Association analysis identifies 65 new breast cancer risk loci

TY - JOUR

T1 - Association analysis identifies 65 new breast cancer risk loci

AU - Michailidou, Kyriaki

AU - Lindström, Sara

AU - Dennis, Joe

AU - Beesley, Jonathan

AU - Hui, Shirley

AU - Kar, Siddhartha

AU - Lemaçon, Audrey

AU - Soucy, Penny

AU - Glubb, Dylan

AU - Rostamianfar, Asha

AU - Bolla, Manjeet K

AU - Wang, Qin

AU - Tyrer, Jonathan

AU - Dicks, Ed

AU - Lee, Andrew

AU - Wang, Zhaoming

AU - Allen, Jamie

AU - Keeman, Renske

AU - Eilber, Ursula

AU - French, Juliet D

AU - Qing Chen, Xiao

AU - Fachal, Laura

AU - McCue, Karen

AU - McCart Reed, Amy E

AU - Ghoussaini, Maya

AU - Carroll, Jason S

AU - Jiang, Xia

AU - Finucane, Hilary

AU - Adams, Marcia

AU - Adank, Muriel A

AU - Ahsan, Habibul

AU - Aittomäki, Kristiina

AU - Anton-Culver, Hoda

AU - Antonenkova, Natalia N

AU - Arndt, Volker

AU - Aronson, Kristan J

AU - Arun, Banu

AU - Auer, Paul L

AU - Bacot, François

AU - Barrdahl, Myrto

AU - Baynes, Caroline

AU - Beckmann, Matthias W

AU - Behrens, Sabine

AU - Benitez, Javier

AU - Bermisheva, Marina

AU - Bernstein, Leslie

AU - Blomqvist, Carl

AU - Bogdanova, Natalia V

AU - Bojesen, Stig E

AU - Bonanni, Bernardo

AU - Børresen-Dale, Anne-Lise

AU - Brand, Judith S

AU - Brauch, Hiltrud

AU - Brennan, Paul

AU - Brenner, Hermann

AU - Brinton, Louise

AU - Broberg, Per

AU - Brock, Ian W

AU - Broeks, Annegien

AU - Brooks-Wilson, Angela

AU - Brucker, Sara Y

AU - Brüning, Thomas

AU - Burwinkel, Barbara

AU - Butterbach, Katja

AU - Cai, Qiuyin

AU - Cai, Hui

AU - Caldés, Trinidad

AU - Canzian, Federico

AU - Carracedo, Angel

AU - Carter, Brian D

AU - Castelao, Jose E

AU - Chan, Tsun L

AU - David Cheng, Ting-Yuan

AU - Seng Chia, Kee

AU - Choi, Ji-Yeob

AU - Christiansen, Hans

AU - Clarke, Christine L

AU - Collée, Margriet

AU - Conroy, Don M

AU - Cordina-Duverger, Emilie

AU - Cornelissen, Sten

AU - Cox, David G

AU - Cox, Angela

AU - Cross, Simon S

AU - Cunningham, Julie M

AU - Czene, Kamila

AU - Daly, Mary B

AU - Devilee, Peter

AU - Doheny, Kimberly F

AU - Dörk, Thilo

AU - Dos-Santos-Silva, Isabel

AU - Dumont, Martine

AU - Durcan, Lorraine

AU - Dwek, Miriam

AU - Eccles, Diana M

AU - Ekici, Arif B

AU - Eliassen, A Heather

AU - Ellberg, Carolina

AU - Elvira, Mingajeva

AU - Engel, Christoph

AU - Eriksson, Mikael

AU - Fasching, Peter A

AU - Figueroa, Jonine

AU - Flesch-Janys, Dieter

AU - Fletcher, Olivia

AU - Flyger, Henrik

AU - Fritschi, Lin

AU - Gaborieau, Valerie

AU - Gabrielson, Marike

AU - Gago-Dominguez, Manuela

AU - Gao, Yu-Tang

AU - Gapstur, Susan M

AU - García-Sáenz, José A

AU - Gaudet, Mia M

AU - Georgoulias, Vassilios

AU - Giles, Graham G

AU - Glendon, Gord

AU - Goldberg, Mark S

AU - Goldgar, David E

AU - González-Neira, Anna

AU - Grenaker Alnæs, Grethe I

AU - Grip, Mervi

AU - Gronwald, Jacek

AU - Grundy, Anne

AU - Guénel, Pascal

AU - Haeberle, Lothar

AU - Hahnen, Eric

AU - Haiman, Christopher A

AU - Håkansson, Niclas

AU - Hamann, Ute

AU - Hamel, Nathalie

AU - Hankinson, Susan

AU - Harrington, Patricia

AU - Hart, Steven N

AU - Hartikainen, Jaana M

AU - Hartman, Mikael

AU - Hein, Alexander

AU - Heyworth, Jane

AU - Hicks, Belynda

AU - Hillemanns, Peter

AU - Ho, Dona N

AU - Hollestelle, Antoinette

AU - Hooning, Maartje J

AU - Hoover, Robert N

AU - Hopper, John L

AU - Hou, Ming-Feng

AU - Hsiung, Chia-Ni

AU - Huang, Guanmengqian

AU - Humphreys, Keith

AU - Ishiguro, Junko

AU - Ito, Hidemi

AU - Iwasaki, Motoki

AU - Iwata, Hiroji

AU - Jakubowska, Anna

AU - Janni, Wolfgang

AU - John, Esther M

AU - Johnson, Nichola

