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Nicole Fischer

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Publikationen

  1. 2020

  2. Merkel Cell Polyomavirus DNA Replication Induces Senescence in Human Dermal Fibroblasts in a Kap1/Trim28-Dependent Manner

    Siebels, S., Czech-Sioli, M., Spohn, M., Schmidt, C., Theiss, J., Indenbirken, D., Günther, T., Grundhoff, A. & Fischer, N., 10.03.2020, in: MBIO. 11, 2

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  3. The Ubiquitin specific Protease Usp7, a novel Merkel cell polyomavirus Large T-Antigen interaction partner, modulates viral DNA replication

    Czech-Sioli, M., Siebels, S., Radau, S., Zahedi, R. P., Schmidt, C., Dobner, T., Grundhoff, A. & Fischer, N., 14.02.2020, in: J VIROL. 94, 5

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  4. 2019

  5. DAMIAN an open source bioinformatics tool for fast, systematic and cohort based analysis of microorganisms in diagnostic samples

    Alawi, M., Burkhardt, L., Indenbirken, D., Reumann, K., Christopeit, M., Kröger, N., Lütgehetmann, M., Aepfelbacher, M., Fischer, N. & Grundhoff, A., 14.11.2019, in: SCI REP-UK. 9, 1, S. 16841

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  6. Chronic equine hepacivirus infection in an adult gelding with severe hepatopathy

    Tegtmeyer, B., Echelmeyer, J., Pfankuche, V. M., Puff, C., Todt, D., Fischer, N., Durham, A., Feige, K., Baumgärtner, W., Steinmann, E. & Cavalleri, J-M. V., 08.2019, in: VET MED SCI. 5, 3, S. 372-378 7 S.

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  7. Detection and Characterization of Circulating Tumor Cells in Patients with Merkel Cell Carcinoma

    Riethdorf, S., Hildebrandt, L., Heinzerling, L., Heitzer, E., Fischer, N., Bergmann, S., Mauermann, O., Waldispühl-Geigl, J., Coith, C., Schön, G., Peine, S., Schuler, G., Speicher, M. R., Moll, I. & Pantel, K., 03.2019, in: CLIN CHEM. 65, 3, S. 462-472 11 S.

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  8. Changes in the composition of the upper respiratory tract microbial community in granulomatosis with polyangiitis

    Lamprecht, P., Fischer, N., Huang, J., Burkhardt, L., Lütgehetmann, M., Arndt, F., Rolfs, I., Kerstein, A., Iking-Konert, C. & Laudien, M., 02.2019, in: J AUTOIMMUN. 97, S. 29-39 11 S.

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  9. Piscine Orthoreovirus 3 Is Not the Causative Pathogen of Proliferative Darkening Syndrome (PDS) of Brown Trout ()

    Fux, R., Arndt, D., Langenmayer, M. C., Schwaiger, J., Ferling, H., Fischer, N., Indenbirken, D., Grundhoff, A., Dölken, L., Adamek, M., Steinhagen, D. & Sutter, G., 28.01.2019, in: VIRUSES-BASEL. 11, 2

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  10. Further characterization of bovine hepacivirus: Antibody response, course of infection, and host tropism

    Baechlein, C., Baron, A. L., Meyer, D., Gorriz-Martin, L., Pfankuche, V. M., Baumgärtner, W., Polywka, S., Peine, S., Fischer, N., Rehage, J. & Becher, P., 01.2019, in: TRANSBOUND EMERG DIS. 66, 1, S. 195-206 12 S.

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  11. Identification of a novel clade of group A rotaviruses in fatally diseased domestic pigeons in Europe

    Rubbenstroth, D., Peus, E., Schramm, E., Kottmann, D., Bartels, H., McCowan, C., Schulze, C., Akimkin, V., Fischer, N., Wylezich, C., Hlinak, A., Spadinger, A., Großmann, E., Petersen, H., Grundhoff, A., Rautenschlein, S. & Teske, L., 01.2019, in: TRANSBOUND EMERG DIS. 66, 1, S. 552-561 10 S.

