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Vivian Pogenberg

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ORCID: 0000-0002-1021-6804
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Publikationen

  1. 2023

  2. The DNA-binding induced (de)AMPylation activity of a Coxiella burnetii Fic enzyme targets Histone H3

    Höpfner, D., Cichy, A., Pogenberg, V., Krisp, C., Mezouar, S., Bach, N. C., Grotheer, J., Zarza, S. M., Martinez, E., Bonazzi, M., Feige, M. J., Sieber, S. A., Schlüter, H. & Itzen, A., 06.11.2023, in: COMMUN BIOL. 6, 1, S. 1124

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  3. Acetylation reprograms MITF target selectivity and residence time

    Louphrasitthiphol, P., Loffreda, A., Pogenberg, V., Picaud, S., Schepsky, A., Friedrichsen, H., Zeng, Z., Lashgari, A., Thomas, B., Patton, E. E., Wilmanns, M., Filippakopoulos, P., Lambert, J-P., Steingrímsson, E., Mazza, D. & Goding, C. R., 28.09.2023, in: NAT COMMUN. 14, 1, S. 6051

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  4. Dephosphocholination by Legionella effector Lem3 functions through remodelling of the switch II region of Rab1b

    Kaspers, M. S., Pogenberg, V., Pett, C., Ernst, S., Ecker, F., Ochtrop, P., Groll, M., Hedberg, C. & Itzen, A., 19.04.2023, in: NAT COMMUN. 14, 1, S. 2245

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  5. 2021

  6. Specificity of AMPylation of the human chaperone BiP is mediated by TPR motifs of FICD

    Fauser, J., Gulen, B., Pogenberg, V., Pett, C., Pourjafar-Dehkordi, D., Krisp, C., Höpfner, D., König, G., Schlüter, H., Feige, M. J., Zacharias, M., Hedberg, C. & Itzen, A., 23.04.2021, in: NAT COMMUN. 12, 1, 2426.

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  7. 2020

  8. Tuning Transcription Factor Availability through Acetylation-Mediated Genomic Redistribution

    Louphrasitthiphol, P., Siddaway, R., Loffreda, A., Pogenberg, V., Friedrichsen, H., Schepsky, A., Zeng, Z., Lu, M., Strub, T., Freter, R., Lisle, R., Suer, E., Thomas, B., Schuster-Böckler, B., Filippakopoulos, P., Middleton, M., Lu, X., Patton, E. E., Davidson, I., Lambert, J-P., Wilmanns, M., Steingrímsson, E., Mazza, D. & Goding, C. R., 06.08.2020, in: MOL CELL. 79, 3, S. 472-487.e10

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  9. Identification of targets of AMPylating Fic enzymes by co-substrate-mediated covalent capture

    Gulen, B., Rosselin, M., Fauser, J., Albers, M. F., Pett, C., Krisp, C., Pogenberg, V., Schlüter, H., Hedberg, C. & Itzen, A., 08.2020, in: NAT CHEM. 12, 8, S. 732-739 8 S.

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  10. Mechanism of conditional partner selectivity in MITF/TFE family transcription factors with a conserved coiled coil stammer motif

    Pogenberg, V., Ballesteros-Álvarez, J., Schober, R., Sigvaldadóttir, I., Obarska-Kosinska, A., Milewski, M., Schindl, R., Ögmundsdóttir, M. H., Steingrímsson, E. & Wilmanns, M., 24.01.2020, in: NUCLEIC ACIDS RES. 48, 2, S. 934-948 15 S.

