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Institut für Computational Neuroscience

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Publikationen

  1. 3D cerebrovascular segmentation combining fuzzy vessel enhancement and level-sets with anisotropic energy weights

    Forkert, N. D., Schmidt-Richberg, A., Fiehler, J., Illies, T., Möller, D., Säring, D., Handels, H. & Ehrhardt, J., 01.02.2013, in: MAGN RESON IMAGING. 31, 2, S. 262-71 10 S.

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  2. [3-dimensional display of computed tomographic studies of craniofacial anomalies]

    Witte, G., Höltje, W., Tiede, U. & Riemer, M., 1986, in: ROFO-FORTSCHR RONTG. 144, 4, S. 400-405 4.

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  3. 3-D segmentation of MR images of the head for 3-D display.

    Bomans, M., Hohne, K. H., Tiede, U. & Riemer, M., 1990, in: IEEE T MED IMAGING. 9, 2, S. 177-183 2.

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  4. 3D Segmentation of the Left Ventricle Combining Long- and Short-axis MR Images.

    Säring, D., Relan, J., Groth, M., Müllerleile, K. & Handels, H., 2009, in: METHOD INFORM MED. 48, 4, 4.

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  5. 3d-SMRnet: Achieving a New Quality of MPI System Matrix Recovery by Deep Learning

    Baltruschat, I. M., Szwargulski, P. K., Griese, F., Grosser, M., Werner, R. & Knopp, T., 10.2020, Medical Image Computing and Computer Assisted Intervention – MICCAI 2020: 23rd International Conference, Lima, Peru, October 4–8, 2020, Proceedings, Part II. 1 Aufl. Springer Nature Switzerland, S. 74-82 9 S. (Lecture Notes in Computer Science (LNCS); Nr. 12262).

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  6. [3-D visualization of dose distributions in CT image volumes]

    Tabbert, E., Riemer, M., Schiemann, T., Tiede, U. & Höhne, K. H., 1992, in: STRAHLENTHER ONKOL. 168, 1, S. 31-34 1.

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  7. 4D blood flow visualization fusing 3D and 4D MRA image sequences.

    Forkert, N., Fiehler, J., Illies, T., Möller, D. P. F., Handels, H. & Säring, D., 2012, in: J MAGN RESON IMAGING. 36, 2, S. 443-453 2.

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  8. 4D CT image artifacts affect local control in SBRT of lung and liver metastases

    Sentker, T., Schmidt, V., Ozga, A-K., Petersen, C., Madesta, F., Hofmann, C., Werner, R. & Gauer, T., 07.2020, in: RADIOTHER ONCOL. 148, S. 229-234 6 S.

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  9. 4D dose simulation in volumetric arc therapy: Accuracy and affecting parameters

    Sothmann, T., Gauer, T. & Werner, R., 2017, in: PLOS ONE. 12, 2, S. e0172810 17 S.

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  10. 4D medical image computing and visualization of lung tumor mobility in spatio-temporal CT image data.

    Handels, H., Werner, R., Schmidt, R., Frenzel, T., Lu, W., Low, D. & Ehrhardt, J., 2007, in: INT J MED INFORM. 76, 3, S. 433-439 3.

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  11. 4D Motion Modeling: Estimation of Respiratory Motion for Radiation Therapy

    Ehrhardt, J., Schmidt-Richberg, A., Werner, R. & Handels, H., 2009, World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering September 7 - 12, 2009 Munich, Germany (Ifmbe Proceedings). Springer-Verlag GmbH, S. 2166-2169 4 S.

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  12. A Bayesian Alternative to Mutual Information for the Hierarchical Clustering of Dependent Random Variables

    Marrelec, G., Messé, A. & Bellec, P., 2015, in: PLOS ONE. 10, 9, S. e0137278

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  13. Ability of extracellular volume imaging to serially measure infarct size compared to LGE within six months after acute myocardial infarction

    Sinn, M., Tahir, E., Radunski, U. K., Säring, D., Müllerleile, K., Stehning, C., Adam, G. & Lund, G., 03.02.2015, Journal of Cardiovascular Magnetic Resonance .

