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Rene Werner

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Publikationen

  1. 2007

  2. 4D medical image computing and visualization of lung tumor mobility in spatio-temporal CT image data.

    Handels, H., Werner, R., Schmidt, R., Frenzel, T., Lu, W., Low, D. & Ehrhardt, J., 2007, in: INT J MED INFORM. 76, 3, S. 433-439 3.

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  3. An optical flow based method for improved reconstruction of 4D CT data sets acquired during free breathing.

    Ehrhardt, J., Werner, R., Säring, D., Frenzel, T., Lu, W., Low, D. & Handels, H., 2007, in: MED PHYS. 34, 2, S. 711-721 2.

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  4. Motion artifact reducing reconstruction of 4D CT image data for the analysis of respiratory dynamics.

    Werner, R., Ehrhardt, J., Frenzel, T., Säring, D., Lu, W., Low, D. & Handels, H., 2007, in: METHOD INFORM MED. 46, 3, S. 254-260 3.

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  5. 2009

  6. 4D Motion Modeling: Estimation of Respiratory Motion for Radiation Therapy

    Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Werner, R. & Handels, H., 2009, World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering September 7 - 12, 2009 Munich, Germany (Ifmbe Proceedings). Springer-Verlag GmbH, S. 2166-2169 4 S.

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  7. Analysis of Dose Shifts induced by Organ Movements during Treatment with TomoTherapy using a Motion Phantom and GafChromic EBT Films

    Grohmann, C., Werner, R., Dirk, A. & Cremers, F., 2009, World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering September 7 - 12, 2009 Munich, Germany (Ifmbe Proceedings). Springer-Verlag GmbH, S. 1020-1023 4 S.

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  8. Dose Accumulation based on Optimized Motion Field Estimation using Non-Linear Registration in Thoracic 4D CT Image Data

    Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Bodmann, B., Cremers, F. & Handels, H., 2009, World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering September 7 - 12, 2009 Munich, Germany (Ifmbe Proceedings). Springer-Verlag GmbH, S. 950-953 4 S.

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  9. Estimation of Inner Lung Motion Fields by Non-linear Registration

    Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Cremers, F. & Handels, H., 2009, Bildverarbeitung für die Medizin 2009. Springer Berlin Heidelberg, S. 102-106 5 S.

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  10. Evaluation and Comparison of Force Terms for the Estimation of Lung Motion by Non-linear Registration of 4D-CT Image Data

    Schmidt-Richberg, A., Ehrhardt, J., Werner, R. & Handels, H., 2009, World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering September 7 - 12, 2009 Munich, Germany (Ifmbe Proceedings). Springer-Verlag GmbH, S. 2028-2131 104 S.

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  11. Integrierte Segmentierung und Trajektorienberechnung mittels diffeomorpher Registrierung in räumlich-zeitlichen CT-Bildfolgen

    Schmidt-Richberg, A., Ehrhardt, J., Werner, R. & Handels, H., 2009, Bildverarbeitung für die Medizin 2009. Springer Berlin Heidelberg, S. 182-186 5 S.

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  12. Patient-specific finite element modeling of respiratory lung motion using 4D CT image data.

    Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt, R. & Handels, H., 2009, in: MED PHYS. 36, 5, S. 1500-1511 5.

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  13. Prediction of Respiratory Motion Using A Statistical 4D Mean Motion Model

    Ehrhardt, J., Werner, R., Schmidt-Richberg, A. & Handels, H., 2009, The Second International Workshop on Pulmonary Image Analysis. CreateSpace, S. 3-14 12 S.

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  14. Slipping Objects in Image Registration: Improved Motion Field Estimation with Direction-dependent Regularization

    Schmidt-Richberg, A., Ehrhardt, J., Werner, R. & Handels, H., 2009, Medical Image Computing and Computer-Assisted Intervention -- MICCAI 2009. Springer Berlin Heidelberg, S. 755-762 8 S.

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  15. Validation and comparison of a biophysical modeling approach and non-linear registration for estimation of lung motion fields in thoracic 4D CT data (Proceedings Paper)

    Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A. & Handels, H., 2009, Medical Imaging 2009: Image Processing (Proceedings Volume). SPIE, S. 1-8 8 S.

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  16. Virtual Spirometry: Utilizing an Abdominal Bellows System for Quantitatively Gating in 4D CT Acquisition

    Werner, R., White, B., Schwenke, M., Handels, H., Lu, W. & Low, D. A., 2009, World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering September 7 - 12, 2009 Munich, Germany (Ifmbe Proceedings). Springer-Verlag GmbH, S. 855-858 4 S.

