733Y-1-105733Y-6 6 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
- 2017
Correspondence model-based 4D VMAT dose simulation for analysis of local metastasis recurrence after extracranial SBRT
Sothmann, T., Gauer, T., Wilms, M. & Werner, R., 13.11.2017, in: PHYS MED BIOL. 62, 23, S. 9001-9017Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Subpopulation-based correspondence modelling for improved respiratory motion estimation in the presence of inter-fraction motion variations
Wilms, M., Werner, R., Yamamoto, T., Handels, H. & Ehrhardt, J., 26.06.2017, in: PHYS MED BIOL. 62, 14, S. 5823-5839 17 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Reduction of breathing irregularity-related motion artifacts in low-pitch spiral 4D CT by optimized projection binning
Werner, R., Hofmann, C., Mücke, E. & Gauer, T., 19.06.2017, in: RADIAT ONCOL. 12, 1, S. article ID 100 8 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Submillimeter-Accurate Marker Localization within Low Gradient Magnetic Particle Imaging Tomograms
Griese, F., Knopp, T., Werner, R., Schlaefer, A. & Möddel, M., 23.03.2017, in: Int J Magn Part Imag. 3, 1, S. article ID 1703011 9 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
4D dose simulation in volumetric arc therapy: Accuracy and affecting parameters
Sothmann, T., Gauer, T. & Werner, R., 2017, in: PLOS ONE. 12, 2, S. e0172810 17 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Defining Restrictions and Limits of Registration-Based Quantification of Geometric Deformation in Cerebral Blood Vessels
Schetelig, D., Sedlacik, J., Schmidt, F. N., Fiehler, J. & Werner, R., 2017, Bildverarbeitung für die Medizin 2017: Algorithmen - Systeme - Anwendungen. Maier-Hain, K. H., Deserno, T., Handels, H. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer, S. 191-196 6 S. (Informatik aktuell).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Low Rank and Sparse Matrix Decomposition as Stroke Segmentation Prior: Useful or Not? A Random Forest-Based Evaluation Study
Werner, R., Schetelig, D., Sothmann, T., Mücke, E., Wilms, M., Cheng, B. & Forkert, N. D., 2017, Bildverarbeitung für die Medizin 2017: Algorithmen - Systeme - Anwendungen. Maier-Hein, K. H., Deserno, T., Handels, H. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer, S. 161-166 6 S. (Informatik aktuell).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Systematic Analysis of Jurkat T-Cell Deformation in Fluorescence Microscopy Data
Antoni, S-T., Ismail, O. M. F., Schetelig, D., Diercks, B-P., Werner, R., Wolf, I., Guse, A. & Schlaefer, A., 2017, Bildverarbeitung für die Medizin 2017: Algorithmen - Systeme - Anwendungen. Maier-Hain, K. H., Deserno, T., Handels, H. & Thomas, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer, S. 275-280 6 S. (Informatik aktuell).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
- 2016
Regional Lung Ventilation Analysis Using Temporally Resolved Magnetic Resonance Imaging
Kolb, C., Wetscherek, A., Buzan, M. T., Werner, R., Rank, C. M., Kachelrie, M., Kreuter, M., Dinkel, J., Heuel, C. P. & Maier-Hein, K., 11.2016, in: J COMPUT ASSIST TOMO. 40, 6, S. 899-906 8 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Required transition from research to clinical application: Report on the 4D treatment planning workshops 2014 and 2015
Knopf, A-C., Stützer, K., Richter, C., Rucinski, A., da Silva, J., Phillips, J., Engelsman, M., Shimizu, S., Werner, R., Jakobi, A., Göksel, O., Zhang, Y., Oshea, T., Fast, M., Perrin, R., Bert, C., Rinaldi, I., Korevaar, E. & McClelland, J., 07.2016, in: PHYS MEDICA. 32, 7, S. 874-882 9 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Geometry planning and image registration in magnetic particle imaging using bimodal fiducial markers
Werner, F., Jung, C., Hofmann, M., Werner, R., Salamon, J., Säring, D., Kaul, M. G., Them, K., Weber, O. M., Mummert, T., Adam, G., Ittrich, H. & Knopp, T., 16.05.2016, in: MED PHYS. 43, 6, S. 2884-2893 11 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Phantom-based ground-truth generation for cerebral vessel segmentation and pulsatile deformation analysis
