Identification of ten variants associated with risk of estrogen-receptor-negative breast cancer

TY - JOUR

T1 - Identification of ten variants associated with risk of estrogen-receptor-negative breast cancer

AU - Milne, Roger L

AU - Kuchenbaecker, Karoline B

AU - Michailidou, Kyriaki

AU - Beesley, Jonathan

AU - Kar, Siddhartha

AU - Lindström, Sara

AU - Hui, Shirley

AU - Lemaçon, Audrey

AU - Soucy, Penny

AU - Dennis, Joe

AU - Jiang, Xia

AU - Rostamianfar, Asha

AU - Finucane, Hilary

AU - Bolla, Manjeet K

AU - McGuffog, Lesley

AU - Wang, Qin

AU - Aalfs, Cora M

AU - Adams, Marcia

AU - Adlard, Julian

AU - Agata, Simona

AU - Ahmed, Shahana

AU - Ahsan, Habibul

AU - Aittomäki, Kristiina

AU - Al-Ejeh, Fares

AU - Allen, Jamie

AU - Ambrosone, Christine B

AU - Amos, Christopher I

AU - Andrulis, Irene L

AU - Anton-Culver, Hoda

AU - Antonenkova, Natalia N

AU - Arndt, Volker

AU - Arnold, Norbert

AU - Aronson, Kristan J

AU - Auber, Bernd

AU - Auer, Paul L

AU - Ausems, Margreet G E M

AU - Azzollini, Jacopo

AU - Bacot, François

AU - Balmaña, Judith

AU - Barile, Monica

AU - Barjhoux, Laure

AU - Barkardottir, Rosa B

AU - Barrdahl, Myrto

AU - Barnes, Daniel

AU - Barrowdale, Daniel

AU - Baynes, Caroline

AU - Beckmann, Matthias W

AU - Benitez, Javier

AU - Bermisheva, Marina

AU - Bernstein, Leslie

AU - Bignon, Yves-Jean

AU - Blazer, Kathleen R

AU - Blok, Marinus J

AU - Blomqvist, Carl

AU - Blot, William

AU - Bobolis, Kristie

AU - Boeckx, Bram

AU - Bogdanova, Natalia V

AU - Bojesen, Anders

AU - Bojesen, Stig E

AU - Bonanni, Bernardo

AU - Børresen-Dale, Anne-Lise

AU - Bozsik, Aniko

AU - Bradbury, Angela R

AU - Brand, Judith S

AU - Brauch, Hiltrud

AU - Brenner, Hermann

AU - Bressac-de Paillerets, Brigitte

AU - Brewer, Carole

AU - Brinton, Louise

AU - Broberg, Per

AU - Brooks-Wilson, Angela

AU - Brunet, Joan

AU - Brüning, Thomas

AU - Burwinkel, Barbara

AU - Buys, Saundra S

AU - Byun, Jinyoung

AU - Cai, Qiuyin

AU - Caldés, Trinidad

AU - Caligo, Maria A

AU - Campbell, Ian

AU - Canzian, Federico

AU - Caron, Olivier

AU - Carracedo, Angel

AU - Carter, Brian D

AU - Castelao, J Esteban

AU - Castera, Laurent

AU - Caux-Moncoutier, Virginie

AU - Chan, Salina B

AU - Chang-Claude, Jenny

AU - Chanock, Stephen J

AU - Chen, Xiaoqing

AU - Cheng, Ting-Yuan David

AU - Chiquette, Jocelyne

AU - Christiansen, Hans

AU - Claes, Kathleen B M

AU - Clarke, Christine L

AU - Conner, Thomas

AU - Conroy, Don M

AU - Cook, Jackie

AU - Cordina-Duverger, Emilie

AU - Cornelissen, Sten

AU - Coupier, Isabelle

AU - Cox, Angela

AU - Cox, David G

AU - Cross, Simon S

AU - Cuk, Katarina

AU - Cunningham, Julie M

AU - Czene, Kamila

AU - Daly, Mary B

AU - Damiola, Francesca

AU - Darabi, Hatef

AU - Davidson, Rosemarie

AU - De Leeneer, Kim

AU - Devilee, Peter

AU - Dicks, Ed

AU - Diez, Orland

AU - Ding, Yuan Chun

AU - Ditsch, Nina

AU - Doheny, Kimberly F

AU - Domchek, Susan M

AU - Dorfling, Cecilia M

AU - Dörk, Thilo

AU - Dos-Santos-Silva, Isabel

AU - Dubois, Stéphane

AU - Dugué, Pierre-Antoine

AU - Dumont, Martine

AU - Dunning, Alison M

AU - Durcan, Lorraine

AU - Dwek, Miriam

AU - Dworniczak, Bernd

AU - Eccles, Diana

AU - Eeles, Ros

AU - Ehrencrona, Hans

AU - Eilber, Ursula

AU - Ejlertsen, Bent

AU - Ekici, Arif B

AU - Eliassen, A Heather

AU - Engel, Christoph

AU - Eriksson, Mikael

AU - Fachal, Laura