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  17. 2010

  18. A statistical shape and motion model for the prediction of respiratory lung motion

    Ehrhardt, J., Werner, R., Schmidt-Richberg, A. & Handels, H., 2010, Medical Imaging 2010: Image Processing. SPIE, S. 531-539 9 S.

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  19. Automatische Landmarkendetektion und -übertragung zur Evaluation der Registrierung von thorakalen CT-Daten

    Werner, R., Wolf, J. C., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A. & Handels, H., 2010, Bildverarbeitung für die Medizin 2010: Algorithmen - Systeme - Anwendungen (Informatik Aktuell). Springer Berlin Heidelberg, S. 31-35 5 S.

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  20. Direction-dependent regularization for improved estimation of liver and lung motion in 4D image data

    Schmidt-Richberg, A., Ehrhardt, J., Werner, R. & Handels, H., 2010, Medical Imaging 2010: Image Processing. SPIE, S. 1-8 8 S.

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  21. Estimation of motion fields by non-linear registration for local lung motion analysis in 4D CT image data

    Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Heiss, A. & Handels, H., 2010, in: INT J COMPUT ASS RAD. 5, 6, S. 595-605 6.

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  22. Technical Note: Development of a tidal volume surrogate that replaces spirometry for physiological breathing monitoring in 4D CT

    Werner, R., White, B., Handels, H., Lu, W. & Low, D. A., 2010, in: MED PHYS. 36, 2, S. 615-620 2.

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  23. 2012

  24. Towards Accurate Dose Accumulation for Step-&-Shoot IMRT: Impact of Weighting Schemes and Temporal Image Resolution on the Estimation of Dosimetric Motion Effects.

    Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Albers, D., Frenzel, T., Petersen, C., Cremers, F. & Handels, H., 06.2012, in: Z MED PHYS. 22, 2, S. 109-122 14 S., 2.

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  25. 2013

  26. Biophysical Modeling of Respiratory Organ Motion

    Werner, R., 2013, 4D Modeling and Estimation of Respiratory Motion for Radiation Therapy. Ehrhardt, J. & Lorenz, C. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer, S. 61-84 24 S. (Biological and Medical Physics, Biomedical Engineering).

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  27. Decision Forests with Spatio-temporal Features for Graph-based Tumour Segmentation in 4D Lung CT

    Mirzaei, H., Tang, L., Werner, R. & Hamarneh, G., 2013, Machine Learning in Medical Imaging. Wu, G., Zhang, D., Shen, D., Yan, P., Suzuki, K. & Wang, F. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer, Band 8184. S. 179-186 8 S. (Lecture Notes in Computer Science).

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  28. Strahlentherapie atmungsbewegter Tumoren: Bewegungsfeldschätzung und Dosisakkumulation anhand von 4D-Bilddaten

    Werner, R., 2013, Aktuelle Forschung Medizintechnik. Buzug, T. M. (Hrsg.). 1 Aufl. Wiesbaden: Springer Vieweg, S. 1-227 227 S. (Aktuelle Forschung Medizintechnik).

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  29. Validation and Comparison of Approaches to Respiratory Motion Estimation

    Kabus, S., Klinder, T., Murphy, K., Werner, R. & Sarrut, D., 2013, 4D Modeling and Estimation of Respiratory Motion for Radiation Therapy. Ehrhardt, J. & Lorenz, C. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer, S. 159-183 25 S. (Biological and Medical Physics, Biomedical Engineering).

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  30. Assessing accuracy of nonlinear registration in 4D image data using automatically detected landmark correspondences

    Werner, R., Duscha, C., Schmidt-Richberg, A., Ehrhardt, J. & Handels, H., 13.03.2013, SPIE Medical Imaging: Image Processing. Ourselin, S. & Haynor, D. R. (Hrsg.). SPIE , Band 8669. S. 86690Z-1-9 9 S.

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  31. Combining Automatic Landmark Detection and Variational Methods for Lung CT Registration

    Thomas, P., Jan, R., Jan, S., Werner, R., Heldmann, S., Handels, H. & Modersitzki, J., 26.09.2013, 5th Workshop on Pulmonary Image Analysis . Rit, S., McClelland, J. R., de Bruijne, M., Kiraly, A., Kuhnigk, J-M., Kabus, S., van Rikxoort, E. & Beichel, R. (Hrsg.). S. 85-96 12 S.

