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Siawoosh Mohammadi

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Publikationen

  1. 2023

  2. Axisymmetric diffusion kurtosis imaging with Rician bias correction: A simulation study

    Malte Oeschger, J., Tabelow, K. & Mohammadi, S., 02.2023, in: MAGN RESON MED. 89, 2, S. 787-799 13 S.

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  3. Mitigating the impact of flip angle and orientation dependence in single compartment R2* estimates via 2-pool modeling

    Milotta, G., Corbin, N., Lambert, C., Lutti, A., Mohammadi, S. & Callaghan, M. F., 01.2023, in: MAGN RESON MED. 89, 1, S. 128-143 16 S.

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  4. Fiber-orientation independent component of R2* obtained from single-orientation MRI measurements in simulations and a post-mortem human optic chiasm

    Fritz, F. J., Mordhorst, L., Ashtarayeh, M., Periquito, J., Pohlmann, A., Morawski, M., Jaeger, C., Niendorf, T., Pine, K. J., Callaghan, M. F., Weiskopf, N. & Mohammadi, S., 2023, in: FRONT NEUROSCI-SWITZ. 17, S. 1133086

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  5. 2022

  6. Error quantification in multi-parameter mapping facilitates robust estimation and enhanced group level sensitivity

    Mohammadi, S., Streubel, T., Klock, L., Edwards, L. J., Lutti, A., Pine, K. J., Weber, S., Scheibe, P., Ziegler, G., Gallinat, J., Kühn, S., Callaghan, M. F., Weiskopf, N. & Tabelow, K., 15.11.2022, in: NEUROIMAGE. 262, 119529.

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  7. Conduction velocity along a key white matter tract is associated with autobiographical memory recall ability

    Clark, I. A., Mohammadi, S., Callaghan, M. F. & Maguire, E. A., 27.09.2022, in: ELIFE. 11, e79303.

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  8. Towards a representative reference for MRI-based human axon radius assessment using light microscopy

    Mordhorst, L., Morozova, M., Papazoglou, S., Fricke, B., Oeschger, J. M., Tabarin, T., Rusch, H., Jäger, C., Geyer, S., Weiskopf, N., Morawski, M. & Mohammadi, S., 01.04.2022, in: NEUROIMAGE. 249, 118906.

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  9. Finding the best clearing approach - Towards 3D wide-scale multimodal imaging of aged human brain tissue

    Rusch, H., Brammerloh, M., Stieler, J., Sonntag, M., Mohammadi, S., Weiskopf, N., Arendt, T., Kirilina, E. & Morawski, M., 15.02.2022, in: NEUROIMAGE. 247, 118832.

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  10. 2021

  11. Longitudinal changes of spinal cord grey and white matter following spinal cord injury

    David, G., Pfyffer, D., Vallotton, K., Pfender, N., Thompson, A., Weiskopf, N., Mohammadi, S., Curt, A. & Freund, P., 11.2021, in: J NEUROL NEUROSUR PS. 92, 11, S. 1222-1230 9 S.

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  12. The Influence of Radio-Frequency Transmit Field Inhomogeneities on the Accuracy of G-ratio Weighted Imaging

    Emmenegger, T. M., David, G., Ashtarayeh, M., Fritz, F. J., Ellerbrock, I., Helms, G., Balteau, E., Freund, P. & Mohammadi, S., 05.07.2021, in: FRONT NEUROSCI-SWITZ. 15, 1, 674719.

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  13. Quantitative magnetic resonance imaging of brain anatomy and in vivo histology

    Weiskopf, N., Edwards, L. J., Helms, G., Mohammadi, S. & Kirilina, E., 28.06.2021, in: NAT REV PHYS. 3, S. 570 588 S.

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  14. Towards in vivo g-ratio mapping using MRI: Unifying myelin and diffusion imaging

    Mohammadi, S. & Callaghan, M. F., 15.01.2021, in: J NEUROSCI METH. 348, S. 108990

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  15. Corrigendum: The Influence of Radio-Frequency Transmit Field Inhomogeneities on the Accuracy of G-ratio Weighted Imaging

    Emmenegger, T. M., David, G., Ashtarayeh, M., Fritz, F. J., Ellerbrock, I., Helms, G., Balteau, E., Freund, P. & Mohammadi, S., 2021, in: FRONT NEUROSCI-SWITZ. 15, S. 772745

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  16. Reducing Susceptibility Distortion Related Image Blurring in Diffusion MRI EPI Data

    Clark, I. A., Callaghan, M. F., Weiskopf, N., Maguire, E. A. & Mohammadi, S., 2021, in: FRONT NEUROSCI-SWITZ. 15, 706473.