AU - Faivre, Laurence

AU - Fasching, Peter A

AU - Faust, Ulrike

AU - Figueroa, Jonine

AU - Flesch-Janys, Dieter

AU - Fletcher, Olivia

AU - Flyger, Henrik

AU - Foulkes, William D

AU - Friedman, Eitan

AU - Fritschi, Lin

AU - Frost, Debra

AU - Gabrielson, Marike

AU - Gaddam, Pragna

AU - Gammon, Marilie D

AU - Ganz, Patricia A

AU - Gapstur, Susan M

AU - Garber, Judy

AU - Garcia-Barberan, Vanesa

AU - García-Sáenz, José A

AU - Gaudet, Mia M

AU - Gauthier-Villars, Marion

AU - Gehrig, Andrea

AU - Georgoulias, Vassilios

AU - Gerdes, Anne-Marie

AU - Giles, Graham G

AU - Glendon, Gord

AU - Godwin, Andrew K

AU - Goldberg, Mark S

AU - Goldgar, David E

AU - González-Neira, Anna

AU - Goodfellow, Paul

AU - Greene, Mark H

AU - Alnæs, Grethe I Grenaker

AU - Grip, Mervi

AU - Gronwald, Jacek

AU - Grundy, Anne

AU - Gschwantler-Kaulich, Daphne

AU - Guénel, Pascal

AU - Guo, Qi

AU - Haeberle, Lothar

AU - Hahnen, Eric

AU - Haiman, Christopher A

AU - Håkansson, Niclas

AU - Hallberg, Emily

AU - Hamann, Ute

AU - Hamel, Nathalie

AU - Hankinson, Susan

AU - Hansen, Thomas V O

AU - Harrington, Patricia

AU - Hart, Steven N

AU - Hartikainen, Jaana M

AU - Healey, Catherine S

AU - Hein, Alexander

AU - Helbig, Sonja

AU - Henderson, Alex

AU - Heyworth, Jane

AU - Hicks, Belynda

AU - Hillemanns, Peter

AU - Hodgson, Shirley

AU - Hogervorst, Frans B

AU - Hollestelle, Antoinette

AU - Hooning, Maartje J

AU - Hoover, Bob

AU - Hopper, John L

AU - Hu, Chunling

AU - Huang, Guanmengqian

AU - Hulick, Peter J

AU - Humphreys, Keith

AU - Hunter, David J

AU - Imyanitov, Evgeny N

AU - Isaacs, Claudine

AU - Iwasaki, Motoki

AU - Izatt, Louise

AU - Jakubowska, Anna

AU - James, Paul

AU - Janavicius, Ramunas

AU - Janni, Wolfgang

AU - Jensen, Uffe Birk

AU - John, Esther M

AU - Johnson, Nichola

AU - Jones, Kristine

AU - Jones, Michael

AU - Jukkola-Vuorinen, Arja

AU - Kaaks, Rudolf

AU - Kabisch, Maria

AU - Kaczmarek, Katarzyna

AU - Kang, Daehee

AU - Kast, Karin

AU - Keeman, Renske

AU - Kerin, Michael J

AU - Kets, Carolien M

AU - Keupers, Machteld

AU - Khan, Sofia

AU - Khusnutdinova, Elza

AU - Kiiski, Johanna I

AU - Kim, Sung-Won

AU - Knight, Julia A

AU - Konstantopoulou, Irene

AU - Kosma, Veli-Matti

AU - Kristensen, Vessela N

AU - Kruse, Torben A

AU - Kwong, Ava

AU - Lænkholm, Anne-Vibeke

AU - Laitman, Yael

AU - Lalloo, Fiona

AU - Lambrechts, Diether

AU - Landsman, Keren

AU - Lasset, Christine

AU - Lazaro, Conxi

AU - Le Marchand, Loic

AU - Lecarpentier, Julie

AU - Lee, Andrew

AU - Lee, Eunjung

AU - Lee, Jong Won

AU - Lee, Min Hyuk

AU - Lejbkowicz, Flavio

AU - Lesueur, Fabienne

AU - Li, Jingmei

AU - Lilyquist, Jenna

AU - Lincoln, Anne

AU - Lindblom, Annika

AU - Lissowska, Jolanta

AU - Lo, Wing-Yee

AU - Loibl, Sibylle

AU - Long, Jirong

AU - Loud, Jennifer T

AU - Lubinski, Jan

AU - Luccarini, Craig

AU - Lush, Michael

AU - MacInnis, Robert J

AU - Maishman, Tom

AU - Makalic, Enes

AU - Kostovska, Ivana Maleva

AU - Malone, Kathleen E

AU - Manoukian, Siranoush

AU - Manson, JoAnn E

AU - Margolin, Sara

AU - Martens, John W M

AU - Martinez, Maria Elena

AU - Matsuo, Keitaro

AU - Mavroudis, Dimitrios

AU - Mazoyer, Sylvie

AU - McLean, Catriona

AU - Meijers-Heijboer, Hanne

AU - Menéndez, Primitiva

AU - Meyer, Jeffery

AU - Miao, Hui

AU - Miller, Austin

AU - Miller, Nicola

AU - Mitchell, Gillian

AU - Montagna, Marco

