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Institut für Computational Neuroscience

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Publikationen

  1. Self-Supervision for Medical Image Classification: State-of-the-Art Performance with ~100 Labeled Training Samples per Class

    Nielsen, M., Wenderoth, L., Sentker, T. & Werner, R., 28.07.2023, in: BIOENGINEERING-BASEL. 10, 8, 14 S., 895.

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  2. Attention and control of manual responses in cognitive conflict: Findings from TMS perturbation studies

    Olk, B., Peschke, C. & Hilgetag, C. C., 07.2015, in: NEUROPSYCHOLOGIA. 74, SI, S. 7-20

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  3. The portable UNIX programming system (PUPS) and CANTOR: a computational environment for dynamical representation and analysis of complex neurobiological data

    O'Neill, M. A. & Hilgetag, C. C., 29.08.2001, in: PHILOS T R SOC B. 356, 1412, S. 1259-76 18 S.

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  4. The PUPS - MOSIX environment: A homeostatic environment for neuro- and bioinformatic applications

    O'Neill, M. A., Burns, G. A. & Hilgetag, C-C., 2002, Neuroscience Database: A practical guide. Springer New York Heidelberg Dordrecht London, S. 187-200 13 S.

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  5. Kombination von Atemsignalen zur Optimierung der Prädiktion komplexer atmungsbedingter Organ- und Tumorbewegungen

    Ortmüller, J., Wilms, M., Werner, R. & Handels, H., 2014, Bildverarbeitung für die Medizin 2014. Deserno, T., Handels, H., Meinzer, H-P. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Berlin Heidelberg: Springer, S. 72-77 6 S. (Informatik Aktuell).

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  6. Respiratory surface motion measurement by Microsoft Kinect: implementation and evaluation of a clinical setup

    Ortmüller, J., Gauer, T., Wilms, M., Handels, H. & Werner, R., 12.09.2015, in: Current Directions in Biomedical Engineering. 1, 1, S. 270-273 4 S.

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  7. Prediction of tissue outcome in acute ischemic stroke based on single-phase CT angiography at admission

    Palsson, F., Forkert, N. D., Meyer, L., Broocks, G., Flottmann, F., Maros, M. E., Bechstein, M., Winkelmeier, L., Schlemm, E., Fiehler, J., Gellißen, S. & Kniep, H. C., 19.03.2024, in: FRONT NEUROL. 15, S. 1330497

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  8. Generating useful images for medical applications from the Visible Korean Human.

    Park, J. S., Jung, Y-W., Lee, J. W., Shin, D. S., Chung, M. S., Riemer, M. & Handels, H., 2008, in: COMPUT METH PROG BIO. 92, 3, S. 257-266 3.

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  9. Should I stay or should I go--cognitive conflict in multi-attribute signals probed with East and West German 'Ampelmännchen' traffic signs

    Peschke, C., Olk, B. & Hilgetag, C-C., 01.01.2013, in: PLOS ONE. 8, 5, S. e64712

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  10. Influence of stimulus type on effects of flanker, flanker position, and trial sequence in a saccadic eye movement task

    Peschke, C., Hilgetag, C-C. & Olk, B., 01.01.2013, in: Q J EXP PSYCHOL. 66, 11, S. 2253-67 15 S.

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  11. Selective perturbation of cognitive conflict in the human brain-A combined fMRI and rTMS study

    Peschke, C., Köster, R., Korsch, M., Frühholz, S., Thiel, C. M., Herrmann, M. & Hilgetag, C. C., 13.12.2016, in: SCI REP-UK. 6, S. 38700

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  12. Simultaneity of responses in a hierarchical visual network

    Petroni, F., Panzeri, S., Hilgetag, C. C., Kötter, R. & Young, M. P., 28.08.2001, in: NEUROREPORT. 12, 12, S. 2753-9 7 S.

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  13. Exploring the visible human's inner organs with the VOXEL-MAN 3D navigator.

    Pflesser, B., Petersik, A., Pommert, A., Riemer, M., Schubert, R., Tiede, U., Höhne, K. H., Schumacher, U. & Richter, E., 2001, in: Stud Health Technol Inform. 81, S. 379-385

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  14. Segmentation-Based Blood Flow Parameter Refinement in Cerebrovascular Structures Using 4-D Arterial Spin Labeling MRA

    Phellan, R., Lindner, T., Helle, M., Falcao, A. X., Yasuda, C. L., Sokolska, M., Jager, R. H. & Forkert, N. D., 07.2020, in: IEEE T BIO-MED ENG. 67, 7, S. 1936-1946 11 S.