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  32. 2014

  33. Estimation of lung motion fields in 4D CT data by variational non-linear intensity-based registration:A comparison and evaluation study

    Werner, R., Schmidt-Richberg, A., Handels, H. & Ehrhardt, J., 2014, in: PHYS MED BIOL. 59, 15, S. 4247-60 14 S.

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  34. High Accuracy Optical Flow for 3D Medical Image Registration Using the Census Cost Function

    Hermann, S. & Werner, R., 2014, Image and Video Technology. Klette, R., Rivera, M. & Satoh, S. (Hrsg.). 1 Aufl. Berlin Heidelberg: Springer, Band 8333. S. 23-35 13 S. (Lecture Notes in Computer Science).

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  35. Kombination von Atemsignalen zur Optimierung der Prädiktion komplexer atmungsbedingter Organ- und Tumorbewegungen

    Ortmüller, J., Wilms, M., Werner, R. & Handels, H., 2014, Bildverarbeitung für die Medizin 2014. Deserno, T., Handels, H., Meinzer, H-P. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Berlin Heidelberg: Springer, S. 72-77 6 S. (Informatik Aktuell).

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  36. Multivariate regression approaches for surrogate-based diffeomorphic estimation of respiratory motion in radiation therapy

    Wilms, M., Werner, R., Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Schlemmer, H-P. & Handels, H., 2014, in: PHYS MED BIOL. 59, 5, S. 1147-64 18 S.

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  37. Simulation of range imaging-based estimation of respiratory lung motion. Influence of noise, signal dimensionality and sampling patterns

    Wilms, M., Werner, R., Blendowski, M., Ortmüller, J. & Handels, H., 2014, in: METHOD INFORM MED. 53, 4, S. 257-63 7 S.

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  38. Simulation of spatiotemporal CT data sets using a 4D MRI-based lung motion model

    Marx, M., Ehrhardt, J., Werner, R., Schlemmer, H-P. & Handels, H., 2014, in: INT J COMPUT ASS RAD. 9, 3, S. 401-9 9 S.

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  39. TV-L1-based 3D Medical Image Registration with the Census Cost Function

    Hermann, S. & Werner, R., 2014, Image and Video Technology. Klette, R., Rivera, M. & Satoh, S. (Hrsg.). 1 Aufl. Berlin, Heidelberg: Springer, Band 8333. S. 149-161 13 S. (Lecture Notes in Computer Science).

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  40. Lung registration using automatically detected landmarks

    Polzin, T., Rühaak, J., Werner, R., Handels, H. & Modersitzki, J., 01.01.2014, in: METHOD INFORM MED. 53, 4, S. 250-6 7 S.

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  41. Statistical Analysis of Surrogate Signals to Incorporate Respiratory Motion Variability into Radiotherapy Treatment Planning

    Wilms, M., Ehrhardt, J., Werner, R., Marx, M. & Handels, H., 23.04.2014, Medical Imaging 2014: Image-Guided Procedures, Robotic Interventions, and Modeling. Yaniv, Z. R. & Holmes, D. R. (Hrsg.). 1 Aufl. SPIE , Band 9036. S. 0J1-8 8 S.

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  42. A Flexible Variational Registration Framework

    Schmidt-Richberg, A., Werner, R., Handels, H. & Ehrhardt, J., 09.05.2014, in: Insight Journal. 12 S.

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  43. 2015

  44. A Modular Framework for Post-Processing and Analysis of Fluorescence Microscopy Image Sequences of Subcellular Calcium Dynamics

    Schetelig, D., Wolf, I., Diercks, B-P., Fliegert, R., Guse, A., Schlaefer, A. & Werner, R., 2015, Bildverarbeitung für die Medizin 2015. Handels, H., Deserno, T. M., Meinzer, H-P. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Berlin Heidelberg: Springer, S. 401-406 6 S. (Informatik Aktuell).

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  45. Variational Registration: A Flexible Open-Source ITK Toolbox for Nonrigid Image Registration

    Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Werner, R. & Handels, H., 2015, Bildverarbeitung für die Medizin 2015. Handels, H., Deserno, T. M., Meinzer, H-P. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Berlin Heidelberg: Springer, S. 209-214 6 S. (Informatik Aktuell).

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  46. Comparison of 3D and 4D Monte Carlo optimization in robotic tracking stereotactic body radiotherapy of lung cancer

    Chan, M. K. H., Werner, R., Ayadi, M. & Blanck, O., 02.2015, in: STRAHLENTHER ONKOL. 191, 2, S. 161-71 11 S.