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  11. 2019

  12. An NAD+ Phosphorylase Toxin Triggers Mycobacterium tuberculosis Cell Death

    Freire, D. M., Gutierrez, C., Garza-Garcia, A., Grabowska, A. D., Sala, A. J., Ariyachaokun, K., Panikova, T., Beckham, K. S. H., Colom, A., Pogenberg, V., Cianci, M., Tuukkanen, A., Boudehen, Y-M., Peixoto, A., Botella, L., Svergun, D. I., Schnappinger, D., Schneider, T. R., Genevaux, P., de Carvalho, L. P. S., Wilmanns, M., Parret, A. H. A. & Neyrolles, O., 21.03.2019, in: MOL CELL. 73, 6, S. 1282-1291.e8

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  13. MITF has a central role in regulating starvation-induced autophagy in melanoma

    Möller, K., Sigurbjornsdottir, S., Arnthorsson, A. O., Pogenberg, V., Dilshat, R., Fock, V., Brynjolfsdottir, S. H., Bindesboll, C., Bessadottir, M., Ogmundsdottir, H. M., Simonsen, A., Larue, L., Wilmanns, M., Thorsson, V., Steingrimsson, E. & Ogmundsdottir, M. H., 31.01.2019, in: SCI REP-UK. 9, 1, S. 1055

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  14. Subcellular localization and stability of MITF are modulated by the bHLH-Zip domain

    Fock, V., Gudmundsson, S. R., Gunnlaugsson, H. O., Stefansson, J. A., Ionasz, V., Schepsky, A., Viarigi, J., Reynisson, I. E., Pogenberg, V., Wilmanns, M., Ogmundsdottir, M. H. & Steingrimsson, E., 01.2019, in: PIGM CELL MELANOMA R. 32, 1, S. 41-54 14 S.

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  15. 2018

  16. A short isoform of ATG7 fails to lipidate LC3/GABARAP

    Ogmundsdottir, H. M., Fock, V., Sooman, L., Pogenberg, V., Dilshat, R., Bindesbøll, C., Ogmundsdottir, H. M., Simonsen, A., Wilmanns, M. & Steingrimsson, E., 26.09.2018, in: SCI REP-UK. 8, 1, S. 14391

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  17. 2017

  18. Intermolecular base stacking mediates RNA-RNA interaction in a crystal structure of the RNA chaperone Hfq

    Schulz, E. C., Seiler, M., Zuliani, C., Voigt, F., Rybin, V., Pogenberg, V., Mücke, N., Wilmanns, M., Gibson, T. J. & Barabas, O., 29.08.2017, in: SCI REP-UK. 7, 1, S. 9903

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  19. Predicting the targeting of tail-anchored proteins to subcellular compartments in mammalian cells

    Costello, J. L., Castro, I. G., Camões, F., Schrader, T. A., McNeall, D., Yang, J., Giannopoulou, E-A., Gomes, S., Pogenberg, V., Bonekamp, N. A., Ribeiro, D., Wilmanns, M., Jedd, G., Islinger, M. & Schrader, M., 01.05.2017, in: J CELL SCI. 130, 9, S. 1675-1687 13 S.

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  20. 2014

  21. Crystal structure of the VapBC-15 complex from Mycobacterium tuberculosis reveals a two-metal ion dependent PIN-domain ribonuclease and a variable mode of toxin-antitoxin assembly

    Das, U., Pogenberg, V., Subhramanyam, U. K. T., Wilmanns, M., Gourinath, S. & Srinivasan, A., 12.2014, in: J STRUCT BIOL. 188, 3, S. 249-58 10 S.

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  22. Development of accessible peptidic tool compounds to study the phosphatase PTP1B in intact cells

    Meyer, C., Hoeger, B., Temmerman, K., Tatarek-Nossol, M., Pogenberg, V., Bernhagen, J., Wilmanns, M., Kapurniotu, A. & Köhn, M., 21.03.2014, in: ACS CHEM BIOL. 9, 3, S. 769-76 8 S.

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  23. Design of a bZip transcription factor with homo/heterodimer-induced DNA-binding preference

    Pogenberg, V., Consani Textor, L., Vanhille, L., Holton, S. J., Sieweke, M. H. & Wilmanns, M., 04.03.2014, in: STRUCTURE. 22, 3, S. 466-77 12 S.

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  24. A PEF/Y substrate recognition and signature motif plays a critical role in DAPK-related kinase activity

    Temmerman, K., de Diego, I., Pogenberg, V., Simon, B., Jonko, W., Li, X. & Wilmanns, M., 20.02.2014, in: CHEM BIOL. 21, 2, S. 264-73 10 S.

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  25. 2013

  26. MITF mutations associated with pigment deficiency syndromes and melanoma have different effects on protein function

    Grill, C., Bergsteinsdóttir, K., Ogmundsdóttir, M. H., Pogenberg, V., Schepsky, A., Wilmanns, M., Pingault, V. & Steingrímsson, E., 01.11.2013, in: HUM MOL GENET. 22, 21, S. 4357-67 11 S.

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  27. A unique Oct4 interface is crucial for reprogramming to pluripotency

    Esch, D., Vahokoski, J., Groves, M. R., Pogenberg, V., Cojocaru, V., Vom Bruch, H., Han, D., Drexler, H. C. A., Araúzo-Bravo, M. J., Ng, C. K. L., Jauch, R., Wilmanns, M. & Schöler, H. R., 03.2013, in: NAT CELL BIOL. 15, 3, S. 295-301 7 S.

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  28. 2012

  29. Restricted leucine zipper dimerization and specificity of DNA recognition of the melanocyte master regulator MITF

    Pogenberg, V., Ogmundsdóttir, M. H., Bergsteinsdóttir, K., Schepsky, A., Phung, B., Deineko, V., Milewski, M., Steingrímsson, E. & Wilmanns, M., 01.12.2012, in: GENE DEV. 26, 23, S. 2647-58 12 S.

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  30. 2011

  31. Structural insights into transcription complexes

    Berger, I., Blanco, A. G., Boelens, R., Cavarelli, J., Coll, M., Folkers, G. E., Nie, Y., Pogenberg, V., Schultz, P., Wilmanns, M., Moras, D. & Poterszman, A., 08.2011, in: J STRUCT BIOL. 175, 2, S. 135-46 12 S.

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  32. 2009

  33. Differential action on coregulator interaction defines inverse retinoid agonists and neutral antagonists

    Germain, P., Gaudon, C., Pogenberg, V., Sanglier, S., Van Dorsselaer, A., Royer, C. A., Lazar, M. A., Bourguet, W. & Gronemeyer, H., 29.05.2009, in: CHEM BIOL. 16, 5, S. 479-89 11 S.

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  34. 2005

  35. A high-throughput fluorescence polarization assay specific to the CD4 binding site of HIV-1 glycoproteins based on a fluorescein-labelled CD4 mimic

    Stricher, F., Martin, L., Barthe, P., Pogenberg, V., Mechulam, A., Menez, A., Roumestand, C., Veas, F., Royer, C. & Vita, C., 15.08.2005, in: BIOCHEM J. 390, Pt 1, S. 29-39 11 S.

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  36. Characterization of the interaction between retinoic acid receptor/retinoid X receptor (RAR/RXR) heterodimers and transcriptional coactivators through structural and fluorescence anisotropy studies

    Pogenberg, V., Guichou, J-F., Vivat-Hannah, V., Kammerer, S., Pérez, E., Germain, P., de Lera, A. R., Gronemeyer, H., Royer, C. A. & Bourguet, W., 14.01.2005, in: J BIOL CHEM. 280, 2, S. 1625-33 9 S.

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  37. 2004

  38. Purification and crystallization of the heterodimeric complex of RARbeta and RXRalpha ligand-binding domains in the active conformation

    Pogenberg, V., Guichou, J. F. & Bourguet, W., 06.2004, in: ACTA CRYSTALLOGR D. 60, Pt 6, S. 1170-2 3 S.

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  39. 2001

  40. Identification and localization of a thylakoid-bound carbonic anhydrase from the green algae Tetraedron minimum (Chlorophyta) and Chlamydomonas noctigama (Chlorophyta)

    van Hunnik, E., Livne, A., Pogenberg, V., Spijkerman, E., van den Ende, H., Mendoza, E. G., Sültemeyer, D. & de Leeuw, J. W., 02.2001, in: PLANTA. 212, 3, S. 454-9 6 S.

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