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  17. 2019

  18. Traumatic and nontraumatic spinal cord injury: pathological insights from neuroimaging

    David, G., Mohammadi, S., Martin, A. R., Cohen-Adad, J., Weiskopf, N., Thompson, A. & Freund, P., 12.2019, in: NAT REV NEUROL. 15, 12, S. 718-731 14 S.

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  19. Biophysically motivated efficient estimation of the spatially isotropic R 2 * component from a single gradient-recalled echo measurement

    Papazoglou, S., Streubel, T., Ashtarayeh, M., Pine, K. J., Edwards, L. J., Brammerloh, M., Kirilina, E., Morawski, M., Jäger, C., Geyer, S., Callaghan, M. F., Weiskopf, N. & Mohammadi, S., 11.2019, in: MAGN RESON MED. 82, 5, S. 1804-1811 8 S.

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  20. Example dataset for the hMRI toolbox

    Callaghan, M. F., Lutti, A., Ashburner, J., Balteau, E., Corbin, N., Draganski, B., Helms, G., Kherif, F., Leutritz, T., Mohammadi, S., Phillips, C., Reimer, E., Ruthotto, L., Seif, M., Tabelow, K., Ziegler, G. & Weiskopf, N., 08.2019, in: DATA BRIEF. 25, S. 104132

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  21. hMRI - A toolbox for quantitative MRI in neuroscience and clinical research

    Tabelow, K., Balteau, E., Ashburner, J., Callaghan, M. F., Draganski, B., Helms, G., Kherif, F., Leutritz, T., Lutti, A., Phillips, C., Reimer, E., Ruthotto, L., Seif, M., Weiskopf, N., Ziegler, G. & Mohammadi, S., 01.07.2019, in: NEUROIMAGE. 194, S. 191-210 20 S.

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  22. Dynamic changes in white matter microstructure in anorexia nervosa: findings from a longitudinal study

    von Schwanenflug, N., Müller, D. K., King, J. A., Ritschel, F., Bernardoni, F., Mohammadi, S., Geisler, D., Roessner, V., Biemann, R., Marxen, M. & Ehrlich, S., 07.2019, in: PSYCHOL MED. 49, 9, S. 1555-1564 10 S.

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  23. In vivo evidence of remote neural degeneration in the lumbar enlargement after cervical injury

    David, G., Seif, M., Huber, E., Hupp, M., Rosner, J., Dietz, V., Weiskopf, N., Mohammadi, S. & Freund, P., 19.03.2019, in: NEUROLOGY. 92, 12, S. e1367-e1377

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  24. 2018

  25. Microstructural imaging of human neocortex in vivo

    Edwards, L. J., Kirilina, E., Mohammadi, S. & Weiskopf, N., 15.11.2018, in: NEUROIMAGE. 182, SI, S. 184-206 23 S.

    Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Review › Forschung

  26. Dorsal and ventral horn atrophy is associated with clinical outcome after spinal cord injury

    Huber, E., David, G., Thompson, A. J., Weiskopf, N., Mohammadi, S. & Freund, P., 24.04.2018, in: NEUROLOGY. 90, 17, S. e1510-e1522

    Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung

  27. Four in vivo g-ratio-weighted imaging methods: Comparability and repeatability at the group level

    Ellerbrock, I. & Mohammadi, S., 01.2018, in: HUM BRAIN MAPP. 39, 1, S. 24-41 18 S.

    Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung

  28. Image Analysis

    Mohammadi, S. & Callaghan, M. F., 2018, Quantitative MRI of the Brain: Principles of Physical Measurement. Cercignani, M., Dowell, N. G. & Tofts, P. S. (Hrsg.). 2 Aufl. Boca Raton: CRC Press, S. 303-324 22 S. (Series in Medical Physics and Biomedical Engineering).

    Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › SCORING: Beitrag in Sammelwerk › Forschung › Begutachtung

  29. Susceptibility distortion correction for fMRI

    Joue, G., Sommer, T. & Mohammadi, S., 2018, Society for SMRT 27th Annual Meeting. International Society for Magnetic Resonance in Medicine

    Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › Konferenzbeitrag - Poster › Forschung

  30. 2017

  31. NODDI-DTI: Estimating Neurite Orientation and Dispersion Parameters from a Diffusion Tensor in Healthy White Matter

    Edwards, L. J., Pine, K. J., Ellerbrock, I., Weiskopf, N. & Mohammadi, S., 20.12.2017, in: FRONT NEUROSCI-SWITZ. 11, S. Art. 720

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  32. Local striatal reward signals can be predicted from corticostriatal connectivity

    Smittenaar, P., Kurth-Nelson, Z., Mohammadi, S., Weiskopf, N. & Dolan, R. J., 01.10.2017, in: NEUROIMAGE. 159, 159, S. 9-17 9 S.

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  33. The efficiency of retrospective artifact correction methods in improving the statistical power of between-group differences in spinal cord DTI

    David, G., Freund, P. & Mohammadi, S., 09.2017, in: NEUROIMAGE. 158, S. 296-307 12 S.

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  34. Neurodegeneration in the Spinal Ventral Horn Prior to Motor Impairment in Cervical Spondylotic Myelopathy

    Grabher, P., Mohammadi, S., David, G. & Freund, P., 01.08.2017, in: J NEUROTRAUM. 34, 15, S. 2329-2334 6 S.

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  35. Computationale Neuroanatomie und Mikrostrukturbildgebung mit der Magnetresonanztomographie

    Mohammadi, S. & Weiskopf, N., 08.2017, in: NERVENARZT. 88, 8, S. 839-849 11 S.

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  36. 2016

  37. Synthetic quantitative MRI through relaxometry modelling

    Callaghan, M. F., Mohammadi, S. & Weiskopf, N., 12.2016, in: NMR BIOMED. 29, 12, S. 1729-1738 10 S.

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  38. Embodied neurology: an integrative framework for neurological disorders

    Freund, P., Friston, K., Thompson, A. J., Stephan, K. E., Ashburner, J., Bach, D. R., Nagy, Z., Helms, G., Draganski, B., Mohammadi, S., Schwab, M. E., Curt, A. & Weiskopf, N., 01.06.2016, in: BRAIN. 139, Pt 6, S. 1855-61

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  39. Vascular autorescaling of fMRI (VasA fMRI) improves sensitivity of population studies: A pilot study

    Kazan, S. M., Mohammadi, S., Callaghan, M. F., Flandin, G., Huber, L., Leech, R., Kennerley, A., Windischberger, C. & Weiskopf, N., 01.01.2016, in: NEUROIMAGE. 124, Pt A, S. 794-805 12 S.

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  40. Voxel-based analysis of grey and white matter degeneration in cervical spondylotic myelopathy

    Grabher, P., Mohammadi, S., Trachsler, A., Friedl, S., David, G., Sutter, R., Weiskopf, N., Thompson, A. J., Curt, A. & Freund, P., 2016, in: SCI REP-UK. 6, S. 24636

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  41. 2015

  42. Whole-Brain In-vivo Measurements of the Axonal G-Ratio in a Group of 37 Healthy Volunteers

    Mohammadi, S., Carey, D., Dick, F., Diedrichsen, J., Sereno, M. I., Reisert, M., Callaghan, M. F. & Weiskopf, N., 27.11.2015, in: FRONT HUM NEUROSCI. 9, S. Art. 441

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  43. Local but not long-range microstructural differences of the ventral temporal cortex in developmental prosopagnosia

    Song, S., Garrido, L., Nagy, Z., Mohammadi, S., Steel, A., Driver, J., Dolan, R. J., Duchaine, B. & Furl, N., 11.2015, in: NEUROPSYCHOLOGIA. 78, S. 195-206 12 S.

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  44. Deficits in tongue motor control are linked to microstructural brain damage in multiple sclerosis: a pilot study

    Holtbernd, F., Deppe, M., Bachmann, R., Mohammadi, S., Ringelstein, E. B. & Reilmann, R., 08.10.2015, in: BMC NEUROL. 15, S. Art. 190

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  45. Advances in MRI-based computational neuroanatomy: from morphometry to in-vivo histology

    Weiskopf, N., Mohammadi, S., Lutti, A. & Callaghan, M. F., 08.2015, in: CURR OPIN NEUROL. 28, 4, S. 313-22 10 S.

