Breast cancer risk variants at 6q25 display different phenotype associations and regulate ESR1, RMND1 and CCDC170

TY - JOUR

T1 - Breast cancer risk variants at 6q25 display different phenotype associations and regulate ESR1, RMND1 and CCDC170

AU - Dunning, Alison M

AU - Michailidou, Kyriaki

AU - Kuchenbaecker, Karoline B

AU - Thompson, Deborah

AU - French, Juliet D

AU - Beesley, Jonathan

AU - Healey, Catherine S

AU - Kar, Siddhartha

AU - Pooley, Karen A

AU - Lopez-Knowles, Elena

AU - Dicks, Ed

AU - Barrowdale, Daniel

AU - Sinnott-Armstrong, Nicholas A

AU - Sallari, Richard C

AU - Hillman, Kristine M

AU - Kaufmann, Susanne

AU - Sivakumaran, Haran

AU - Marjaneh, Mahdi Moradi

AU - Lee, Jason S

AU - Hills, Margaret

AU - Jarosz, Monika

AU - Drury, Suzie

AU - Canisius, Sander

AU - Bolla, Manjeet K

AU - Dennis, Joe

AU - Wang, Qin

AU - Hopper, John L

AU - Southey, Melissa C

AU - Broeks, Annegien

AU - Schmidt, Marjanka K

AU - Lophatananon, Artitaya

AU - Muir, Kenneth

AU - Beckmann, Matthias W

AU - Fasching, Peter A

AU - Dos-Santos-Silva, Isabel

AU - Peto, Julian

AU - Sawyer, Elinor J

AU - Tomlinson, Ian

AU - Burwinkel, Barbara

AU - Marme, Frederik

AU - Guénel, Pascal

AU - Truong, Thérèse

AU - Bojesen, Stig E

AU - Flyger, Henrik

AU - González-Neira, Anna

AU - Perez, Jose I A

AU - Anton-Culver, Hoda

AU - Eunjung, Lee

AU - Arndt, Volker

AU - Brenner, Hermann

AU - Meindl, Alfons

AU - Schmutzler, Rita K

AU - Brauch, Hiltrud

AU - Hamann, Ute

AU - Aittomäki, Kristiina

AU - Blomqvist, Carl

AU - Ito, Hidemi

AU - Matsuo, Keitaro

AU - Bogdanova, Natasha

AU - Dörk, Thilo

AU - Lindblom, Annika

AU - Margolin, Sara

AU - Kosma, Veli-Matti

AU - Mannermaa, Arto

AU - Tseng, Chiu-Chen

AU - Wu, Anna H

AU - Lambrechts, Diether

AU - Wildiers, Hans

AU - Chang-Claude, Jenny

AU - Rudolph, Anja

AU - Peterlongo, Paolo

AU - Radice, Paolo

AU - Olson, Janet E

AU - Giles, Graham G

AU - Milne, Roger L

AU - Haiman, Christopher A

AU - Henderson, Brian E

AU - Goldberg, Mark S

AU - Teo, Soo H

AU - Yip, Cheng Har

AU - Nord, Silje

AU - Borresen-Dale, Anne-Lise

AU - Kristensen, Vessela

AU - Long, Jirong

AU - Zheng, Wei

AU - Pylkäs, Katri

AU - Winqvist, Robert

AU - Andrulis, Irene L

AU - Knight, Julia A

AU - Devilee, Peter

AU - Seynaeve, Caroline

AU - Figueroa, Jonine

AU - Sherman, Mark E

AU - Czene, Kamila

AU - Darabi, Hatef

AU - Hollestelle, Antoinette

AU - van den Ouweland, Ans M W

AU - Humphreys, Keith

AU - Gao, Yu-Tang

AU - Shu, Xiao-Ou

AU - Cox, Angela

AU - Cross, Simon S

AU - Blot, William

AU - Cai, Qiuyin

AU - Ghoussaini, Maya

AU - Perkins, Barbara J

AU - Shah, Mitul

AU - Choi, Ji-Yeob

AU - Kang, Daehee

AU - Lee, Soo Chin

AU - Hartman, Mikael

AU - Kabisch, Maria

AU - Torres, Diana

AU - Jakubowska, Anna

AU - Lubinski, Jan

AU - Brennan, Paul

AU - Sangrajrang, Suleeporn

AU - Ambrosone, Christine B

AU - Toland, Amanda E

AU - Shen, Chen-Yang

AU - Wu, Pei-Ei

AU - Orr, Nick

AU - Swerdlow, Anthony

AU - McGuffog, Lesley

AU - Healey, Sue

AU - Lee, Andrew

AU - Kapuscinski, Miroslav

AU - John, Esther M

AU - Terry, Mary Beth

AU - Daly, Mary B

AU - Goldgar, David E

AU - Buys, Saundra S

AU - Janavicius, Ramunas

AU - Tihomirova, Laima

AU - Tung, Nadine

AU - Dorfling, Cecilia M

AU - van Rensburg, Elizabeth J

AU - Neuhausen, Susan L

AU - Ejlertsen, Bent

AU - Hansen, Thomas V O

AU - Osorio, Ana

AU - Benitez, Javier

AU - Rando, Rachel

AU - Weitzel, Jeffrey N

AU - Bonanni, Bernardo

AU - Peissel, Bernard

AU - Manoukian, Siranoush

AU - Papi, Laura

AU - Ottini, Laura

AU - Konstantopoulou, Irene

AU - Apostolou, Paraskevi

AU - Garber, Judy

AU - Rashid, Muhammad Usman

AU - Frost, Debra

AU - Izatt, Louise

AU - Ellis, Steve

AU - Godwin, Andrew K

AU - Arnold, Norbert