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  14. A blueprint of mammalian cortical connectomes

    Goulas, A., Majka, P., Rosa, M. G. P. & Hilgetag, C. C., 03.2019, in: PLOS BIOL. 17, 3, S. e2005346

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  15. A closer look at the apparent correlation of structural and functional connectivity in excitable neural networks

    Messé, A., Hütt, M-T., König, P. & Hilgetag, C. C., 19.01.2015, in: SCI REP-UK. 5, S. Art. 7870

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  16. A computerized three-dimensional atlas of the human skull and brain.

    Tiede, U., Bomans, M., Höhne, K. H., Pommert, A., Riemer, M., Schiemann, T., Schubert, R. & Lierse, W., 1993, in: AM J NEURORADIOL. 14, 3, S. 551-551 3.

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  17. A Connectomic Hypothesis for the Hominization of the Brain

    Changeux, J-P., Goulas, A. & Hilgetag, C. C., 31.03.2021, in: CEREB CORTEX. 31, 5, S. 2425-2449 25 S.

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  18. Adhesion to laminin-1 and collagen IV induces the formation of Ca2+ microdomains that sensitize mouse T cells for activation

    Weiß, M., Hernandez, L. C., Gil Montoya, D. C., Löhndorf, A., Krüger, A., Kopdag, M., Uebler, L., Landwehr, M., Nawrocki, M., Huber, S., Woelk, L-M., Werner, R., Failla, A. V., Flügel, A., Dupont, G., Guse, A. H. & Diercks, B-P., 20.06.2023, in: SCIENCE SIGNALING. 16, 790, S. eabn9405

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  19. Advances in medical image computing.

    Handels, H., Horsch, A. & Meinzer, H-P., 2007, in: METHOD INFORM MED. 46, 3, S. 251-253 3.

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  20. Advances in medical image computing.

    Tolxdorff, T., Deserno, T. M., Handels, H. & Meinzer, H-P., 2009, in: METHOD INFORM MED. 48, 4, S. 311-313 4.

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  21. A dynamical pattern recognition model of gamma activity in auditory cortex.

    Zavaglia, M., Canolty, R. T., Schofield, T. M., Leff, A. P., Ursino, M., Knight, R. T. & Penny, W. D., 2012, in: NEURAL NETWORKS. 28, S. 1-14

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  22. A Flexible Variational Registration Framework

    Schmidt-Richberg, A., Werner, R., Handels, H. & Ehrhardt, J., 09.05.2014, in: Insight Journal. 12 S.

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  23. A framework for representation and visualization of 3D shape variability of organs in an interactive anatomical atlas.

    Handels, H. & Hacker, S., 2009, in: METHOD INFORM MED. 48, 3, S. 272-281 3.

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  24. A Framework for Visuo-Haptic Simulation of Puncture Interventions

    Färber, M., Dalek, D., Habermann, C., Hummel, F., Schöps, C. & Handels, H., 2009, Proceedings 154 - Informatik 2009 Im Focus Leben: Jahrestagung Lübeck. Köllen Verlag Bonn, S. 1309-1316 8 S.

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  25. Aligning 3D time-of-flight MRA datasets for quantitative longitudinal studies: evaluation of rigid registration techniques

    Verleger, T., Schönfeld, M., Säring, D., Siemonsen, S., Fiehler, J. & Forkert, N. D., 2014, in: MAGN RESON IMAGING. 32, 10, S. 1390-5 6 S.