AU - Jones, Kristine

AU - Jones, Michael

AU - Jukkola-Vuorinen, Arja

AU - Kaaks, Rudolf

AU - Kabisch, Maria

AU - Kaczmarek, Katarzyna

AU - Kang, Daehee

AU - Kasuga, Yoshio

AU - Kerin, Michael J

AU - Khan, Sofia

AU - Khusnutdinova, Elza

AU - Kiiski, Johanna I

AU - Kim, Sung-Won

AU - Knight, Julia A

AU - Kosma, Veli-Matti

AU - Kristensen, Vessela N

AU - Krüger, Ute

AU - Kwong, Ava

AU - Lambrechts, Diether

AU - Le Marchand, Loic

AU - Lee, Eunjung

AU - Lee, Min Hyuk

AU - Lee, Jong Won

AU - Neng Lee, Chuen

AU - Lejbkowicz, Flavio

AU - Li, Jingmei

AU - Lilyquist, Jenna

AU - Lindblom, Annika

AU - Lissowska, Jolanta

AU - Lo, Wing-Yee

AU - Loibl, Sibylle

AU - Long, Jirong

AU - Lophatananon, Artitaya

AU - Lubinski, Jan

AU - Luccarini, Craig

AU - Lux, Michael P

AU - Ma, Edmond S K

AU - MacInnis, Robert J

AU - Maishman, Tom

AU - Makalic, Enes

AU - Malone, Kathleen E

AU - Kostovska, Ivana Maleva

AU - Mannermaa, Arto

AU - Manoukian, Siranoush

AU - Manson, JoAnn E

AU - Margolin, Sara

AU - Mariapun, Shivaani

AU - Martinez, Maria Elena

AU - Matsuo, Keitaro

AU - Mavroudis, Dimitrios

AU - McKay, James

AU - McLean, Catriona

AU - Meijers-Heijboer, Hanne

AU - Meindl, Alfons

AU - Menéndez, Primitiva

AU - Menon, Usha

AU - Meyer, Jeffery

AU - Miao, Hui

AU - Miller, Nicola

AU - Taib, Nur Aishah Mohd

AU - Muir, Kenneth

AU - Mulligan, Anna Marie

AU - Mulot, Claire

AU - Neuhausen, Susan L

AU - Nevanlinna, Heli

AU - Neven, Patrick

AU - Nielsen, Sune F

AU - Noh, Dong-Young

AU - Nordestgaard, Børge G

AU - Norman, Aaron

AU - Olopade, Olufunmilayo I

AU - Olson, Janet E

AU - Olsson, Håkan

AU - Olswold, Curtis

AU - Orr, Nick

AU - Pankratz, V Shane

AU - Park, Sue K

AU - Park-Simon, Tjoung-Won

AU - Lloyd, Rachel

AU - Perez, Jose I A

AU - Peterlongo, Paolo

AU - Peto, Julian

AU - Phillips, Kelly-Anne

AU - Pinchev, Mila

AU - Plaseska-Karanfilska, Dijana

AU - Prentice, Ross

AU - Presneau, Nadege

AU - Prokofyeva, Darya

AU - Pugh, Elizabeth

AU - Pylkäs, Katri

AU - Rack, Brigitte

AU - Radice, Paolo

AU - Rahman, Nazneen

AU - Rennert, Gadi

AU - Rennert, Hedy S

AU - Rhenius, Valerie

AU - Romero, Atocha

AU - Romm, Jane

AU - Ruddy, Kathryn J

AU - Rüdiger, Thomas

AU - Rudolph, Anja

AU - Ruebner, Matthias

AU - Rutgers, Emiel J T

AU - Saloustros, Emmanouil

AU - Sandler, Dale P

AU - Sangrajrang, Suleeporn

AU - Sawyer, Elinor J

AU - Schmidt, Daniel F

AU - Schmutzler, Rita K

AU - Schneeweiss, Andreas

AU - Schoemaker, Minouk J

AU - Schumacher, Fredrick

AU - Schürmann, Peter

AU - Scott, Rodney J

AU - Scott, Christopher

AU - Seal, Sheila

AU - Seynaeve, Caroline

AU - Shah, Mitul

AU - Sharma, Priyanka

AU - Shen, Chen-Yang

AU - Sheng, Grace

AU - Sherman, Mark E

AU - Shrubsole, Martha J

AU - Shu, Xiao-Ou

AU - Smeets, Ann

AU - Sohn, Christof

AU - Southey, Melissa C

AU - Spinelli, John J

AU - Stegmaier, Christa

AU - Stewart-Brown, Sarah

AU - Stone, Jennifer

AU - Stram, Daniel O

AU - Surowy, Harald

AU - Swerdlow, Anthony

AU - Tamimi, Rulla

AU - Taylor, Jack A

AU - Tengström, Maria

AU - Teo, Soo H

AU - Beth Terry, Mary

AU - Tessier, Daniel C

AU - Thanasitthichai, Somchai

AU - Thöne, Kathrin

AU - Tollenaar, Rob A E M

AU - Tomlinson, Ian

AU - Tong, Ling

AU - Torres, Diana

AU - Truong, Thérèse

AU - Tseng, Chiu-Chen

AU - Tsugane, Shoichiro

AU - Ulmer, Hans-Ulrich

AU - Ursin, Giske

AU - Untch, Michael

AU - Vachon, Celine

AU - van Asperen, Christi J

AU - Van Den Berg, David

AU - van den Ouweland, Ans M W

AU - van der Kolk, Lizet

AU - van der Luijt, Rob B

AU - Vincent, Daniel

AU - Vollenweider, Jason

AU - Waisfisz, Quinten