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  12. 2018

  13. Generation of a novel next-generation sequencing-based method for the isolation of new human papillomavirus types

    Brancaccio, R. N., Robitaille, A., Dutta, S., Cuenin, C., Santare, D., Skenders, G., Leja, M., Fischer, N., Giuliano, A. R., Rollison, D. E., Grundhoff, A., Tommasino, M. & Gheit, T., 07.2018, in: VIROLOGY. 520, S. 1-10 10 S.

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  14. HEV-positive blood donations represent a relevant infection risk for immunosuppressed recipients

    Westhölter, D., Hiller, J., Denzer, U., Polywka, S., Ayuk, F., Rybczynski, M., Horvatits, T., Gundlach, S., Blöcker, J., Schulze Zur Wiesch, J., Fischer, N., Addo, M. M., Peine, S., Göke, B., Lohse, A. W., Lütgehetmann, M. & Pischke, S., 07.2018, in: J HEPATOL. 69, 1, S. 36-42 7 S.

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  15. Novel Human Polyomavirus Noncoding Control Regions Differ in Bidirectional Gene Expression according to Host Cell, Large T-Antigen Expression, and Clinically Occurring Rearrangements

    Ajuh, E. T., Wu, Z., Kraus, E., Weissbach, F. H., Bethge, T., Gosert, R., Fischer, N. & Hirsch, H. H., 01.04.2018, in: J VIROL. 92, 7, S. e02231-17

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  16. Epidemiology, biology and therapy of Merkel cell carcinoma:conclusions from the EU project IMMOMEC

    Becker, J. C., Stang, A., Hausen, A. Z., Fischer, N., DeCaprio, J. A., Tothill, R. W., Lyngaa, R., Hansen, U. K., Ritter, C., Nghiem, P., Bichakjian, C. K., Ugurel, S. & Schrama, D., 03.2018, in: CANCER IMMUNOL IMMUN. 67, 3, S. 341-351 11 S.

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  17. Pathogenetic and Clinical Aspects of Anti-Neutrophil Cytoplasmic Autoantibody-Associated Vasculitides

    Lamprecht, P., Kerstein, A., Klapa, S., Schinke, S., Karsten, C. M., Yu, X., Ehlers, M., Epplen, J. T., Holl-Ulrich, K., Wiech, T., Kalies, K., Lange, T., Laudien, M., Laskay, T., Gemoll, T., Schumacher, U., Ullrich, S., Busch, H., Ibrahim, S., Fischer, N., Hasselbacher, K., Pries, R., Petersen, F., Weppner, G., Manz, R., Humrich, J. Y., Nieberding, R., Riemekasten, G. & Müller, A., 2018, in: FRONT IMMUNOL. 9, S. 680

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  18. 2017

  19. High Abundance and Genetic Variability of Atypical Porcine Pestivirus in Pigs from Europe and Asia

    Postel, A., Meyer, D., Cagatay, G. N., Feliziani, F., De Mia, G. M., Fischer, N., Grundhoff, A., Milićević, V., Deng, M-C., Chang, C-Y., Qiu, H-J., Sun, Y., Wendt, M. & Becher, P., 12.2017, in: EMERG INFECT DIS. 23, 12, S. 2104-2107 4 S.

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  20. Complete Genome Sequence of a Novel Human Gammapapillomavirus Isolated from Skin

    Brancaccio, R. N., Robitaille, A., Dutta, S., Rollison, D. E., Fischer, N., Grundhoff, A., Tommasino, M. & Gheit, T., 24.08.2017, in: Genome Announc. 5, 34

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  21. Spontaneous lung metastasis formation of human Merkel cell carcinoma cell lines transplanted into scid mice

    Knips, J., Czech-Sioli, M., Spohn, M., Heiland, M., Moll, I., Grundhoff, A., Schumacher, U. & Fischer, N., 01.07.2017, in: INT J CANCER. 141, 1, S. 160-171

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  22. Recovery of the first full-length genome sequence of a parapoxvirus directly from a clinical sample

    Günther, T., Haas, L., Alawi, M., Wohlsein, P., Marks, J., Grundhoff, A., Becher, P. & Fischer, N., 16.06.2017, in: SCI REP-UK. 7, 1, S. 3734

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  23. Successful retreatment of a patient with chronic hepatitis C genotype 2k/1b virus with ombitasvir/paritaprevir/ritonavir plus dasabuvir

    Todt, D., Schlevogt, B., Deterding, K., Grundhoff, A., Manns, M. P., Wedemeyer, H., Fischer, N., Cornberg, M. & Steinmann, E., 01.05.2017, in: J ANTIMICROB CHEMOTH. 72, 5, S. 1541-1543 3 S.