AU - Niederacher, Dieter

AU - Rhiem, Kerstin

AU - Bogdanova-Markov, Nadja

AU - Sagne, Charlotte

AU - Stoppa-Lyonnet, Dominique

AU - Damiola, Francesca

AU - Sinilnikova, Olga M

AU - Mazoyer, Sylvie

AU - Isaacs, Claudine

AU - Claes, Kathleen B M

AU - De Leeneer, Kim

AU - de la Hoya, Miguel

AU - Caldes, Trinidad

AU - Nevanlinna, Heli

AU - Khan, Sofia

AU - Mensenkamp, Arjen R

AU - Hooning, Maartje J

AU - Rookus, Matti A

AU - Kwong, Ava

AU - Olah, Edith

AU - Diez, Orland

AU - Brunet, Joan

AU - Pujana, Miquel Angel

AU - Gronwald, Jacek

AU - Huzarski, Tomasz

AU - Barkardottir, Rosa B

AU - Laframboise, Rachel

AU - Soucy, Penny

AU - Montagna, Marco

AU - Agata, Simona

AU - Teixeira, Manuel R

AU - Park, Sue Kyung

AU - Lindor, Noralane

AU - Couch, Fergus J

AU - Tischkowitz, Marc

AU - Foretova, Lenka

AU - Vijai, Joseph

AU - Offit, Kenneth

AU - Singer, Christian F

AU - Rappaport, Christine

AU - Phelan, Catherine M

AU - Greene, Mark H

AU - Mai, Phuong L

AU - Rennert, Gad

AU - Imyanitov, Evgeny N

AU - Hulick, Peter J

AU - Phillips, Kelly-Anne

AU - Piedmonte, Marion

AU - Mulligan, Anna Marie

AU - Glendon, Gord

AU - Bojesen, Anders

AU - Thomassen, Mads

AU - Caligo, Maria A

AU - Yoon, Sook-Yee

AU - Friedman, Eitan

AU - Laitman, Yael

AU - Borg, Ake

AU - von Wachenfeldt, Anna

AU - Ehrencrona, Hans

AU - Rantala, Johanna

AU - Olopade, Olufunmilayo I

AU - Ganz, Patricia A

AU - Nussbaum, Robert L

AU - Gayther, Simon A

AU - Nathanson, Katherine L

AU - Domchek, Susan M

AU - Arun, Banu K

AU - Mitchell, Gillian

AU - Karlan, Beth Y

AU - Lester, Jenny

AU - Maskarinec, Gertraud

AU - Woolcott, Christy

AU - Scott, Christopher

AU - Stone, Jennifer

AU - Apicella, Carmel

AU - Tamimi, Rulla

AU - Luben, Robert

AU - Khaw, Kay-Tee

AU - Helland, Åslaug

AU - Haakensen, Vilde

AU - Dowsett, Mitch

AU - Pharoah, Paul D P

AU - Simard, Jacques

AU - Hall, Per

AU - García-Closas, Montserrat

AU - Vachon, Celine

AU - Chenevix-Trench, Georgia

AU - Antoniou, Antonis C

AU - Easton, Douglas F

AU - Edwards, Stacey L

AU - EMBRACE Collaborators

PY - 2016/4/1

Y1 - 2016/4/1

N2 - We analyzed 3,872 common genetic variants across the ESR1 locus (encoding estrogen receptor α) in 118,816 subjects from three international consortia. We found evidence for at least five independent causal variants, each associated with different phenotype sets, including estrogen receptor (ER(+) or ER(-)) and human ERBB2 (HER2(+) or HER2(-)) tumor subtypes, mammographic density and tumor grade. The best candidate causal variants for ER(-) tumors lie in four separate enhancer elements, and their risk alleles reduce expression of ESR1, RMND1 and CCDC170, whereas the risk alleles of the strongest candidates for the remaining independent causal variant disrupt a silencer element and putatively increase ESR1 and RMND1 expression.

AB - We analyzed 3,872 common genetic variants across the ESR1 locus (encoding estrogen receptor α) in 118,816 subjects from three international consortia. We found evidence for at least five independent causal variants, each associated with different phenotype sets, including estrogen receptor (ER(+) or ER(-)) and human ERBB2 (HER2(+) or HER2(-)) tumor subtypes, mammographic density and tumor grade. The best candidate causal variants for ER(-) tumors lie in four separate enhancer elements, and their risk alleles reduce expression of ESR1, RMND1 and CCDC170, whereas the risk alleles of the strongest candidates for the remaining independent causal variant disrupt a silencer element and putatively increase ESR1 and RMND1 expression.

U2 - 10.1038/ng.3521

DO - 10.1038/ng.3521

M3 - SCORING: Journal article

C2 - 26928228

VL - 48

SP - 374

EP - 386

JO - NAT GENET

JF - NAT GENET

SN - 1061-4036

IS - 4

ER -