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  26. Altered topology of large-scale structural brain networks in chronic stroke

    Cheng, B., Schlemm, E., Schulz, R., Bönstrup, M., Messe, A., Hilgetag, C-C., Gerloff, C. & Thomalla, G., 04.10.2019, in: BRAIN COMMUN. 2019, 1, S. 1-13

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  27. Altered topology of structural brain networks in patients with Gilles de la Tourette syndrome

    Schlemm, E., Cheng, B., Fischer, F., Hilgetag, C., Gerloff, C. & Thomalla, G., 06.09.2017, in: SCI REP-UK. 7, 1, S. 10606

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  28. A Modular Framework for Post-Processing and Analysis of Fluorescence Microscopy Image Sequences of Subcellular Calcium Dynamics

    Schetelig, D., Wolf, I., Diercks, B-P., Fliegert, R., Guse, A., Schlaefer, A. & Werner, R., 2015, Bildverarbeitung für die Medizin 2015. Handels, H., Deserno, T. M., Meinzer, H-P. & Tolxdorff, T. (Hrsg.). 1 Aufl. Berlin Heidelberg: Springer, S. 401-406 6 S. (Informatik Aktuell).

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  29. Analyse und dynamische 3D-Visualisierung des Blutflusses von zerebralen Gefäßstrukturen unter Verwendung von 3D- und 4D-Magnetresonanzangiographie-Bildfolgen

    Forkert, N., 2009, Informatiktage 2009 Lecture Notes in Informatics (LNI) - Seminars. Köllen Verlag Bonn, S. 223-226 4 S.

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  30. Analysis and dynamic 3D visualization of cerebral blood flow combining 3D and 4D MR image sequences (Proceedings Paper)

    Forkert, N., Säring, D., Fiehler, J., Illies, T., Dietmar, M. & Handels, H., 2009, Medical Imaging 2009: Visualization, Image-Guided Procedures, and Modeling (Proceedings Volume). SPIE, S. 331-338 8 S.

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  31. Analysis of Dose Shifts induced by Organ Movements during Treatment with TomoTherapy using a Motion Phantom and GafChromic EBT Films

    Grohmann, C., Werner, R., Dirk, A. & Cremers, F., 2009, World Congress on Medical Physics and Biomedical Engineering September 7 - 12, 2009 Munich, Germany (Ifmbe Proceedings). Springer-Verlag GmbH, S. 1020-1023 4 S.

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  32. Analysis of the influence of 4D MR angiography temporal resolution on time-to-peak estimation error for different cerebral vessel structures.

    Forkert, N., Illies, T., Möller, D., Handels, H., Säring, D. & Fiehler, J., 2012, in: AM J NEURORADIOL. 33, 11, S. 2103-2109 11.

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  33. Analysis of the influence of imaging-related uncertainties on cerebral aneurysm deformation quantification using a no-deformation physical flow phantom

    Schetelig, D., Sedlacik, J., Fiehler, J., Frölich, A., Knopp, T., Sothmann, T., Waschkewitz, J. & Werner, R., 20.07.2018, in: SCI REP-UK. 8, 1, S. 11004 9 S., 11004.

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  34. An anatomical atlas to support the virtual planning of hip operations.

    Ehrhardt, J., Handels, H., Wegner, T., Strathmann, B., Plötz, W. & Pöppl, S. J., 2000, in: Stud Health Technol Inform. 77, S. 1226-1230

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  35. An architectonic type principle integrates macroscopic cortico-cortical connections with intrinsic cortical circuits of the primate brain

    Hilgetag, C. C., Beul, S. F., van Albada, S. J. & Goulas, A., 2019, in: NETW NEUROSCI. 3, 4, S. 905-923 19 S.

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  36. An architectonic type principle in the development of laminar patterns of cortico-cortical connections

    Beul, S. F., Goulas, A. & Hilgetag, C. C., 05.2021, in: BRAIN STRUCT FUNCT. 226, 4, S. 979-987 9 S.

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  37. Anatomical connectivity defines the organization of clusters of cortical areas in the macaque monkey and the cat

    Hilgetag, C. C., Burns, G. A., O'Neill, M. A., Scannell, J. W. & Young, M. P., 29.01.2000, in: PHILOS T R SOC B. 355, 1393, S. 91-110 20 S.