Schetelig, D., Säring, D., Illies, T., Sedlacik, J., Kording, F. & Werner, R., 18.03.2016, Medical Imaging 2016: Image-Guided Procedures, Robotic Interventions, and Modeling. Webster, III, R. J. & Yaniv, Z. R. (Hrsg.). 1 Aufl. SPIE , Band 9786. S. 978622-1-6 6 S. UNSP 978622 . (Proceeding of SPIE).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Real time tracking in liver SBRT: comparison of CyberKnife and Vero by planning structure-based γ-evaluation and dose-area-histograms
Sothmann, T., Blanck, O., Poels, K., Werner, R. & Gauer, T., 21.02.2016, in: PHYS MED BIOL. 61, 4, S. 1677-91 15 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Beyond cost function masking: RPCA-based non-linear registration in the context of VLSM
Werner, R., Wilms, M., Cheng, B. & Forkert, N. D., 2016, International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging, PRNI 2016, Trento, Italy, June 22-24, 2016. 1 Aufl. S. 1-4 4 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Geometrieplanung und Bildregistrierung mittels bimodaler Fiducial-Marker für Magnetic Particle Imaging
Werner, F., Jung, C., Hofmann, M., Salamon, J. M., Werner, R., Säring, D., Kaul, M., Them, K., Weber, O. M., Mummert, T., Adam, G., Ittrich, H. & Knopp, T., 2016, Bildverarbeitung für die Medizin 2016: Algorithmen – Systeme – Anwendungen. Tolxdorff, T., Deserno, T. M., Handels, H. & Meinzer, H-P. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer, S. 128-133 6 S. (Informatik aktuell).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Optimized projection binning for improved helical amplitude- and phase-based 4DCT reconstruction in the presence of breathing irregularity
Werner, R., Hofmann, C. & Gauer, T., 2016, Medical Imaging 2016: Physics of Medical Imaging. Kontos, D., Flohr, T. G. & Lo, J. Y. (Hrsg.). 1 Aufl. SPIE , Band 9783. S. 978313-1-6 6 S. 978313. (Proceedings of SPIE).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
- 2015
Sensitivity of tumor motion simulation accuracy to lung biomechanical modeling approaches and parameters
Tehrani, J. N., Yang, Y., Werner, R., Lu, W., Low, D., Guo, X. & Wang, J., 21.11.2015, in: PHYS MED BIOL. 60, 22, S. 8833-8849 17 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Frontrunners of T cell activation: Initial, localized Ca2+ signals mediated by NAADP and the type 1 ryanodine receptor
Wolf, I. M. A., Diercks, B-P., Gattkowski, E., Czarniak, F., Kempski, J., Werner, R., Schetelig, D., Mittrücker, H-W., Schumacher, V., von Osten, M., Lodygin, D., Flügel, A., Fliegert, R. & Guse, A. H., 13.10.2015, in: SCI SIGNAL. 8, 398, S. Art. ra102 13 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Groupwise Registration for Robust Motion Field Estimation in Artifact-Affected 4D CT Images
Tack, A., Kobayashi, Y., Gauer, T., Schlaefer, A. & Werner, R., 10.2015, MICCAI Workshop on Imaging and Computer Assistance in Radiation Therapy Workshop (ICART). 1 Aufl. S. 18-25 8 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Population-based Correspondence Models for Respiratory Motion Estimation in the Presence of Interfraction Motion Variations
Wilms, M., Werner, R., Yamamoto, T., Handels, H. & Ehrhardt, J., 10.2015, MICCAI workshop on Imaging and Computer Assistance in Radiation Therapy Workshop (ICART). 1 Aufl. S. 81-88 8 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Respiratory surface motion measurement by Microsoft Kinect: implementation and evaluation of a clinical setup
Ortmüller, J., Gauer, T., Wilms, M., Handels, H. & Werner, R., 12.09.2015, in: Current Directions in Biomedical Engineering. 1, 1, S. 270-273 4 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Design, performance characteristics and application examples of a new 4D motion platform
Grohmann, C., Frenzel, T., Werner, R. & Cremers, F., 06.2015, in: Z MED PHYS. 25, 2, S. 156-167 12 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Reference geometry-based detection of (4D-)CT motion artifacts: a feasibility study
Werner, R. & Gauer, T., 20.03.2015, Medical Imaging 2015: Image Processing. Ourselin, S. & Styner, M. A. (Hrsg.). 1 Aufl. SPIE , Band 9413. S. 0S1-7 7 S. (Proceedings of SPIE).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Comparison of 3D and 4D Monte Carlo optimization in robotic tracking stereotactic body radiotherapy of lung cancer
Chan, M. K. H., Werner, R., Ayadi, M. & Blanck, O., 02.2015, in: STRAHLENTHER ONKOL. 191, 2, S. 161-71 11 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
