01KU1505B BMBF "ICGC-Data Mining"

BMBF: Förderkennzeichen 01KU1505B

Das langfristige Ziel im Teilprojekt 2 - Mining Prostatakarzinom - ist es, mit der detaillierten bioinformatischen Auswertung der erhobenen Genom- und Epigenomdatensätze neuartige, klinisch anwendbare molekulare Test-Verfahren zu entwickeln, um zuverlässig zwischen aggressiven und milden Prostatakarzinom-Verläufen unterscheiden zu können. In Hamburg werden im TP 2 die Arbeitspakete AP1 und AP5 bearbeitet. Im AP1 erfolgt die Projektkoordination. Im AP5 werden distinkte molekulare Muster innerhalb des Datensatzes identifiziert und mit den molekularen Markern der TMA-Datenbank (komplettes molekulares Spektrum) verglichen. Ziel ist es, durch Auswertung der ICGC-Daten Tumoren mit identischen oder maximal ähnlichen Markerprofilen in den TMA-Datensätzen zu identifizieren. Es wird erwartet, durch diese Analysen die Vorteile der Sequenzierungs-Datensätze mit denen der TMA-Datensätze verknüpfen zu können, um die biologische und klinische Relevanz der bisher aufgedeckten molekularen Veränderungen bestimmen zu können.