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  24. Pregnancy-Related Immune Adaptation Promotes the Emergence of Highly Virulent H1N1 Influenza Virus Strains in Allogenically Pregnant Mice

    Engels, G., Hierweger, A. M., Hoffmann, J., Thieme, R., Thiele, S., Bertram, S., Dreier, C., Resa-Infante, P., Jacobsen, H., Thiele, K., Alawi, M., Indenbirken, D., Grundhoff, A., Siebels, S., Fischer, N., Stojanovska, V., Muzzio, D., Jensen, F., Karimi, K., Mittrücker, H-W., Arck, P. C. & Gabriel, G., 08.03.2017, in: CELL HOST MICROBE. 21, 3, S. 321-333 13 S.

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  25. Novel poly-uridine insertion in the 3'UTR and E2 amino acid substitutions in a low virulent classical swine fever virus

    Coronado, L., Liniger, M., Muñoz-González, S., Postel, A., Pérez, L. J., Pérez-Simó, M., Perera, C. L., Frías-Lepoureau, M. T., Rosell, R., Grundhoff, A., Indenbirken, D., Alawi, M., Fischer, N., Becher, P., Ruggli, N. & Ganges, L., 03.2017, in: VET MICROBIOL. 201, S. 103-112 10 S.

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  26. 2016

  27. Autoimmune Renal Disease Is Exacerbated by S1P-Receptor-1-Dependent Intestinal Th17 Cell Migration to the Kidney

    Krebs, C. F., Paust, H-J., Krohn, S., Koyro, T., Brix, S. R., Riedel, J-H., Bartsch, P., Wiech, T., Meyer-Schwesinger, C., Huang, J., Fischer, N., Busch, C. P., Mittrücker, H-W., Steinhoff, U., Stockinger, B., Perez, L. G., Wenzel, U. O., Janneck, M., Steinmetz, O. M., Gagliani, N., Stahl, R. A. K., Huber, S., Turner, J-E. & Panzer, U., 15.11.2016, in: IMMUNITY. 45, 5, S. 1078-1092 15 S.

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  28. Replication of merkel cell polyomavirus induces reorganization of promyelocytic leukemia nuclear bodies

    Neumann, F., Czech-Sioli, M., Dobner, T., Grundhoff, A., Schreiner, S. & Fischer, N., 11.2016, in: J GEN VIROL. 97, 11, S. 2926-2938

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  29. Multicenter quality assessment of 16S ribosomal DNA-sequencing for microbiome analyses reveals high inter-center variability

    Hiergeist, A., Reischl, U., Priority Program 1656 Intestinal Microbiota Consortium/ quality assessment participants & Gessner, A., 08.2016, in: INT J MED MICROBIOL. 306, 5, S. 334-42 9 S.

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  30. Suspected encephalitis with Candida tropicalis and Fusarium detected by unbiased RNA sequencing

    Christopeit, M., Grundhoff, A., Rohde, H., Belmar-Campos, C., Grzyska, U., Fiehler, J., Wolschke, C., Kröger, N-M. & Fischer, N., 29.07.2016, in: ANN HEMATOL. 95, 11, S. 1919-1921

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  31. Pegivirus Infection in Domestic Pigs, Germany

    Baechlein, C., Grundhoff, A., Fischer, N., Alawi, M., Hoeltig, D., Waldmann, K-H. & Becher, P., 07.2016, in: EMERG INFECT DIS. 22, 7, S. 1312-4 3 S.

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  32. Frequent presence of hepaci and pegiviruses in commercial equine serum pools

    Postel, A., Cavalleri, J-M. V., Pfaender, S., Walter, S., Steinmann, E., Fischer, N., Feige, K., Haas, L. & Becher, P., 15.01.2016, in: VET MICROBIOL. 182, S. 8-14 7 S.