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  38. A natural cortical axis connecting the outside and inside of the human brain

    Hilgetag, C-C., Goulas, A. & Changeux, J-P., 02.08.2022, in: NETW NEUROSCI. 6, 4, S. 950–959 10 S.

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  39. A neural mass model for the simulation of cortical activity estimated from high resolution EEG during cognitive or motor tasks.

    Zavaglia, M., Astolfi, L., Babiloni, F. & Ursino, M., 2006, in: J NEUROSCI METH. 157, 2, S. 317-329 2.

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  40. A neural mass model of interconnected regions simulates rhythm propagation observed via TMS-EEG.

    Cona, F., Zavaglia, M., Massimini, M., Rosanova, M. & Ursino, M., 2011, in: NEUROIMAGE. 57, 3, S. 1045-1058 3.

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  41. A neural network model of multisensory representation of peripersonal space: effect of tool use.

    Ursino, M., Zavaglia, M., Magosso, E., Serino, A. & Giuseppe, D. P., 2007, in: Conf Proc IEEE Eng Med Biol Soc. 2007, S. 2735-2739

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  42. A new cerebral vessel benchmark dataset (CAPUT) for validation of image-based aneurysm deformation estimation algorithms

    Schetelig, D., Frölich, A., Knopp, T. & Werner, R., 30.10.2018, in: SCI REP-UK. 8, 1, S. 15999 8 S.

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  43. A new method for practicing exploration, dissection, and simulation with a complete computerized three-dimensional model of the brain and skull.

    Schubert, R., Höhne, K. H., Pommert, A., Riemer, M., Schiemann, T., Tiede, U. & Lierse, W., 1994, in: Acta Anat (Basel). 150, 1, S. 69-74 1.

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  44. A new method for representing the human anatomy.

    Schubert, R., Bomans, M., Höhne, K. H., Pommert, A., Riemer, M., Schiemann, T., Tiede, U. & Lierse, W., 1993, in: COMPUT MED IMAG GRAP. 17, 4-5, S. 243-249 4-5.

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  45. A new representation of knowledge concerning human anatomy and function.

    Höhne, K. H., Pflesser, B., Pommert, A., Riemer, M., Schiemann, T., Schubert, R. & Tiede, U., 1995, in: NAT MED. 1, 6, S. 506-511 6.

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  46. An optical flow based method for improved reconstruction of 4D CT data sets acquired during free breathing.

    Ehrhardt, J., Werner, R., Säring, D., Frenzel, T., Lu, W., Low, D. & Handels, H., 2007, in: MED PHYS. 34, 2, S. 711-721 2.

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  47. A novel interactive anatomic atlas of the hand.

    Gehrmann, S., Höhne, K. H., Linhart, W., Pflesser, B., Pommert, A., Riemer, M., Tiede, U., Windolf, J., Schumacher, U. & Rueger, J. M., 2006, in: CLIN ANAT. 19, 3, S. 258-266 3.

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  48. A Novel network classifier and its application: Optimal hierarchical orderings of the cat visual system from anatomical data

    Hilgetag, C-C., O'Neill, M. A., Scannell, J. W. & Young, M. P., 1995, Genetic Algorithms in Engineering Systems: Innovations and Applications: IEEE Publication # 414. IEEE, S. 71-75

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  49. AnToNIa: A Software Tool for the Hemodynamic Analysis of Cerebral Vascular Malformations Using 3D and 4D MRA Image Sequences

    Forkert, N., Säring, D., Fiehler, J., Illies, T., Möller, D. & Handels, H., 2009, Proceedings 154 - Informatik 2009 Im Focus Leben (Jahrestagung Lübeck). Köllen Verlag Bonn, S. 1309-1316 8 S.

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  50. [Applicability of digital methods in x-ray diagnosis]

    Witte, G., Höhne, K. H., Böcker, F., Riemer, M. & Bücheler, E., 1985, in: ROFO-FORTSCHR RONTG. 142, 6, S. 600-610 6.

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