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  15. Lung registration using automatically detected landmarks

    Polzin, T., Rühaak, J., Werner, R., Handels, H. & Modersitzki, J., 01.01.2014, in: METHOD INFORM MED. 53, 4, S. 250-6 7 S.

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  16. Creating a high-resolution spatial/symbolic model of the inner organs based on the Visible Human.

    Pommert, A., Höhne, K. H., Pflesser, B., Richter, E., Riemer, M., Schiemann, T., Schubert, R., Schumacher, U. & Tiede, U., 2001, in: MED IMAGE ANAL. 5, 3, S. 221-228 3.

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  17. Modelling the effect of deep brain stimulation on cortico-subcortical networks in the context of freezing of gait in Parkinson’s Disease

    Popova, M., Messe, A., Gulberti, A., Pötter-Nerger, M. & Hilgetag, C-C., 21.12.2021, in: J COMPUT NEUROSCI. 2021, 49, S. S86

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  18. ‘One region to control them all'- the surprising effectiveness of network control theory in predicting post-stroke recovery from aphasia

    Popova, M., fakhar, K. & Braun, W., 10.08.2022, in: FRONT COMPUT NEUROSC. 16, S. 943396 943396.

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  19. A topology-based computational framework to assess the effect of deep brain stimulation in the context of freezing of gait in Parkinson’s disease

    Popova, M., Messe, A., Gulberti, A., Gerloff, C., Pötter-Nerger, M. & Hilgetag, C-C., 01.04.2023, in: CLIN NEUROPHYSIOL. 148, S. e61-e62 2 S.

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  20. e-Projekt Diabetes-Prävention

    Preisser, A. M., Zyriax, B-C., Kraft, A. M., Velasco Garrido, M. & Riemer, M., 2017, HOOU Content Projekte - Vorprojektphase 2015/16 der Hamburg Open Online University : Sonderband zum Fachmagazin Synergie. 1 Aufl. Hamburg: Prof. Dr. Kerstin Mayrberger, S. 206-9 4 S.

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  21. Over the fence: Media-supported collaborative teaching and learning exemplified by diabetes prevention in an occupational setting.

    Preisser, A. M., Hampel, E., Riemer, M., Kraft, A. M. & Zyriax, B-C., 03.04.2019, in: AMEE MedEdPublish. 8, 2, 12 S.

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  22. Interdisziplinäre Gesichtsrekonstruktion einer Moorleiche

    Püschel, K., Säring, D., Kaesemann, P., Scheuermann, S., Kreutz, K., Ohlrogge, S., Wittwer-Backofen, U., Burrath, S., Wilkinson, C., Bauerochse, A., Schultz, M. & Jopp, E., 2012, in: RECHTSMEDIZIN. 21(3), S. 221-224

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  23. Attention-driven modulation of auditory cortex activity during selective listening in a multi-speaker setting

    Puschmann, S., Regev, M., Fakhar, K., Zatorre, R. & Thiel, C., 10.04.2024, in: J NEUROSCI. 44, 15, e1157232023.

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  24. Interactive Segmentation of Muscles and 3D Representation of Meridians Based on Visible Human.

    Qin, Y., Cheng, Z., Zhuang, T., Wang, H., Wang, Y., Yan, Z., Riemer, M., Ulf, T. & Karl, H. H., 2005, in: Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc. 5, S. 5116-5119

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  25. The Impact of Covariates in Voxel-Wise Lesion-Symptom Mapping

    Rajashekar, D., Wilms, M., Hecker, K. G., Hill, M. D., Dukelow, S., Fiehler, J. & Forkert, N. D., 2020, in: FRONT NEUROL. 11, S. 854

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  26. Structural integrity of white matter tracts as a predictor of acute ischemic stroke outcome

    Rajashekar, D., Mouchès, P., Fiehler, J., Menon, B. K., Goyal, M., Demchuk, A. M., Hill, M. D., Dukelow, S. P. & Forkert, N. D., 12.2020, in: INT J STROKE. 15, 9, S. 965-972 8 S.