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  33. Tropheryma whipplei in children with diarrhoea in rural Ghana

    Vinnemeier, C. D., Klupp, E. M., Krumkamp, R., Rolling, T., Fischer, N., Owusu-Dabo, E., Addo, M. M., Adu-Sarkodie, Y., Käsmaier, J., Aepfelbacher, M., Cramer, J. P., May, J. & Tannich, E., 08.01.2016, in: CLIN MICROBIOL INFEC. 22, 1, S. 65.e1 - 65.e3

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  34. Investigation of Viral and Host Chromatin by ChIP-PCR or ChIP-Seq Analysis

    Günther, T., Theiss, J. M., Fischer, N. & Grundhoff, A., 2016, in: Curr Protoc Microbiol. 40, S. 1E.10.1-1E.10.21

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  35. Presence of atypical porcine pestivirus (APPV) genomes in newborn piglets correlates with congenital tremor

    Postel, A., Hansmann, F., Baechlein, C., Fischer, N., Alawi, M., Grundhoff, A., Derking, S., Tenhündfeld, J., Pfankuche, V. M., Herder, V., Baumgärtner, W., Wendt, M. & Becher, P., 2016, in: SCI REP-UK. 6, S. 27735

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  36. 2015

  37. Merkel cell polyomavirus, a highly prevalent virus with tumorigenic potential

    Grundhoff, A. & Fischer, N., 05.10.2015, in: CURR OPIN VIROL. 14, S. 129-137 9 S.

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  38. A Comprehensive Analysis of Replicating Merkel Cell Polyomavirus Genomes Delineates the Viral Transcription Program and Suggests a Role for mcv-miR-M1 in Episomal Persistence

    Theiss, J. M., Günther, T., Alawi, M., Neumann, F., Tessmer, U., Fischer, N. & Grundhoff, A., 07.2015, in: PLOS PATHOG. 11, 7, S. e1004974

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  39. Evaluation of Unbiased Next-Generation Sequencing of RNA (RNA-seq) as a Diagnostic Method in Influenza Virus-Positive Respiratory Samples

    Fischer, N., Indenbirken, D., Meyer, T., Lütgehetmann, M., Lellek, H., Spohn, M., Aepfelbacher, M., Alawi, M. & Grundhoff, A., 07.2015, in: J CLIN MICROBIOL. 53, 7, S. 2238-50 13 S.

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  40. Identification of a Novel Hepacivirus in Domestic Cattle from Germany

    Fischer, N., Baechlein, C., Grundhoff, A., Alawi, M., Indenbirken, D., Postel, A., Baron, A. L., Offinger, J., Becker, K., Beineke, A., Rehage, J. & Becher, P., 07.2015, in: J VIROL. 89, 14, S. 7007-15 9 S.

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  41. Highly divergent hepaciviruses from African cattle

    Corman, V. M., Grundhoff, A., Baechlein, C., Fischer, N., Gmyl, A., Wollny, R., Dei, D., Ritz, D., Binger, T., Adankwah, E., Marfo, K. S., Annison, L., Annan, A., Adu-Sarkodie, Y., Oppong, S., Becher, P., Drosten, C. & Drexler, J. F., 06.2015, in: J VIROL. 89, 11, S. 5876-82 7 S.

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  42. Close relationship of ruminant pestiviruses and classical Swine Fever virus

    Postel, A., Schmeiser, S., Oguzoglu, T. C., Indenbirken, D., Alawi, M., Fischer, N., Grundhoff, A. & Becher, P., 04.2015, in: EMERG INFECT DIS. 21, 4, S. 668-72 5 S.

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  43. In Vitro Replication Assay for Merkel Cell Polyomavirus (MCPyV)

    Neumann, F., Czech-Sioli, M., Grundhoff, A. & Fischer, N., 2015, in: Curr Protoc Microbiol. 38, S. 14F.2.1-14F.2.19

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  44. 2014

  45. Complete Genome Sequence of Pronghorn Virus, a Pestivirus.

    Neill, J., Ridpath, J., Fischer, N., Grundhoff, A., Postel, A. & Becher, P., 12.06.2014, in: Genome Announc. 2, 3, S. e00575-14

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  46. Merkel Cell Polyomavirus

    Fischer, N. & Adam, G., 12.06.2014, Cancers in People with HIV and AIDS: Progress and Challenges. Yarchoan, R. (Hrsg.). 1 Aufl. Springer, S. 113-122 10 S.