AU - Muir, Kenneth

AU - Mulligan, Anna Marie

AU - Mulot, Claire

AU - Nadesan, Sue

AU - Nathanson, Katherine L

AU - Neuhausen, Susan L

AU - Nevanlinna, Heli

AU - Nevelsteen, Ines

AU - Niederacher, Dieter

AU - Nielsen, Sune F

AU - Nordestgaard, Børge G

AU - Norman, Aaron

AU - Nussbaum, Robert L

AU - Olah, Edith

AU - Olopade, Olufunmilayo I

AU - Olson, Janet E

AU - Olswold, Curtis

AU - Ong, Kai-Ren

AU - Oosterwijk, Jan C

AU - Orr, Nick

AU - Osorio, Ana

AU - Pankratz, V Shane

AU - Papi, Laura

AU - Park-Simon, Tjoung-Won

AU - Paulsson-Karlsson, Ylva

AU - Lloyd, Rachel

AU - Pedersen, Inge Søkilde

AU - Peissel, Bernard

AU - Peixoto, Ana

AU - Perez, Jose I A

AU - Peterlongo, Paolo

AU - Peto, Julian

AU - Pfeiler, Georg

AU - Phelan, Catherine M

AU - Pinchev, Mila

AU - Plaseska-Karanfilska, Dijana

AU - Poppe, Bruce

AU - Porteous, Mary E

AU - Prentice, Ross

AU - Presneau, Nadege

AU - Prokofieva, Darya

AU - Pugh, Elizabeth

AU - Pujana, Miquel Angel

AU - Pylkäs, Katri

AU - Rack, Brigitte

AU - Radice, Paolo

AU - Rahman, Nazneen

AU - Rantala, Johanna

AU - Rappaport-Fuerhauser, Christine

AU - Rennert, Gad

AU - Rennert, Hedy S

AU - Rhenius, Valerie

AU - Rhiem, Kerstin

AU - Richardson, Andrea

AU - Rodriguez, Gustavo C

AU - Romero, Atocha

AU - Romm, Jane

AU - Rookus, Matti A

AU - Rudolph, Anja

AU - Ruediger, Thomas

AU - Saloustros, Emmanouil

AU - Sanders, Joyce

AU - Sandler, Dale P

AU - Sangrajrang, Suleeporn

AU - Sawyer, Elinor J

AU - Schmidt, Daniel F

AU - Schoemaker, Minouk J

AU - Schumacher, Fredrick

AU - Schürmann, Peter

AU - Schwentner, Lukas

AU - Scott, Christopher

AU - Scott, Rodney J

AU - Seal, Sheila

AU - Senter, Leigha

AU - Seynaeve, Caroline

AU - Shah, Mitul

AU - Sharma, Priyanka

AU - Shen, Chen-Yang

AU - Sheng, Xin

AU - Shimelis, Hermela

AU - Shrubsole, Martha J

AU - Shu, Xiao-Ou

AU - Side, Lucy E

AU - Singer, Christian F

AU - Sohn, Christof

AU - Southey, Melissa C

AU - Spinelli, John J

AU - Spurdle, Amanda B

AU - Stegmaier, Christa

AU - Stoppa-Lyonnet, Dominique

AU - Sukiennicki, Grzegorz

AU - Surowy, Harald

AU - Sutter, Christian

AU - Swerdlow, Anthony

AU - Szabo, Csilla I

AU - Tamimi, Rulla M

AU - Tan, Yen Y

AU - Taylor, Jack A

AU - Tejada, Maria-Isabel

AU - Tengström, Maria

AU - Teo, Soo H

AU - Terry, Mary B

AU - Tessier, Daniel C

AU - Teulé, Alex

AU - Thöne, Kathrin

AU - Thull, Darcy L

AU - Tibiletti, Maria Grazia

AU - Tihomirova, Laima

AU - Tischkowitz, Marc

AU - Toland, Amanda E

AU - Tollenaar, Rob A E M

AU - Tomlinson, Ian

AU - Tong, Ling

AU - Torres, Diana

AU - Tranchant, Martine

AU - Truong, Thérèse

AU - Tucker, Kathy

AU - Tung, Nadine

AU - Tyrer, Jonathan

AU - Ulmer, Hans-Ulrich

AU - Vachon, Celine

AU - van Asperen, Christi J

AU - Van Den Berg, David

AU - van den Ouweland, Ans M W

AU - van Rensburg, Elizabeth J

AU - Varesco, Liliana

AU - Varon-Mateeva, Raymonda

AU - Vega, Ana

AU - Viel, Alessandra

AU - Vijai, Joseph

AU - Vincent, Daniel

AU - Vollenweider, Jason

AU - Walker, Lisa

AU - Wang, Zhaoming

AU - Wang-Gohrke, Shan

AU - Wappenschmidt, Barbara

AU - Weinberg, Clarice R

AU - Weitzel, Jeffrey N

AU - Wendt, Camilla

AU - Wesseling, Jelle

AU - Whittemore, Alice S

AU - Wijnen, Juul T

AU - Willett, Walter

AU - Winqvist, Robert

AU - Wolk, Alicja

AU - Wu, Anna H

AU - Xia, Lucy

AU - Yang, Xiaohong R

AU - Yannoukakos, Drakoulis