AU - Wang-Gohrke, Shan

AU - Weinberg, Clarice R

AU - Wendt, Camilla

AU - Whittemore, Alice S

AU - Wildiers, Hans

AU - Willett, Walter

AU - Winqvist, Robert

AU - Wolk, Alicja

AU - Wu, Anna H

AU - Xia, Lucy

AU - Yamaji, Taiki

AU - Yang, Xiaohong R

AU - Har Yip, Cheng

AU - Yoo, Keun-Young

AU - Yu, Jyh-Cherng

AU - Zheng, Wei

AU - Zheng, Ying

AU - Zhu, Bin

AU - Ziogas, Argyrios

AU - Ziv, Elad

AU - Lakhani, Sunil R

AU - Antoniou, Antonis C

AU - Droit, Arnaud

AU - Andrulis, Irene L

AU - Amos, Christopher I

AU - Couch, Fergus J

AU - Pharoah, Paul D P

AU - Chang-Claude, Jenny

AU - Hall, Per

AU - Hunter, David J

AU - Milne, Roger L

AU - García-Closas, Montserrat

AU - Schmidt, Marjanka K

AU - Chanock, Stephen J

AU - Dunning, Alison M

AU - Edwards, Stacey L

AU - Bader, Gary D

AU - Chenevix-Trench, Georgia

AU - Simard, Jacques

AU - Kraft, Peter

AU - Easton, Douglas F

AU - NBCS Collaborators

PY - 2017/11/2

Y1 - 2017/11/2

N2 - Breast cancer risk is influenced by rare coding variants in susceptibility genes, such as BRCA1, and many common, mostly non-coding variants. However, much of the genetic contribution to breast cancer risk remains unknown. Here we report the results of a genome-wide association study of breast cancer in 122,977 cases and 105,974 controls of European ancestry and 14,068 cases and 13,104 controls of East Asian ancestry. We identified 65 new loci that are associated with overall breast cancer risk at P < 5 × 10-8. The majority of credible risk single-nucleotide polymorphisms in these loci fall in distal regulatory elements, and by integrating in silico data to predict target genes in breast cells at each locus, we demonstrate a strong overlap between candidate target genes and somatic driver genes in breast tumours. We also find that heritability of breast cancer due to all single-nucleotide polymorphisms in regulatory features was 2-5-fold enriched relative to the genome-wide average, with strong enrichment for particular transcription factor binding sites. These results provide further insight into genetic susceptibility to breast cancer and will improve the use of genetic risk scores for individualized screening and prevention.

AB - Breast cancer risk is influenced by rare coding variants in susceptibility genes, such as BRCA1, and many common, mostly non-coding variants. However, much of the genetic contribution to breast cancer risk remains unknown. Here we report the results of a genome-wide association study of breast cancer in 122,977 cases and 105,974 controls of European ancestry and 14,068 cases and 13,104 controls of East Asian ancestry. We identified 65 new loci that are associated with overall breast cancer risk at P < 5 × 10-8. The majority of credible risk single-nucleotide polymorphisms in these loci fall in distal regulatory elements, and by integrating in silico data to predict target genes in breast cells at each locus, we demonstrate a strong overlap between candidate target genes and somatic driver genes in breast tumours. We also find that heritability of breast cancer due to all single-nucleotide polymorphisms in regulatory features was 2-5-fold enriched relative to the genome-wide average, with strong enrichment for particular transcription factor binding sites. These results provide further insight into genetic susceptibility to breast cancer and will improve the use of genetic risk scores for individualized screening and prevention.

KW - Journal Article

U2 - 10.1038/nature24284

DO - 10.1038/nature24284

M3 - SCORING: Journal article

C2 - 29059683

VL - 551

SP - 92

EP - 94

JO - NATURE

JF - NATURE

SN - 0028-0836

IS - 7678

ER -