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  47. Rapid Metagenomic Diagnostics for Suspected Outbreak of Severe Pneumonia

    Fischer, N., Rohde, H., Indenbirken, D., Günther, T., Reumann, K., Lütgehetmann, M., Meyer, T., Kluge, S., Aepfelbacher, M., Alawi, M. & Grundhoff, A., 01.06.2014, in: EMERG INFECT DIS. 20, 6, S. 1072-5 4 S.

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  48. High-affinity Rb Binding, p53 Inhibition, Subcellular Localization, and Transformation by Wild-Type or Tumor-Derived Shortened Merkel Cell Polyomavirus Large T Antigens

    Borchert, S., Czech-Sioli, M., Neumann, F., Schmidt, C., Wimmer, P., Dobner, T., Grundhoff, A. & Fischer, N., 01.03.2014, in: J VIROL. 88, 6, S. 3144-60 17 S.

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  49. Complete Genome Sequence of Bovine Pestivirus Strain PG-2, a Second Member of the Tentative Pestivirus Species Giraffe

    Becher, P., Fischer, N., Grundhoff, A., Stalder, H., Schweizer, M. & Postel, A., 01.01.2014, in: Genome Announc. 2, 3

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  50. Merkel cell polyomavirus detection in Merkel cell cancer tumors in Northern Germany using PCR and protein expression

    Leitz, M., Stieler, K., Grundhoff, A., Moll, I., Brandner, J. M. & Fischer, N., 2014, in: J MED VIROL. 86 , 10, S. 1813-1819

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  51. Nachweis von Bakterien, Pilzen und Viren im Hochdurchsatz

    Fischer, N. & Grundhoff, A., 2014, in: BIOspektrum. 20, 5, S. 524-527 4 S., BIOspektrum 05.14.

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  52. 2013

  53. Utilization of replication-competent XMRV reporter-viruses reveals severe viral restriction in primary human cells

    Stürzel, C. M., Palesch, D., Khalid, M., Wissing, S., Fischer, N. & Münch, J., 01.01.2013, in: PLOS ONE. 8, 9, S. e74427

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  54. 2012

  55. In-depth investigation of archival and prospectively collected samples reveals no evidence for XMRV infection in prostate cancer.

    Lee, D., Jaydip, D. G., Gaughan, C., Steffen, I., Tang, N., Luk, K-C., Qiu, X., Urisman, A., Fischer, N., Molinaro, R., Broz, M., Schochetman, G., Klein, E. A., Ganem, D., Derisi, J. L., Simmons, G., Hackett, J., Silverman, R. H. & Chiu, C. Y., 2012, in: PLOS ONE. 7, 9, S. 44954 9.

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  56. XMRV induces cell migration, cytokine expression and tumor angiogenesis: are 22Rv1 cells a suitable prostate cancer model?

    Stieler, K., Schumacher, U., Horst, A. & Fischer, N., 2012, in: PLOS ONE. 7, 7, S. 42321 7.

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  57. 2011

  58. No detection of XMRV in blood samples and tissue sections from prostate cancer patients in Northern Europe.

    Stieler, K., Schindler, S., Schlomm, T., Hohn, O., Bannert, N., Simon, R., Minner, S. J. P., Schindler, M. & Fischer, N., 2011, in: PLOS ONE. 6, 10, S. 25592 10.

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  59. Replication, gene expression and particle production by a consensus Merkel Cell Polyomavirus (MCPyV) genome.

    Neumann, F., Borchert, S., Schmidt, C., Reimer, R., Hohenberg, H., Fischer, N. & Grundhoff, A., 2011, in: PLOS ONE. 6, 12, S. 29112 12.

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  60. S100A7/psoriasin expression in the human lung: unchanged in patients with COPD, but upregulated upon positive S. aureus detection.

    Andresen, E., Lange, C., Strodthoff, D., Goldmann, T., Fischer, N., Sahly, H., Branscheid, D. & Heine, H., 2011, in: BMC PULM MED. 11, S. 10

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