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  46. A general linear relaxometry model of R1 using imaging data

    Callaghan, M. F., Helms, G., Lutti, A., Mohammadi, S. & Weiskopf, N., 03.2015, in: MAGN RESON MED. 73, 3, S. 1309-14 6 S.

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  47. Structure predicts function: Combining non-invasive electrophysiology with in-vivo histology

    Helbling, S., Teki, S., Callaghan, M. F., Sedley, W., Mohammadi, S., Griffiths, T. D., Weiskopf, N. & Barnes, G. R., 03.2015, in: NEUROIMAGE. 108, S. 377-85 9 S.

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  48. POAS4SPM: a toolbox for SPM to denoise diffusion MRI data

    Tabelow, K., Mohammadi, S., Weiskopf, N. & Polzehl, J., 01.2015, in: NEUROINFORMATICS. 13, 1, S. 19-29 11 S.

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  49. Spinal cord injury

    Freund, P., Mohammadi, S., Weiskopf, N. & Curt, A., 2015, Oxford Textbook of Neuroimaging: Oxford Textbooks in Clinical Neurology. Filippi, M. (Hrsg.). 1 Aufl. Oxford: Oxford University Press, Band 1. S. 315-322 8 S.

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  50. 2014

  51. Adaptive smoothing of multi-shell diffusion weighted magnetic resonance data by msPOAS

    Becker, S. M. A., Tabelow, K., Mohammadi, S., Weiskopf, N. & Polzehl, J., 15.07.2014, in: NEUROIMAGE. 95, S. 90-105 16 S.

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  52. Estimating the apparent transverse relaxation time (R2(*)) from images with different contrasts (ESTATICS) reduces motion artifacts

    Weiskopf, N., Callaghan, M. F., Josephs, O., Lutti, A. & Mohammadi, S., 01.01.2014, in: FRONT HUM NEUROSCI. 8, S. 278

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  53. High-resolution diffusion kurtosis imaging at 3T enabled by advanced post-processing

    Mohammadi, S., Tabelow, K., Ruthotto, L., Feiweier, T., Polzehl, J. & Weiskopf, N., 2014, in: FRONT HUM NEUROSCI. 8, S. 427

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  54. 2013

  55. Retrospective correction of physiological noise in DTI using an extended tensor model and peripheral measurements

    Mohammadi, S., Hutton, C., Nagy, Z., Josephs, O. & Weiskopf, N., 01.08.2013, in: MAGN RESON MED. 70, 2, S. 358-69 12 S.

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  56. Voxel-based statistical analysis of fractional anisotropy and mean diffusivity in patients with unilateral temporal lobe epilepsy of unknown cause

    Keller, S. S., Ahrens, T., Mohammadi, S., Gerdes, J. S., Möddel, G., Kellinghaus, C., Kugel, H., Weber, B., Ringelstein, E. B. & Deppe, M., 01.07.2013, in: J NEUROIMAGING. 23, 3, S. 352-9 8 S.

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  57. The impact of post-processing on spinal cord diffusion tensor imaging

    Mohammadi, S., Freund, P., Feiweier, T., Curt, A. & Weiskopf, N., 15.04.2013, in: NEUROIMAGE. 70, S. 377-85 9 S.

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  58. Grasping multiple sclerosis: do quantitative motor assessments provide a link between structure and function?

    Reilmann, R., Holtbernd, F., Bachmann, R., Mohammadi, S., Ringelstein, E. B. & Deppe, M., 01.02.2013, in: J NEUROL. 260, 2, S. 407-14 8 S.

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  59. 2012

  60. Volume estimation of the thalamus using freesurfer and stereology: consistency between methods

    Keller, S. S., Gerdes, J. S., Mohammadi, S., Kellinghaus, C., Kugel, H., Deppe, K., Ringelstein, E. B., Evers, S., Schwindt, W. & Deppe, M., 01.10.2012, in: NEUROINFORMATICS. 10, 4, S. 341-50 10 S.

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  61. Correction of vibration artifacts in DTI using phase-encoding reversal (COVIPER)

    Mohammadi, S., Nagy, Z., Hutton, C., Josephs, O. & Weiskopf, N., 01.09.2012, in: MAGN RESON MED. 68, 3, S. 882-9 8 S.

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