AU - Zaffaroni, Daniela

AU - Zheng, Wei

AU - Zhu, Bin

AU - Ziogas, Argyrios

AU - Ziv, Elad

AU - Zorn, Kristin K

AU - Gago-Dominguez, Manuela

AU - Mannermaa, Arto

AU - Olsson, Håkan

AU - Teixeira, Manuel R

AU - Stone, Jennifer

AU - Offit, Kenneth

AU - Ottini, Laura

AU - Park, Sue K

AU - Thomassen, Mads

AU - Hall, Per

AU - Meindl, Alfons

AU - Schmutzler, Rita K

AU - Droit, Arnaud

AU - Bader, Gary D

AU - Pharoah, Paul D P

AU - Couch, Fergus J

AU - Easton, Douglas F

AU - Kraft, Peter

AU - Chenevix-Trench, Georgia

AU - García-Closas, Montserrat

AU - Schmidt, Marjanka K

AU - Antoniou, Antonis C

AU - Simard, Jacques

AU - ABCTB Investigators

PY - 2017/12

Y1 - 2017/12

N2 - Most common breast cancer susceptibility variants have been identified through genome-wide association studies (GWAS) of predominantly estrogen receptor (ER)-positive disease. We conducted a GWAS using 21,468 ER-negative cases and 100,594 controls combined with 18,908 BRCA1 mutation carriers (9,414 with breast cancer), all of European origin. We identified independent associations at P < 5 × 10-8 with ten variants at nine new loci. At P < 0.05, we replicated associations with 10 of 11 variants previously reported in ER-negative disease or BRCA1 mutation carrier GWAS and observed consistent associations with ER-negative disease for 105 susceptibility variants identified by other studies. These 125 variants explain approximately 16% of the familial risk of this breast cancer subtype. There was high genetic correlation (0.72) between risk of ER-negative breast cancer and breast cancer risk for BRCA1 mutation carriers. These findings may lead to improved risk prediction and inform further fine-mapping and functional work to better understand the biological basis of ER-negative breast cancer.

AB - Most common breast cancer susceptibility variants have been identified through genome-wide association studies (GWAS) of predominantly estrogen receptor (ER)-positive disease. We conducted a GWAS using 21,468 ER-negative cases and 100,594 controls combined with 18,908 BRCA1 mutation carriers (9,414 with breast cancer), all of European origin. We identified independent associations at P < 5 × 10-8 with ten variants at nine new loci. At P < 0.05, we replicated associations with 10 of 11 variants previously reported in ER-negative disease or BRCA1 mutation carrier GWAS and observed consistent associations with ER-negative disease for 105 susceptibility variants identified by other studies. These 125 variants explain approximately 16% of the familial risk of this breast cancer subtype. There was high genetic correlation (0.72) between risk of ER-negative breast cancer and breast cancer risk for BRCA1 mutation carriers. These findings may lead to improved risk prediction and inform further fine-mapping and functional work to better understand the biological basis of ER-negative breast cancer.

KW - BRCA1 Protein

KW - Breast Neoplasms

KW - European Continental Ancestry Group

KW - Female

KW - Genetic Predisposition to Disease

KW - Genome-Wide Association Study

KW - Heterozygote

KW - Humans

KW - Mutation

KW - Polymorphism, Single Nucleotide

KW - Receptors, Estrogen

KW - Risk Factors

KW - Journal Article

U2 - 10.1038/ng.3785

DO - 10.1038/ng.3785

M3 - SCORING: Journal article

C2 - 29058716

VL - 49

SP - 1767

EP - 1778

JO - NAT GENET

JF - NAT GENET

SN - 1061-4036

IS - 12

ER -