A Modular Framework for Post-Processing and Analysis of Fluorescence Microscopy Image Sequences of Subcellular Calcium Dynamics
Schetelig, D., Wolf, I., Diercks, B-P., Fliegert, R., Guse, A., Schlaefer, A. & Werner, R., 2015, Bildverarbeitung für die Medizin 2015. Handels, H., Deserno, T. M., Meinzer, H-P. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Berlin Heidelberg: Springer, S. 401-406 6 S. (Informatik Aktuell).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Variational Registration: A Flexible Open-Source ITK Toolbox for Nonrigid Image Registration
Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Werner, R. & Handels, H., 2015, Bildverarbeitung für die Medizin 2015. Handels, H., Deserno, T. M., Meinzer, H-P. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Berlin Heidelberg: Springer, S. 209-214 6 S. (Informatik Aktuell).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
- 2014
A Flexible Variational Registration Framework
Schmidt-Richberg, A., Werner, R., Handels, H. & Ehrhardt, J., 09.05.2014, in: Insight Journal. 12 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung
Statistical Analysis of Surrogate Signals to Incorporate Respiratory Motion Variability into Radiotherapy Treatment Planning
Wilms, M., Ehrhardt, J., Werner, R., Marx, M. & Handels, H., 23.04.2014, Medical Imaging 2014: Image-Guided Procedures, Robotic Interventions, and Modeling. Yaniv, Z. R. & Holmes, D. R. (Hrsg.). 1 Aufl. SPIE , Band 9036. S. 0J1-8 8 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Lung registration using automatically detected landmarks
Polzin, T., Rühaak, J., Werner, R., Handels, H. & Modersitzki, J., 01.01.2014, in: METHOD INFORM MED. 53, 4, S. 250-6 7 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Estimation of lung motion fields in 4D CT data by variational non-linear intensity-based registration:A comparison and evaluation study
Werner, R., Schmidt-Richberg, A., Handels, H. & Ehrhardt, J., 2014, in: PHYS MED BIOL. 59, 15, S. 4247-60 14 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
High Accuracy Optical Flow for 3D Medical Image Registration Using the Census Cost Function
Hermann, S. & Werner, R., 2014, Image and Video Technology. Klette, R., Rivera, M. & Satoh, S. (Hrsg.). 1 Aufl. Berlin Heidelberg: Springer, Band 8333. S. 23-35 13 S. (Lecture Notes in Computer Science).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Kombination von Atemsignalen zur Optimierung der Prädiktion komplexer atmungsbedingter Organ- und Tumorbewegungen
Ortmüller, J., Wilms, M., Werner, R. & Handels, H., 2014, Bildverarbeitung für die Medizin 2014. Deserno, T., Handels, H., Meinzer, H-P. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Berlin Heidelberg: Springer, S. 72-77 6 S. (Informatik Aktuell).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Multivariate regression approaches for surrogate-based diffeomorphic estimation of respiratory motion in radiation therapy
Wilms, M., Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Schlemmer, H-P. & Handels, H., 2014, in: PHYS MED BIOL. 59, 5, S. 1147-64 18 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Simulation of range imaging-based estimation of respiratory lung motion. Influence of noise, signal dimensionality and sampling patterns
Wilms, M., Werner, R., Blendowski, M., Ortmüller, J. & Handels, H., 2014, in: METHOD INFORM MED. 53, 4, S. 257-63 7 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Simulation of spatiotemporal CT data sets using a 4D MRI-based lung motion model
Marx, M., Ehrhardt, J., Werner, R., Schlemmer, H-P. & Handels, H., 2014, in: INT J COMPUT ASS RAD. 9, 3, S. 401-9 9 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
TV-L1-based 3D Medical Image Registration with the Census Cost Function
Hermann, S. & Werner, R., 2014, Image and Video Technology. Klette, R., Rivera, M. & Satoh, S. (Hrsg.). 1 Aufl. Berlin, Heidelberg: Springer, Band 8333. S. 149-161 13 S. (Lecture Notes in Computer Science).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
- 2013
Combining Automatic Landmark Detection and Variational Methods for Lung CT Registration
Thomas, P., Jan, R., Jan, S., Werner, R., Heldmann, S., Handels, H. & Modersitzki, J., 26.09.2013, 5th Workshop on Pulmonary Image Analysis . Rit, S., McClelland, J. R., de Bruijne, M., Kiraly, A., Kuhnigk, J-M., Kabus, S., van Rikxoort, E. & Beichel, R. (Hrsg.). S. 85-96 12 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Assessing accuracy of nonlinear registration in 4D image data using automatically detected landmark correspondences