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  27. Einsatz der eLearning-Plattform Moodle im Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf

    Riemer, M., Wollatz, M. & Handels, H., 2009, e-Health 2010 Informationstechnologien und Telematik im Gesundheitswesen. medical future verlag, S. 275-281 7 S.

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  28. Benutzerverhalten auf der eLearning-Plattform Moodle im Universitätsklinikum Hamburg-Eppendorf Bestandsaufnahme und Analyse mit Hilfe kontinuierlicher Pflichtevaluationen in 2006 2007

    Riemer, M., Wollatz, M., Peimann, C-J. & Handels, H., 2009, in: GMS Med Inform Biom E. 5, 1, S. 5 1.

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  29. Vergleich verschiedener Werkzeuge zur Erzeugung und Nutzung von medizinischen Virtuellen Patienten

    Riemer, M., Wollatz, M., Kludas, L., Mendorf, A., Nguyen, T-A. & Seibel, J., 2010, e-Health 2011 Informationstechnologien und Telematik im Gesundheitswesen. medical future verlag, S. 289-295 7 S.

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  30. Virtuelle Patienten: Wie werden sie aus Sicht von Medizinstudierenden am besten eingesetzt?

    Riemer, M. & Abendroth, M., 13.11.2013, in: GMS Med Inform Biom E. 9(4), Doc19, 6 S.

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  31. Quantification of recurrence volumes after endovascular treatment of cerebral aneurysm as surrogate endpoint for treatment stability.

    Ries, T., Wegscheider, K., Wulff, A., Radelfahr, K., Säring, D., Forkert, N. & Fiehler, J., 2011, in: NEURORADIOLOGY. 53, 8, S. 593-598 8.

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  32. Evaluation of magnetic resonance imaging-based radiomics characteristics for differentiation of benign and malignant peripheral nerve sheath tumors in neurofibromatosis type 1

    Ristow, I., Madesta, F., Well, L., Shenas, F. Y., Wright, F., Molwitz, I., Farschtschi, S., Bannas, P., Adam, G., Mautner, V. F., Werner, R. & Salamon, J., 03.10.2022, in: NEURO-ONCOLOGY. 24, 10, S. 1790-1798 9 S.

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  33. HN1L/JPT2: A signaling protein that connects NAADP generation to Ca2+ microdomain formation

    Roggenkamp, H. G., Khansahib, I., Hernandez C, L. C., Zhang, Y., Lodygin, D., Krüger, A., Gu, F., Möckl, F., Löhndorf, A., Wolters, V., Woike, D., Rosche, A., Bauche, A., Schetelig, D., Werner, R., Schlüter, H., Failla, A. V., Meier, C., Fliegert, R., Walseth, T. F., Flügel, A., Diercks, B-P. & Guse, A. H., 23.03.2021, in: SCI SIGNAL. 14, 675

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  34. Cortico-cortical communication dynamics

    Roland, P. E., Hilgetag, C. C. & Deco, G., 01.01.2014, in: Front Syst Neurosci. 8, S. 19

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  35. Structural Properties of Synaptic Transmission and Temporal Dynamics at Excitatory Layer 5B Synapses in the Adult Rat Somatosensory Cortex

    Rollenhagen, A., Ohana, O., Sätzler, K., Hilgetag, C. C., Kuhl, D. & Lübke, J. H. R., 2018, in: FRONT SYNAPTIC NEURO. 10, S. 24

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  36. Connectivity between right inferior frontal gyrus and supplementary motor area predicts after-effects of right frontal cathodal tDCS on picture naming speed

    Rosso, C., Valabregue, R., Arbizu, C., Ferrieux, S., Vargas, P., Humbert, F., Attal, Y., Messé, A., Zavanone, C., Meunier, S., Cohen, L., Delmaire, C., Thielscher, A., Herz, D. M., Siebner, H. R., Samson, Y. & Lehéricy, S., 01.2014, in: BRAIN STIMUL. 7, 1, S. 122-129 8 S.

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  37. Functional circuitry underlying visual neglect

    Rushmore, R. J., Valero-Cabre, A., Lomber, S. G., Hilgetag, C. C. & Payne, B. R., 07.2006, in: BRAIN. 129, Pt 7, S. 1803-21 19 S.