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  47. Reference geometry-based detection of (4D-)CT motion artifacts: a feasibility study

    Werner, R. & Gauer, T., 20.03.2015, Medical Imaging 2015: Image Processing. Ourselin, S. & Styner, M. A. (Hrsg.). 1 Aufl. SPIE , Band 9413. S. 0S1-7 7 S. (Proceedings of SPIE).

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  48. Design, performance characteristics and application examples of a new 4D motion platform

    Grohmann, C., Frenzel, T., Werner, R. & Cremers, F., 06.2015, in: Z MED PHYS. 25, 2, S. 156-167 12 S.

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  49. Respiratory surface motion measurement by Microsoft Kinect: implementation and evaluation of a clinical setup

    Ortmüller, J., Gauer, T., Wilms, M., Handels, H. & Werner, R., 12.09.2015, in: Current Directions in Biomedical Engineering. 1, 1, S. 270-273 4 S.

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  50. Groupwise Registration for Robust Motion Field Estimation in Artifact-Affected 4D CT Images

    Tack, A., Kobayashi, Y., Gauer, T., Schlaefer, A. & Werner, R., 10.2015, MICCAI Workshop on Imaging and Computer Assistance in Radiation Therapy Workshop (ICART). 1 Aufl. S. 18-25 8 S.

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  51. Population-based Correspondence Models for Respiratory Motion Estimation in the Presence of Interfraction Motion Variations

    Wilms, M., Werner, R., Yamamoto, T., Handels, H. & Ehrhardt, J., 10.2015, MICCAI workshop on Imaging and Computer Assistance in Radiation Therapy Workshop (ICART). 1 Aufl. S. 81-88 8 S.

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  52. Frontrunners of T cell activation: Initial, localized Ca2+ signals mediated by NAADP and the type 1 ryanodine receptor

    Wolf, I. M. A., Diercks, B-P., Gattkowski, E., Czarniak, F., Kempski, J., Werner, R., Schetelig, D., Mittrücker, H-W., Schumacher, V., von Osten, M., Lodygin, D., Flügel, A., Fliegert, R. & Guse, A. H., 13.10.2015, in: SCI SIGNAL. 8, 398, S. Art. ra102 13 S.

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  53. Sensitivity of tumor motion simulation accuracy to lung biomechanical modeling approaches and parameters

    Tehrani, J. N., Yang, Y., Werner, R., Lu, W., Low, D., Guo, X. & Wang, J., 21.11.2015, in: PHYS MED BIOL. 60, 22, S. 8833-8849 17 S.

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  54. 2016

  55. Beyond cost function masking: RPCA-based non-linear registration in the context of VLSM

    Werner, R., Wilms, M., Cheng, B. & Forkert, N. D., 2016, International Workshop on Pattern Recognition in Neuroimaging, PRNI 2016, Trento, Italy, June 22-24, 2016. 1 Aufl. S. 1-4 4 S.

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  56. Geometrieplanung und Bildregistrierung mittels bimodaler Fiducial-Marker für Magnetic Particle Imaging

    Werner, F., Jung, C., Hofmann, M., Salamon, J. M., Werner, R., Säring, D., Kaul, M., Them, K., Weber, O. M., Mummert, T., Adam, G., Ittrich, H. & Knopp, T., 2016, Bildverarbeitung für die Medizin 2016: Algorithmen – Systeme – Anwendungen. Tolxdorff, T., Deserno, T. M., Handels, H. & Meinzer, H-P. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer, S. 128-133 6 S. (Informatik aktuell).

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  57. Optimized projection binning for improved helical amplitude- and phase-based 4DCT reconstruction in the presence of breathing irregularity

    Werner, R., Hofmann, C. & Gauer, T., 2016, Medical Imaging 2016: Physics of Medical Imaging. Kontos, D., Flohr, T. G. & Lo, J. Y. (Hrsg.). 1 Aufl. SPIE , Band 9783. S. 978313-1-6 6 S. 978313. (Proceedings of SPIE).

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  58. Real time tracking in liver SBRT: comparison of CyberKnife and Vero by planning structure-based γ-evaluation and dose-area-histograms

    Sothmann, T., Blanck, O., Poels, K., Werner, R. & Gauer, T., 21.02.2016, in: PHYS MED BIOL. 61, 4, S. 1677-91 15 S.

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