Werner, R., Duscha, C., Schmidt-Richberg, A., Ehrhardt, J. & Handels, H., 13.03.2013, SPIE Medical Imaging: Image Processing. Ourselin, S. & Haynor, D. R. (Hrsg.). SPIE , Band 8669. S. 86690Z-1-9 9 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Biophysical Modeling of Respiratory Organ Motion
Werner, R., 2013, 4D Modeling and Estimation of Respiratory Motion for Radiation Therapy. Ehrhardt, J. & Lorenz, C. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer, S. 61-84 24 S. (Biological and Medical Physics, Biomedical Engineering).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Decision Forests with Spatio-temporal Features for Graph-based Tumour Segmentation in 4D Lung CT
Mirzaei, H., Tang, L., Werner, R. & Hamarneh, G., 2013, Machine Learning in Medical Imaging. Wu, G., Zhang, D., Shen, D., Yan, P., Suzuki, K. & Wang, F. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer, Band 8184. S. 179-186 8 S. (Lecture Notes in Computer Science).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Strahlentherapie atmungsbewegter Tumoren: Bewegungsfeldschätzung und Dosisakkumulation anhand von 4D-Bilddaten
Werner, R., 2013, Aktuelle Forschung Medizintechnik. Buzug, T. M. (Hrsg.). 1 Aufl. Wiesbaden: Springer Vieweg, S. 1-227 227 S. (Aktuelle Forschung Medizintechnik).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Validation and Comparison of Approaches to Respiratory Motion Estimation
Kabus, S., Klinder, T., Murphy, K., Werner, R. & Sarrut, D., 2013, 4D Modeling and Estimation of Respiratory Motion for Radiation Therapy. Ehrhardt, J. & Lorenz, C. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer, S. 159-183 25 S. (Biological and Medical Physics, Biomedical Engineering).Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
- 2012
Towards Accurate Dose Accumulation for Step-&-Shoot IMRT: Impact of Weighting Schemes and Temporal Image Resolution on the Estimation of Dosimetric Motion Effects.
Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Albers, D., Frenzel, T., Petersen, C., Cremers, F. & Handels, H., 06.2012, in: Z MED PHYS. 22, 2, S. 109-122 14 S., 2.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
- 2010
A statistical shape and motion model for the prediction of respiratory lung motion
Ehrhardt, J., Werner, R., Schmidt-Richberg, A. & Handels, H., 2010, Medical Imaging 2010: Image Processing. SPIE, S. 531-539 9 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Automatische Landmarkendetektion und -übertragung zur Evaluation der Registrierung von thorakalen CT-Daten
Werner, R., Wolf, J. C., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A. & Handels, H., 2010, Bildverarbeitung für die Medizin 2010: Algorithmen - Systeme - Anwendungen (Informatik Aktuell). Springer Berlin Heidelberg, S. 31-35 5 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Direction-dependent regularization for improved estimation of liver and lung motion in 4D image data
Schmidt-Richberg, A., Ehrhardt, J., Werner, R. & Handels, H., 2010, Medical Imaging 2010: Image Processing. SPIE, S. 1-8 8 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Estimation of motion fields by non-linear registration for local lung motion analysis in 4D CT image data
Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Heiss, A. & Handels, H., 2010, in: INT J COMPUT ASS RAD. 5, 6, S. 595-605 6.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Technical Note: Development of a tidal volume surrogate that replaces spirometry for physiological breathing monitoring in 4D CT
Werner, R., White, B., Handels, H., Lu, W. & Low, D. A., 2010, in: MED PHYS. 36, 2, S. 615-620 2.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
- 2009
4D Motion Modeling: Estimation of Respiratory Motion for Radiation Therapy
Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Werner, R. & Handels, H., 2009, World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering September 7 - 12, 2009 Munich, Germany (Ifmbe Proceedings). Springer-Verlag GmbH, S. 2166-2169 4 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Analysis of Dose Shifts induced by Organ Movements during Treatment with TomoTherapy using a Motion Phantom and GafChromic EBT Films