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  38. Human orbital and anterior medial prefrontal cortex: Intrinsic connectivity parcellation and functional organization

    Samara, Z., Evers, E. A. T., Goulas, A., Uylings, H. B. M., Rajkowska, G., Ramaekers, J. G. & Stiers, P., 09.2017, in: BRAIN STRUCT FUNCT. 222, 7, S. 2941-2960

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  39. Reproducible extraction of local and global parameters for functional analysis of the left ventricle in 4D MR image data.

    Säring, D., Relan, J., Ehrhardt, J., Müllerleile, K., Bahrmeyer, A., Groth, M. & Handels, H., 2009, in: METHOD INFORM MED. 48, 2, S. 216-224 2.

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  40. Combination of short- and longaxis MR image sequences for the 3D segmentation of the left ventricle.

    Säring, D., Relan, J., Groth, M., Müllerleile, K. & Handels, H., 2008, in: Stud Health Technol Inform. 136, S. 333-338

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  41. Evaluation of methods for bolus arrival time determination using a four-dimensional MRA flow phantom.

    Säring, D., Forkert, N., Illies, T., Fiehler, J. & Handels, H., 2010, in: Stud Health Technol Inform. 160, 2, S. 1263-1267 2.

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  42. Rigid 3D-3D registration of TOF MRA integrating vessel segmentation for quantification of recurrence volumes after coiling cerebral aneurysm.

    Säring, D., Fiehler, J., Ries, T. & Forkert, N., 2012, in: NEURORADIOLOGY. 54, 2, S. 171-176 2.

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  43. Computer-assisted analysis of 4D cardiac MR image sequences after myocardial infarction.

    Säring, D., Ehrhardt, J., Stork, A., Bansmann, M. P., Lund, G. K. & Handels, H., 2006, in: METHOD INFORM MED. 45, 4, S. 377-383 4.

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  44. 3D Segmentation of the Left Ventricle Combining Long- and Short-axis MR Images.

    Säring, D., Relan, J., Groth, M., Müllerleile, K. & Handels, H., 2009, in: METHOD INFORM MED. 48, 4, 4.

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  45. Lokale Analyse von Infarktrandzonen in 3D-DE-MRT Bildsequenzen

    Säring, D., Müllerleile, K., Groth, M., Lund, G. & Handels, H., 2010, Bildverarbeitung für die Medizin 2010: Algorithmen - Systeme - Anwendungen (Informatik Aktuell). Springer Berlin Heidelberg, S. 66-70 5 S.

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  46. Generierung korrespondierender Schichtbilder zur verbesserten lokalen Analyse des linken Ventrikels in 4D-MRT-Bildsequenzen

    Säring, D., Müllerleile, K., Groth, M. & Handels, H., 2009, Bildverarbeitung für die Medizin 2009. Springer Berlin Heidelberg, S. 227-232 6 S.

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  47. Klassifikation des Verschlussgrades der Epiphyse der proximalen Tibia zur Altersbestimmung.

    Säring, D., Mauer, M. A. D. & Jopp, E., 2014, Bildverarbeitung für die Medizin 2014, Algorithmen - Systeme - Anwendungen. Springer, Band Informatik Aktuell. S. 60-65 6 S.

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  48. The connectional organization of the cortico-thalamic system of the cat

    Scannell, J. W., Burns, G. A., Hilgetag, C. C., O'Neil, M. A. & Young, M. P., 04.06.1999, in: CEREB CORTEX. 9, 3, S. 277-99 23 S.

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  49. A Modular Framework for Post-Processing and Analysis of Fluorescence Microscopy Image Sequences of Subcellular Calcium Dynamics

    Schetelig, D., Wolf, I., Diercks, B-P., Fliegert, R., Guse, A., Schlaefer, A. & Werner, R., 2015, Bildverarbeitung für die Medizin 2015. Handels, H., Deserno, T. M., Meinzer, H-P. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Berlin Heidelberg: Springer, S. 401-406 6 S. (Informatik Aktuell).

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  50. Phantom-based ground-truth generation for cerebral vessel segmentation and pulsatile deformation analysis

    Schetelig, D., Säring, D., Illies, T., Sedlacik, J., Kording, F. & Werner, R., 18.03.2016, Medical Imaging 2016: Image-Guided Procedures, Robotic Interventions, and Modeling. Webster, III, R. J. & Yaniv, Z. R. (Hrsg.). 1 Aufl. SPIE , Band 9786. S. 978622-1-6 6 S. UNSP 978622 . (Proceeding of SPIE).

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