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Jiabin Huang

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Publikationen

  1. 2024

  2. Merkel cell polyomavirus small tumor antigen contributes to immune evasion by interfering with type I interferon signaling

    Ohnezeit, D., Huang, J., Westerkamp, U., Brinschwitz, V., Schmidt, C., Günther, T., Czech-Sioli, M., Weißelberg, S., Schlemeyer, T., Nakel, J., Mai, J., Schreiner, S., Schneider, C., Friedel, C. C., Schwanke, H., Brinkmann, M. M., Grundhoff, A. & Fischer, N., 08.2024, in: PLOS PATHOG. 20, 8, e1012426.

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  3. Drug repurposing screen identifies lonafarnib as respiratory syncytial virus fusion protein inhibitor

    Sake, S. M., Zhang, X., Rajak, M. K., Urbanek-Quaing, M., Carpentier, A., Gunesch, A. P., Grethe, C., Matthaei, A., Rückert, J., Galloux, M., Larcher, T., Le Goffic, R., Hontonnou, F., Chatterjee, A. K., Johnson, K., Morwood, K., Rox, K., Elgaher, W. A. M., Huang, J., Wetzke, M., Hansen, G., Fischer, N., Eléouët, J-F., Rameix-Welti, M-A., Hirsch, A. K. H., Herold, E., Empting, M., Lauber, C., Krey, T., Haid, S. & Pietschmann, T., 08.02.2024, in: NAT COMMUN. 15, 1, S. 1173

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  4. Pharmacokinetic/pharmacodynamic evaluation of tigecycline dosing in a hollow fiber infection model against clinical bla-KPC producing Klebsiella Pneumoniae isolates

    Amann, L. F., Broeker, A., Riedner, M., Rohde, H., Huang, J., Nordmann, P., Decousser, J-W. & Wicha, S. G., 02.2024, in: DIAGN MICR INFEC DIS. 108, 2, S. 116153 116153.

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  5. 2023

  6. A bacterial effector protein promotes nuclear translocation of Stat3 to induce IL-10.

    Berneking, L., Bekere, I., Rob, S., Schnapp, M., Huang, J., Ruckdeschel, K. & Aepfelbacher, M., 12.2023, in: EUR J CELL BIOL. 102, 4, S. 151364 151364.

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  7. Rapid Development of cefiderocol resistance in a carbapenem-resistant Pseudomonas aeruginosa isolate associated with mutations in the pyoverdine biosynthesis pathway

    Brakert, L., Berneking, L., Both, A., Berinson, B., Huang, J., Aepfelbacher, M., Wolschke, C., Wichmann, D. & Rohde, H., 09.2023, in: J GLOB ANTIMICROB RE. 34, S. 59-62 4 S.

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  8. First case of bloodstream infection caused by Mixta hanseatica sp. nov., a novel species within the Mixta genus of the Erwiniaceae family

    Both, A., Huang, J., Wenzel, P., Aepfelbacher, M., Rohde, H., Christner, M. & Hentschke, M., 06.2023, in: NEW MICROB NEW INFEC. 53, S. 101117 101117.

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  9. IKK1 aggravates ischemia-reperfusion kidney injury by promoting the differentiation of effector T cells

    Song, N., Xu, Y., Paust, H-J., Panzer, U., Noriega, M. D. L. M., Guo, L., Renne, T., Huang, J., Meng, X., Zhao, M. & Thaiss, F., 19.04.2023, in: CELL MOL LIFE SCI. 80, 5, S. 125

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  10. Genomics of Invasive Cutibacterium acnes Isolates from Deep-Seated Infections

    Both, A., Huang, J., Hentschke, M., Tobys, D., Christner, M., Klatte, T. O., Seifert, H., Aepfelbacher, M. & Rohde, H., 28.03.2023, in: MICROBIOL SPECTR. 11, 2, S. e0474022

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  11. 2022

  12. Respiratory Syncytial Virus Two-Step Infection Screen Reveals Inhibitors of Early and Late Life Cycle Stages

    Sake, S. M., Kosch, C., Blockus, S., Haid, S., Gunesch, A. P., Zhang, X., Friesland, M., Trummer, S. B., Grethe, C., Kühnel, A., Rückert, J., Duprex, W. P., Huang, J., Rameix-Welti, M-A., Empting, M., Fischer, N., Hirsch, A. K. H., Schulz, T. F. & Pietschmann, T., 20.12.2022, in: ANTIMICROB AGENTS CH. 66, 12, e0103222.

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  13. A pharmacokinetic-pharmacodynamic (PKPD) model-based analysis of tedizolid against enterococci using the hollow-fibre infection model

    Iqbal, K., Rohde, H., Huang, J., Tikiso, T., Amann, L., Zeitlinger, M. & Wicha, S., 25.08.2022, in: J ANTIMICROB CHEMOTH. 77, 9, S. 2470–2478 9 S.

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  14. Target capture sequencing reveals a monoclonal outbreak of respiratory syncytial virus B infections among adult hematologic patients

    Baier, C., Huang, J., Reumann, K., Indenbirken, D., Thol, F., Koenecke, C., Ebadi, E., Heim, A., Bange, F-C., Haid, S., Pietschmann, T. & Fischer, N., 21.06.2022, in: ANTIMICROB RESIST IN. 11, 1, S. 88 88.

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  15. Mechanisms of CD8+ T cell failure in chronic hepatitis E virus infection

    Kemming, J., Gundlach, S., Panning, M., Huzly, D., Huang, J., Lütgehetmann, M., Fischer, N. & Neumann-Haefelin, C., 16.05.2022, in: J HEPATOL. 77, 4, S. 978-990 13 S.

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  16. Population dynamics in colonizing vancomycin-resistant Enterococcus faecium isolated from immunosuppressed patients

    Both, A., Kruse, F., Mirwald, N., Franke, G., Christner, M., Huang, J., Hansen, J. L., Kröger, N., Berneking, L., Lellek, H., Aepfelbacher, M. & Rohde, H., 03.2022, in: J GLOB ANTIMICROB RE. 28, S. 267-273 7 S.

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  17. 2021

  18. Yersinia remodels epigenetic histone modifications in human macrophages

    Bekere, I., Huang, J., Schnapp, M., Rudolph, M., Berneking, L., Ruckdeschel, K., Grundhoff, A., Günther, T., Fischer, N. & Aepfelbacher, M., 11.2021, in: PLOS PATHOG. 17, 11, e1010074.

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  19. Complete genome sequencing and molecular characterization of SARS-COV-2 from COVID-19 cases in Alborz province in Iran

    Kaffashi, A., Huang, J., Bairami, A., Fallah Mehrabadi, M. H., Yaslianifard, S., Bashashati, M., Banihashemi, S. R., Soleimanifar, F., Lotfi, M., Taghizadeh, M., Soleimani, A., Khorasani, A., Moshiri, F. & Mozhgani, S-H., 17.09.2021, in: HELIYON. 7, 9, e08027.

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  20. Vertically transferred maternal immune cells promote neonatal immunity against early life infections

    Stelzer, I., Urbschat, C., Schepanski, S., Thiele, K., Triviai, I., Wieczorek, A., Alawi, M., Ohnezeit, D., Kottlau, J., Huang, J., Fischer, N., Mittrücker, H-W., Solano, M. E., Fehse, B., Diemert, A., Stahl, F. & Arck, P., 04.08.2021, in: NAT COMMUN. 12, 1, S. 4706

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  21. Benchmark of thirteen bioinformatic pipelines for metagenomic virus diagnostics using datasets from clinical samples

    de Vries, J. J. C., Brown, J. R., Fischer, N., Sidorov, I. A., Morfopoulou, S., Huang, J., Munnink, B. B. O., Sayiner, A., Bulgurcu, A., Rodriguez, C., Gricourt, G., Keyaerts, E., Beller, L., Bachofen, C., Kubacki, J., Samuel, C., Florian, L., Dennis, S., Beer, M., Hoeper, D., Huber, M., Kufner, V., Zaheri, M., Lebrand, A., Papa, A., van Boheemen, S., Kroes, A. C. M., Breuer, J., Lopez-Labrador, F. X., Claas, E. C. J. & ESCV Network on Next-Generation Sequencing, 08.2021, in: J CLIN VIROL. 141, 104908.

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  22. An inter‑laboratory study to investigate the impact of the bioinformatics component on microbiome analysis using mock communities

    O’Sullivan, D., Doyle, R., Temisak, S., Redshaw, N., Whale, A., Logan, G., Huang, J., Fischer, N., Amos, G., Preston, M., Marchesi, J., Wagner, J., Parkhill, J., Motro, Y., Denise, H., Finn, R., Kay, G., O'Grady, J., Ransom-Jones, E., Wu, H., Laing, E., Benavente, E., Phelan, J., Clark, T., Moran-Gilad, J. & Huggett, J., 19.05.2021, in: SCI REP-UK. 11, 1, S. 10590

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  23. Simulation of Folding Kinetics for Aligned RNAs

    Huang, J. & Voß, B., 26.02.2021, in: GENES-BASEL. 12, 3, 347.

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  24. Distinct clonal lineages and within-host diversification shape invasive Staphylococcus epidermidis populations

    Both, A., Huang, J., Qi, M., Lausmann, C., Weißelberg, S., Büttner, H., Lezius, S., Failla, A. V., Christner, M., Stegger, M., Gehrke, T., Baig, S., Citak, M., Alawi, M., Aepfelbacher, M. & Rohde, H., 02.2021, in: PLOS PATHOG. 17, 2, S. e1009304

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  25. SARS Coronavirus-2 variant tracing within the first Coronavirus Disease 19 clusters in northern Germany

    Pfefferle, S., Günther, T., Kobbe, R., Czech-Sioli, M., Nörz, D., Santer, R., Oh, J., Kluge, S., Oestereich, L., Peldschus, K., Indenbirken, D., Huang, J., Grundhoff, A., Aepfelbacher, M., Knobloch, J. K., Lütgehetmann, M. & Fischer, N., 01.2021, in: CLIN MICROBIOL INFEC. 27, 1, S. 130.e5-130.e8

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  26. Strong Replication Interference Between Hepatitis Delta Viruses in Human Liver Chimeric Mice

    Giersch, K., Hermanussen, L., Volz, T., Volmari, A., Allweiss, L., Sureau, C., Casey, J., Huang, J., Fischer, N., Lütgehetmann, M. & Dandri, M., 2021, in: FRONT MICROBIOL. 12, S. 671466

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  27. 2020

  28. Complete Genome Sequence of a SARS-CoV-2 Strain Isolated in Northern Germany

    Pfefferle, S., Huang, J., Nörz, D., Indenbirken, D., Lütgehetmann, M., Oestereich, L., Günther, T., Grundhoff, A., Aepfelbacher, M. & Fischer, N., 04.06.2020, in: MICROBIOL RESOUR ANN. 9, 23

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  29. 2019

  30. Changes in the composition of the upper respiratory tract microbial community in granulomatosis with polyangiitis

    Lamprecht, P., Fischer, N., Huang, J., Burkhardt, L., Lütgehetmann, M., Arndt, F., Rolfs, I., Kerstein, A., Iking-Konert, C. & Laudien, M., 02.2019, in: J AUTOIMMUN. 97, S. 29-39 11 S.

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  31. T-lymphocyte-specific knockout of IKK-2 or NEMO induces T17 cells in an experimental nephrotoxic nephritis mouse model

    Guo, L., Huang, J., Chen, M., Piotrowski, E., Song, N., Zahner, G., Paust, H-J., Alawi, M., Geffers, R. & Thaiss, F., 02.2019, in: FASEB J. 33, 2, S. 2359-2371 13 S.

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  32. 2017

  33. Emergence of ceftazidime/avibactam non-susceptibility in an MDR Klebsiella pneumoniae isolate

    Both, A., Büttner, H., Huang, J., Perbandt, M., Belmar Campos, C., Christner, M., Maurer, F. P., Kluge, S., König, C., Aepfelbacher, M., Wichmann, D. & Rohde, H., 01.09.2017, in: J ANTIMICROB CHEMOTH. 72, 9, S. 2483-2488

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  34. 2016

  35. First report of Escherichia coli co-producing NDM-1 and OXA-232

    Both, A., Huang, J., Kaase, M., Hezel, J., Wertheimer, D., Fenner, I., Günther, T., Grundhoff, A., Büttner, H., Aepfelbacher, M., Rohde, H. & Hentschke, M., 12.2016, in: DIAGN MICR INFEC DIS. 86, 4, S. 437-438 2 S.

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  36. Autoimmune Renal Disease Is Exacerbated by S1P-Receptor-1-Dependent Intestinal Th17 Cell Migration to the Kidney

    Krebs, C. F., Paust, H-J., Krohn, S., Koyro, T., Brix, S. R., Riedel, J-H., Bartsch, P., Wiech, T., Meyer-Schwesinger, C., Huang, J., Fischer, N., Busch, C. P., Mittrücker, H-W., Steinhoff, U., Stockinger, B., Perez, L. G., Wenzel, U. O., Janneck, M., Steinmetz, O. M., Gagliani, N., Stahl, R. A. K., Huber, S., Turner, J-E. & Panzer, U., 15.11.2016, in: IMMUNITY. 45, 5, S. 1078-1092 15 S.

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  37. 2014

  38. Analysing RNA-kinetics based on folding space abstraction

    Huang, J. & Voß, B., 2014, in: BMC BIOINFORMATICS. 15, 1, S. 60

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  39. RNA folding space analysis using structure abstraction

    Huang, J., 2014, 119 S.

    Publikationen: Buch/Bericht › Dissertationsschrift

  40. 2012

  41. Reducing the search space in RNA helix based folding. European Conference on Computational Biology

    Huang, J. & Voß, B., 09.09.2012, European Conference on Computational Biology (ECCB) 2012.

    Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › Konferenzbeitrag - Poster › Forschung

  42. Abstract folding space analysis based on helices

    Huang, J., Backofen, R. & Voß, B., 2012, in: RNA. 18, 12, S. 2135-2147

    Publikationen: SCORING: Beitrag in Fachzeitschrift/Zeitung › SCORING: Zeitschriftenaufsatz › Forschung › Begutachtung

  43. 2011

  44. RNAHeliCes -- Folding space analysis based on position aware structure abstraction

    Huang, J. & Voß, B., 2011, In Proceedings of the German Conference on Bioinformatics 2011. S. RT--31

    Publikationen: SCORING: Beitrag in Buch/Sammelwerk › Konferenzbeitrag - Aufsatz in Konferenzband › Forschung › Begutachtung