Grohmann, C., Werner, R., Dirk, A. & Cremers, F., 2009, World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering September 7 - 12, 2009 Munich, Germany (Ifmbe Proceedings). Springer-Verlag GmbH, S. 1020-1023 4 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Dose Accumulation based on Optimized Motion Field Estimation using Non-Linear Registration in Thoracic 4D CT Image Data
Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Bodmann, B., Cremers, F. & Handels, H., 2009, World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering September 7 - 12, 2009 Munich, Germany (Ifmbe Proceedings). Springer-Verlag GmbH, S. 950-953 4 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Estimation of Inner Lung Motion Fields by Non-linear Registration
Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Cremers, F. & Handels, H., 2009, Bildverarbeitung für die Medizin 2009. Springer Berlin Heidelberg, S. 102-106 5 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Evaluation and Comparison of Force Terms for the Estimation of Lung Motion by Non-linear Registration of 4D-CT Image Data
Schmidt-Richberg, A., Ehrhardt, J., Werner, R. & Handels, H., 2009, World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering September 7 - 12, 2009 Munich, Germany (Ifmbe Proceedings). Springer-Verlag GmbH, S. 2028-2131 104 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Integrierte Segmentierung und Trajektorienberechnung mittels diffeomorpher Registrierung in räumlich-zeitlichen CT-Bildfolgen
Schmidt-Richberg, A., Ehrhardt, J., Werner, R. & Handels, H., 2009, Bildverarbeitung für die Medizin 2009. Springer Berlin Heidelberg, S. 182-186 5 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Patient-specific finite element modeling of respiratory lung motion using 4D CT image data.
Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt, R. & Handels, H., 2009, in: MED PHYS. 36, 5, S. 1500-1511 5.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Prediction of Respiratory Motion Using A Statistical 4D Mean Motion Model
Ehrhardt, J., Werner, R., Schmidt-Richberg, A. & Handels, H., 2009, The Second International Workshop on Pulmonary Image Analysis. CreateSpace, S. 3-14 12 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Slipping Objects in Image Registration: Improved Motion Field Estimation with Direction-dependent Regularization
Schmidt-Richberg, A., Ehrhardt, J., Werner, R. & Handels, H., 2009, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention -- MICCAI 2009. Springer Berlin Heidelberg, S. 755-762 8 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Validation and comparison of a biophysical modeling approach and non-linear registration for estimation of lung motion fields in thoracic 4D CT data (Proceedings Paper)
Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A. & Handels, H., 2009, Medical Imaging 2009: Image Processing (Proceedings Volume). SPIE, S. 1-8 8 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
Virtual Spirometry: Utilizing an Abdominal Bellows System for Quantitatively Gating in 4D CT Acquisition
Werner, R., White, B., Schwenke, M., Handels, H., Lu, W. & Low, D. A., 2009, World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering September 7 - 12, 2009 Munich, Germany (Ifmbe Proceedings). Springer-Verlag GmbH, S. 855-858 4 S.Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung
- 2007
4D medical image computing and visualization of lung tumor mobility in spatio-temporal CT image data.
Handels, H., Werner, R., Schmidt, R., Frenzel, T., Lu, W., Low, D. & Ehrhardt, J., 2007, in: INT J MED INFORM. 76, 3, S. 433-439 3.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
An optical flow based method for improved reconstruction of 4D CT data sets acquired during free breathing.
Ehrhardt, J., Werner, R., Säring, D., Frenzel, T., Lu, W., Low, D. & Handels, H., 2007, in: MED PHYS. 34, 2, S. 711-721 2.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung
Motion artifact reducing reconstruction of 4D CT image data for the analysis of respiratory dynamics.
Werner, R., Ehrhardt, J., Frenzel, T., Säring, D., Lu, W., Low, D. & Handels, H., 2007, in: METHOD INFORM MED. 46, 3, S. 254-260 3.Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung